Pompej je bio sinGneja Pompeja Straba, vrlo bogatog i utjecajnog političara. Mladi Pompej je odrastao uz svog oca i pratio ga u vojnim pohodima.Strabo je u ratu izmeđuLucija Kornelija Sule iGaja Marija bio na Marijevoj strani. Kada mu je otac umro, mladi Pompej je naslijedio njegovo bogatstvo, politički utjecaj i značajnu vojnu silu.
Pompej je83. pr. Kr. stao s vojskom od trilegije na stranu Sule, kada se ovaj vratio u Italiju i krenuo na Rim. Ovaj politički savez ubrzao je Pompejevu karijeru. Sula je82. pr. Kr. postao apsolutnidiktator, a Pompej njegov saveznik. Sula je naredio svojoj unuci Emiliji, koja je bila trudna i udana, da se razvede kako bi se mogla udati za mladog Pompeja. Pompej se odmah razveo od svoje supruge Antistije i oženio Emilijom.
Iako još mlad, Pompej je dobio od Sule povjerenje i ovlasti da se obračuna s Marijevim pristašama koji su se nalazili uSiciliji i rimskoj provinciji Africi. Pompej je pokazao popriličnu okrutnost prema svima koji su pokazivali znakove otpora. Čuvena je njegova rečenica kada su se ljudi bunili na njegove metode provođenja vladavine: „Prestanite nam citirati zakone, mi nosimo oružje!” Nakon brojnih pobjeda uAfrici, Pompeja su njegove trupe proglasiliimperatorom i dali mu nadimak „Veliki”. Navodno je čak i sam Sula smislio taj nadimak. Prema tradiciji, Pompej je na povratku u Rim zatražio odsenata da proslavitrijumf. Senat ga je odbio a Pompej se stacionirao s vojskom ispred Rima i odbio otići dok senat ne pristane. Tada se umiješao Sula i pristao da Pompej proslavi trijumf.
Nakon toga Pompej je zatražio tituluprokonzula, jer je bio premlad da postanekonzul. Ova mu je titula trebala biti formalnost jer je Pompej, zajedno sKvintom Cecilijem Metelom Piom, određen da se ode boriti protivKvinta Sertorija. Sertorije je bio posljednji Marijev pristaša i održao se na vlasti uHispaniji.Gerilski rat je trajao76. pr. Kr.-71. pr. Kr. Nije bilo većih vojnih sudara, a rat je završio kada je Sertorije pao u atentatu.
Pompej se odazvao na poziv senata iMarka Licinija Krasa vratio u Italiju71. pr. Kr. U Italiji je trajala pobuna robova pod vodstvomSpartaka,Treći robovski rat.Kras je pobijedio Spartaka ubitci kod Lukanije,71. pr. Kr. Pompej je uništio velik dio robovske vojske koji je pobjegao, oko 5,000 ljudi. Iako je Kras najzaslužniji za poraz Spartaka, Pompej je uspio taj pothvat pripisati sebi.Zatim je u Rimu proslavio drugi trijumf, za pobjedu u Hispaniji.
70. pr. Kr. Pompej je, zajedno s Krasom, po prvi put izabran za konzula.
67. pr. Kr. Pompej je od senata dobiodiktatorske ovlasti da uništipirate uSredozemnom moru. U senatu su isprva i konzervativna frakcija i optimati bili protiv da Pompej preuzme zapovjedništvo. Ali kada je plebejskitribun prijedlog dao na glasovanje, prihvaćen je velikom većinom. Ovaj zadatak Pompej je uspješno završio za samo nekoliko mjeseci, gotovo u potpunosti istrijebivši sredozemne pirate.
Sirija je postala rimska provincija, a Antioh XIII. posljednji vladar dinastijeSeleukida. Zauzeo jeJeruzalem, aJudeja je postala poluneovisna provincija pod rimskom kontrolom. Ovo osvajanje i organizacija istočnih rimskih provincija smatra se najvećim Pompejevim dostignućem.
29. rujna61. pr. Kr., na svoj 45. rođendan, Pompej je u Rimu proslavio svoj treći trijumf. Bio je to nezaboravan događaj. Dva puna dana uzmjenjivale su se ogromne parade i povorke zarobljenika, vojske, zabavljača igladijatora koji su demonstrirali prikaze bitaka. Da bi upečatljivo završiofestival i slavlje, Pompej je organizirao velikibanket idonirao novac rimskom narodu. Time je još više povećao svoju popularnost.
