Nella sua bacheca figurano 3 campionati inglesi, 6Coppe d'Inghilterra e unaCoppa di Lega inglese. Il Blackburn è inoltre l'unica squadra che ha vinto tre Coppe d'Inghilterra consecutive.
Il Blackburn Rovers Football Club fu fondato al Leger Hotel diBlackburn il 5 novembre 1875. L'incontro decisivo per la costituzione della squadra fu organizzato da due giovani, John Lewis e Arthur Constantine, già allievi della Shrewsbury School. La prima partita giocata dal Blackburn si tenne a Church, villaggio delLancashire, il 18 dicembre 1875 e terminò con il risultato di 1-1.
Il 28 settembre 1878 il Blackburn divenne uno dei 23 membri fondatori della Lancashire Football Association. Il 1º novembre 1879 esordì inFA Cup, giocando contro il Tyne A.F.C. e battendolo per 5-1, prima di uscire al terzo turno a causa di una pesante sconfitta contro ilNottingham Forest (6-0).
Il 29 marzo 1884 il club vinse per la prima volta laFA Cup battendo in finale gli scozzesi delQueen's Park per 2-1. Si ripeté l'anno successivo, vincendo per 2-0 contro i medesimi rivali e mettendo così in bacheca la seconda coppa nazionale, e nel1886, battendo per 2-0 nella ripetizione della finale ilWest Bromwich. Grazie ai tre successi consecutivi in FA Cup il club fu insignito di uno speciale trofeo d'argento.
Nel 1885-1886 il Blackburn passò al professionismo e nel 1888 fu tra i fondatori dellaFootball League.
Per lungo tempo rappresentò una delle squadre di riferimento del calcio britannico. Fu infatti la prima formazione di alto livello ad adottare la tattica dellapiramide di Cambridge: uno schema 2-3-5 che visualizzava sul campo una piramide (o meglio un triangolo) rovesciata, avente la sua base nella linea dei cinque attaccanti affiancati e il vertice nel portiere. Questo modulo, che portò il club a vincere, oltre ai trofei già citati, due altreCoppe d'Inghilterra neglianni Novanta dell'Ottocento (1889-1890, con il 6-1 in finale contro loSheffield Weds, e 1890-1891, con il 3-1 in finale contro ilNotts County), divenne universalmente noto e fu adottato e imitato in tutto il mondo sino all'avvento delsistema, neglianni trenta delNovecento.
Nei primi anni delXX secolo la squadra visse un periodo buio, ma i risultati migliorarono gradualmente. Nel 1905 aEwood Park fu aggiunta la copertura della Tribuna Darwen per un costo di 1680 sterline e il giorno diCapodanno del 1907 fu inaugurata la Tribuna Nuttall.
Nei primi decenni del Novecento il Blackburn Rovers era ancora una squadra egemone nel campionato inglese. Campione di First Division nel 1911-1912 e nel 1913-1914, vinse nuovamente la FA Cup nel1927-1928, battendo per 3-1 in finale 3-1 l'Huddersfield Town, ma quello sarebbe rimasto l'unico trofeo importante di lì a quasi 70 anni.
Negli anni successivi il Blackburn conobbe vicissitudini sportive che la condussero a frequentare le serie minori: dal1966 al1992 la squadra navigò tra la seconda e la terza divisione inglese.
Nel 1963-1964 una memorabile vittoria per 8-2 in casa delWest Ham Utd nel giorno di Santo Stefano del 1963, che issò i Rovers in vetta alla classifica del campionato, alimentò fugaci speranze di ritorno alla gloria, subito spente a causa di una crisi di risultati che fece precipitare il club in posizioni più basse della graduatoria, per poi chiudere al settimo posto. Nel 1966 il Blackburn retrocesse in seconda serie, iniziando un periodo di 26 anni di assenza dal massimo livello del calcio inglese.
Negli anni '70 il Blackburn navigò tra seconda e terza divisione. Nel 1975 si aggiudicò il titolo di terza divisione e tornò in serie cadetta, ma non riuscì mai a inserirsi nella lotta per la promozione in massima serie. La situazione addirittura peggiorò, fino alla nuova retrocessione in terza serie del 1979.
La società fu acquistata alla fine deglianni ottanta dal locale magnate dell'acciaio Jack Walker, che investì ingenti somme nel miglioramento del club. Dopo la promozione del 1980, il Blackburn ha sempre militato nelle prime due divisioni del campionato. Il club sfiorò il ritorno in massima serie nel 1981, penalizzato solo dalladifferenza reti, e nel 1985.
Gli sforzi di Walker furono premiati con la promozione inPremier League per la stagione1991-1992.
