La sede dell'AIEA si trova aVienna, inAustria, presso l'Internationale Zentrum Wien. L'AIEA ha degli uffici di collegamento aToronto (Canada),Ginevra (Svizzera),New York (Stati Uniti) eTokyo (Giappone). Il laboratorio centrale si trova a circa 30 km da Vienna, ricerche vengono fatte anche nei laboratori delPrincipato di Monaco eTrieste.
I Paesi membri sono 171 (aggiornato a febbraio2019). I rappresentanti si incontrano una volta all'anno per la conferenza generale e per eleggere i 35 membri che fanno parte del consiglio dei governatori (Board of Governors), che si riunisce cinque volte l'anno per preparare le decisioni da presentare alla conferenza generale ("General Conference").
Al 2010 l'organizzazione disponeva di circa 2200 collaboratori (350 dei quali sono ispettori) provenienti da oltre 90 Paesi diversi. I sei dipartimenti principali, ognuno dei quali fa capo ad un vicedirettore sono dedicati ai seguenti ambiti:
- collaborazione tecnica;
- energia nucleare;
- sicurezza nucleare;
- amministrazione;
- scienze nucleari e ricerca applicata;
- sorveglianza di materiali ("Safeguards").
Programmi e fondi vengono stabiliti dalBoard e dalla conferenza generale. L'organizzazione dispone di unbudget regolare nonché di contributi volontari. Ilbudget per l'anno 2010 ammonta a circa 300 milioni dieuro. I contributi volontari ammontano a circa 90 milioni di dollari.
Vengono forniti regolari resoconti dell'attività dell'agenzia alConsiglio di sicurezza delle Nazioni Unite e all'assemblea generale dell'ONU.
L'AIEA è l'autorità competente per tutti i problemi di salute che riguardano le radiazioni, sia quelle militari che quelle civili, all'uopo ha siglato un accordo con l'Organizzazione mondiale della sanità che vincola le due agenzie a lavorare in stretto rapporto e a fornire solo dati univoci.