RekonstrukcijaPompejevog kazališta koje se nastavlja na Pompejev portik i kuriju.
Nakon serije vojnih pohoda i stalnog ratovanja, Pompej je prešao napolitiku. Raspustio je svojelegije i krenuo u političku karijeru. U senatu su mu se i dalje suprotstavljali konzervativci. Saveznik mu je bio Kras, s kim je prije dijelio mjesto konzula. U isto vrijeme Gaj Julije Cezar se također natjecao za funkciju konzula. Pompej je s Cezarom i Krasom59. pr. Kr. sklopio prvitrijumvirat. Pompej i Kras su svojim vezama pomogli Cezaru pri izboru za konzula, a ovaj im je uzvratio brineći se za njihove osobne interese.
Pompej je zatim oženioJuliju, Cezarovu jedinu kćer. Iako je ovo bio brak iz interesa, ljubav Pompeja i Julije je bila obostrana.Iako je Pompej bio imenovan guvernerom Hispanije, ostao je u Rimu gdje se brinuo za upravu grada. God.56. pr. Kr. trijumvirski ugovor između Pompeja, Cezara i Krasa je obnovljen.55. pr. Kr. Pompej i Kras su imenovani za konzule, a Cezar zaprokonzula, svi na rok od pet godina. Iste godine otvoreno jePompejevo kazalište, tada najveće kazalište u svijetu koje je moglo primiti od 12 do 27.000 gledatelja. God.54. pr. Kr. Julija je umrla tijekom porođaja. Kras je poginuo ubitci kod Harana (53. pr. Kr.) kada su rimsku vojsku poraziliParti predvođeniSurenom. Krasova smrt je poremetila ravnotežu moći. U međuvremenu Cezar je širio svoj utjecaj brojnim pobjedama uGalskom ratu. Za to se vrijeme Pompej približio senatu i okrenuo protiv Cezara.
Rimska Republika za vrijeme građanskog rata (49. – 48. pr. Kr.); područja koja je Pompej osvojio su bež.
Nakon prekida trijumvirskog ugovora, Pompej je oženioKorneliju Metel, kćerScipia Metela. Zajedno sa Scipiom, Pompej postaje konzul po treći put. Koristeći svoje ovlasti kao konzul, Pompej je donio mnogezakone u vezisudstva i vojske.Brojni zakoni su išli u smjeru protiv Cezara. Pompej je osobno zatražio zabranu produživanja funkcije prokonzula Cezaru u odsustvu, već se trebao vratiti u Rim, a najprije raspustiti vojsku. Cezar je49. pr. Kr. prešao s jednom legijom rijekuRubikon i time započinje građanski rat između Pompeja i Cezara.
Pompej je zajedno sa saveznicima napustio Rim i povukao se na jug Italije.Rat je bio neizvjestan sve dok Pompej nije poražen ubitci kod Farsala,48. pr. Kr. Pompej je zajedno sa svojom ženom Kornelijom pobjegao uEgipat.Ptolemej XIII. ga je ljubazno primio i dao mu jedan brod na raspolaganje. Na 59. rođendan, Pompej je pozvan na malu proslavu rođendana. Ubijen je po nalogu Ptolemeja XIII. koji je htio time pridobiti Cezara. Pompej je ubijen odsjecanjem glave. Njegov prijatelj Filip organizirao mu je jednostavan sprovod i kremirao ga. Cezar je u Egipat stigao nešto poslije. Na dočeku je primio Pompejevu glavu iprsten u košari.Plutarh tvrdi da je Cezar počeo plakati kada je vidio taj prizor. Cezar je Pompejev prah i prsten dao udovici Korneliji koja ga je sahranila u Italiji.
Za antičke povjesničare i one kasnijih rimskih vremena, Pompej je bio čovjek koji je postigao izvanredne uspjehe vlastitim snagama, ali je izgubio snagu i na kraju bio žrtva izdaje. Plutarh ga opisuje kao rimskogAleksandra Velikog, čistog srca i uma, kojega su razorile cinične ambicije onih oko njega. Ovaj portret je naslijeđen tijekom renesanse i baroka, kao na primjer u djeluCorneliusa,Smrt Pompejeva (1642.).