Prvenstvo Hrvatske u vaterpolu 2009./10. se kao i prethodne sezone odigravalo nakon završetkaJadranske liga. Četiri ekipe koje su ostvarile najbolji plasman u Jadranskoj ligi sudjelovale su u doigravanju za pobjednikaprvenstva Hrvatske u vaterpolu.
Jug (2.),Mladost (4.),Primorje (7.) iMornar (8.) ušli su u poluzavršnicu i odigravanje utakmica za prvaka, dok su seŠibenik (9.),Jadran (10.),Medveščak (11.) iPOŠK (12.) plasirali u doigravanje za ostanak i plasman od 5. do 8. mjesta. Pobjednik Hrvatske vaterpolo lige u sezoni 2009/10. bio je dubrovački vaterpolski klub Jug.
Jug - Mornar13 : 5
Mladost - Primorje11 : 5
Mornar -Jug 4 :16
Primorje -Mladost 9 :14
Nakon što su bili bolji u dva susreta plasman u završnicu osigurali su Jug i Mladost. VK Jug je u utakmici za prvaka lige nakon pet odigranih finalnih utakmica bio bolji rezultatom 3:2 u dobivenim utakmicama. Za plasman na treće mjesto, između poraženih u poluzavršnici, odigrale su se tri utakmice. Nakon tri odigrane utakmice Vaterpolo klub Primorje je bio uspješniji od Mornara ukupnim rezultatom 3:2 te je osvojio treće mjesto i mogućnost kvalifikacija za sudjelovanje u vaterpolskoj Euroligi u sezoni 2010./11., dok je Mornar izborio nastup u vaterpolskom LEN kupu.
1. utakmica:Jug - Mladost9 : 8
2. utakmica:Mladost - Jug7 : 6
3. utakmica:Jug - Mladost12 : 10
4. utakmica:Mladost - Jug14 : 12
5. utakmica:Jug - Mladost14 : 9
1. utakmica: Primorje -Mornar 10 :11
2. utakmica: Mornar -Primorje 6 :10
3. utakmica:Primorje - Mornar11 : 4
Šibenik - POŠK15 : 7
POŠK - Šibenik7 : 6
Šibenik -POŠK 10 :14
Jadran - Medveščak13 : 12
Medveščak - Jadran13 : 11
Jadran : Medveščak9 : 8
Nakon dva odigrana susreta Jadran je osvojio peto mjesto i mogućnost nastupa u vaterpolskom kupu LEN u sezoni 2010./11., dok je u utakmici za sedmo mjesto Medveščak bio bolji od Šibenika.
Jadran - POŠK11 : 7
POŠK -Jadran 6 :9
Šibenik -Medveščak 6 :11
Medveščak - Šibenik11 : 10