SMA Negeri 1 Bogor didirikan pada tahun1946 olehProf. Dr. Garnadi Prawirosudirdjo yang kemudian menjadi Kepala SMA Negeri yang pertama kali. Dulu SMA Negeri masih bernama SPMA (Sekolah Pertanian Menengah Atas) yang merupakan satu-satunya Sekolah Menengah Tingkat Atas di Bogor.
Sejak tahun 1946 SMA Negeri memiliki lokasi yang tetap yaitu di Jl. Paledang No. 17 Bogor, yang merupakan kediaman Bapak Gunawan Rusmiputro dan putrinya, Ibu Widowati, yang hampir menjadi wanita pertama yang mendapatkan gelar sarjana diIPB. (Penundaan sidang sarjananya tertunda karena kecelakaan di laboratorium yang membakar kedua tangan Ibu Widowati sampai sebatas siku). Rumah tersebut memiliki 6 kamar yang cukup memadai untuk dipergunakan sebagai ruangan untuk kegiatan belajar mengajar.
Kemudian pada tanggal mempunyai jurusan A dan C, serta SMA Negeri 2 yang memiliki jurusan B. Oleh karena itulah pada masa itu terdapat 2 sekolah dengan 2 pimpinan pada lokasi yang sama.
Tahun 1994/1995 nama SMA Negeri 1 sempat diubah namanya menjadi SMU Negeri 1 sesuai tuntutan kurikulum 1994. Sampai sekarang SMA Negeri 1 merupakan sekolah terbaik di kota Bogor ini, dengan prestasi akademik dan nonakademiknya pun cenderung meningkat dari tahun ke tahun. SMA Negeri 1 Bogor memiliki status sebagai Sekolah Nasional Bertarif Internasional (SNBI) sampai pembubaran status Sekolah Bertaraf Internasional oleh Mahkamah Konstitusi pada 2013.