Nelle prime due stagioni in massima serie, sotto la guida dell'ex tecnico scozzese delLiverpoolKenny Dalglish, la squadra si classificò al 4º e al 2º posto, per poi giungere alla conquista del titolo nazionale nel1994-1995 dopo 82 anni senza trofei vinti. L'incontro decisivo si giocò adAnfield Road contro ilLiverpool il 14 maggio1995. Nonostante la sconfitta per 2-1, iRovers misero in bacheca il titolo grazie al pareggio delManchester United, diretta rivale, in casa contro ilWest Ham United. In quella stagione il cannoniereAlan Shearer fu capace di mettere a segno 34 reti in 42 partite.
Da quell'anno i Rovers non sono più riusciti a ripetersi e nel1998-1999, dopo appena quattro anni dalla vittoria del campionato, la squadra non riuscì ad evitare la retrocessione inFirst Division.
Jack Walker morì all'inizio della stagione 2000-2001. Il club dedicò al suo presidente il ritorno in Premier League, che giunse al termine di quella stagione sotto la guida diGraeme Souness, in carica dal marzo 2000. Nel 2002 i Rovers si aggiudicarono la primaCoppa di Lega inglese della loro storia, battendo ilTottenham Hotspur per 2-1 alMillennium Stadium diCardiff. La vittoria valse la qualificazione inCoppa UEFA, dove il Blackburn fu eliminato dalCeltic poi finalista perdente della manifestazione. L'annata seguente si concluse con il sesto posto e una nuova qualificazione in UEFA.
Ceduti gli idoliDamien Duff eDavid Dunn, sostituiti dall'ala australianaBrett Emerton e dal centrocampistaSteven Reid, il Blackburn si avviò a disputare un campionato 2003-2004 senza grandi speranze di ripetere l'annata appena trascorsa, ma gli arrivi diLorenzo Amoruso eBarry Ferguson, difensori deiRangers, suscitarono qualche aspettativa tra i tifosi. Ciononostante la squadra iniziò a inanellare una serie di sconfitte casalinghe che ne misero in pericolo la permanenza in massima divisione. Grazie a 4 vittorie nelle ultime 6 partite la salvezza fu conquistata con il 15º posto finale, replicato l'anno dopo sotto la guida diMark Hughes, già calciatore del Blackburn qualche anno prima. Nel 2005-2006 il club, rinforzatosi con l'acquisto dell'attaccante galleseCraig Bellamy, conseguì un brillante sesto posto in Premier, qualificandosi in Coppa UEFA per la terza volta in cinque anni, per la sesta volta dal 1994.
Nell'estate 2006 il partente Bellamy fu sostituito dalla punta delPortoBenni McCarthy. L'annata vide i Rovers giungere in semifinale diFA Cup, dove furono sconfitti dalChelsea dopo itempi supplementari. Il Blackburn aveva eliminato ancheArsenal eManchester City. In campionato la squadra di Hughes giunse decima, con McCarthy autore di ben 18 gol. La compagine di Blackburn ebbe accesso all'Intertoto, competizione che sfruttò al meglio, dato che la vinse e si qualificò in Coppa UEFA. Nelcampionato 2007-2008 i Rovers, pur avendo investito negli acquisti diRoque Santa Cruz,Maceo Rigters eGunnar Nielsen, non andarono oltre il 7º posto, mancando la qualificazione in Intertoto. In Coppa UEFA furono eliminati dai greci delLarissa e in FA Cup dalCoventry City. Hughes lasciò l'incarico a maggio e un mese dopo fu rimpiazzato daPaul Ince. Ceduto il portiereBrad Friedel, il club ingaggiò al suo postoPaul Robinson. L'inizio di campionato fu positivo, ma a dicembre Ince fu sollevato dall'incarico dopo una striscia di undici partite senza vittorie. Il club mise sotto contrattoSam Allardyce, che condusse la squadra alla salvezza (15º posto).
Il 19 novembre2010 il gruppo indianoV H Group (Venkateshwara Hatcheries Group) dei fratelliBalaji eVenkatesh Rao rileva il Blackburn Rovers con il nome di Venky's London Limited, formalizza l'acquisto della squadra. L'operazione viene conclusa con un versamento di 54 milioni di sterline (86,3 milioni di euro). Di questi, 20 milioni di sterline sono per l'acquisto delle azioni del club mentre il resto andranno a ripianare i debiti e a rafforzare la squadra. La nuova proprietà rimpiazza l'allenatore Sam Allardyce conSteve Kean.
Il 7 maggio 2012 il club retrocede inChampionship con una giornata di anticipo rispetto alla fine del torneo, ponendo fine a 11 anni di militanza ininterrotta nella massima serie inglese.
Dopo cinque anni di militanza nella seconda serie, il 7 maggio 2017, all'ultimo turno del campionato 2016-2017, retrocede inFootball League One, il terzo livello del campionato inglese, fatto che non avveniva da 37 anni. Dopo una sola stagione nella terza serie del calcio inglese, il club ottiene la promozione in Championship grazie al secondo posto in classifica. Nelle stagioni seguenti la squadra si stabilizza a centro classifica, ottenendo sempre salvezze tranquille.
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