Reproduksi pada setiap jenisikan berbeda-beda tergantung kondisi lingkungan, ada yang berlangsung setiap musim dan ada juga yang tergantung pada kondisi tertentu setiap tahunnya. Dalam keadaan normal, ikan melangsungkan pemijahan minimum satu kali dalam satu daur hidupnya. Hampir semua jenis ikan pemijahannya berdasarkanreproduksi seksual yaitu terjadinya penyatuan sel reproduksi organ berupa telur dari ikan betina danspermatozoa dari ikan jantan (Effendie, 2002).
Ikan melakukanreproduksi secara eksternal. Dalam melakukannyaikanjantan danikanbetina akan saling mendekat, laluikanbetina akan mengeluarkan telur. Kemudian,ikanjantan akan mengeluarkan spermanya, sperma dan telur akan bercampur di dalamair (yang disebut dengan oviparus). Apabila dalam suatupopulasi terdiri dari ikan-ikan yang memiliki perbedaan seksualitasnya, maka disebut denganpopulasi.
Ikan kermaprodit mempunyaijaringan ovarium maupun jaringan testis yang sering dijumpai dalam beberapa famili ikan. Kedua jaringan tersebut terdapat dalam satuorgan dan letaknya seperti letak padagonad yang terdapat pada [individu] normal. Pada umumnya, ikan hermaprodit hanya satusex saja yang berfungsi pada suatu saat, meskipun ada beberapaspesies yang bersifathermaprodit sinkroni. Berdasarkan perkembanganovarium dan atautestis yang terdapat dalam satuindividu dapat menentukan jenis hermaproditismenya. Terdapat 3 macam hermaprodit pada ikan:
Hermaprodit sinkroni adalah sijfat pematangan sel kelaminjantan danbetina pada waktu yang bersamaan. Contohnya padaikan berfamili Serranidae.Ikan yang tidak mengadakan pembuahan sendiri, dalam satu kali pemijahanikan tersebut dapat berlaku sebagaiikanjantan dan dapat pula sebagaiikanbetina.
Hermaprodit protandi adalah perubahan kelamin darijantan kebetina. Contohnya padaikankakap putih (Lates calcariver). Dimanakakapjantan akan mengalami perbuhan kelamin menjadibetina, pada berat 2–4 kg. hasil penelitan menunjukkanpopulasiikan kakapjantan menurun seiring bertambahnya berat badan.
Hermaprodit protagini adalah sifat perubahan kelamin daribetina menjadijantan.Ikan ini memulai siklus reproduksinya sebagai ikan betina yang berfungsi, kemudian ikan betina berubah menjadi ikan jantan yang berfungsi. Urutan daur hidupnya yaitu masa juvenile yang hermaprodit, masa betina yang berfungsi, masainterseks, dan masa terakhir yaitu masajantan berfungsi.
Ikan gonokhorisme mempunyai kondisi seksual yang berganda. Gonokhorisme tak berdiferensiasi padaikan tahap juvenile gonadikan tidak memilikijaringan yang jelas mengenai statusnya apakahjantan ataubetina. Kemudian gonad tersebut berkembang sepertiovarium. Setengah dari individu-individu ikan gonadnya menjadiovarium (ikan betina), setengah individu lain gonadnya menjaditestis (ikan jantan) sehingga terjadiinterseks. Sedangkan gonokhorisme berdiferensiasi yaitu sejak mudaikan tersebut sudah memiliki perbedaan antarajantan danbetina,sehingga tidak terjadispesiesinterseks.