Za postojanjefluora se znalo mnogo godina, ali pokušaji da se pripremi bili su neuspješni. Neki su i umrli eksperimentirajući i pokušavajući ga izolirati. Kad se pripremi, fluor reagira sa svim oko sebe i ponovo stvara spojeve. Njegova velika reaktivnost je sprječavala pokušaje izolacije.
Moissan je uspioelektrolizom rastalitikalijev hidrogenfluorid (KHF2) u tekućifluorovodik (HF). Ta mješavina je bila potrebna jerfluorovodik nije vodič. Napravio je aparat splatinsko-iridijevskim elektrodama u platinskom držaču i ohladio je na -50°C. Time je potpuno izoloiraovodik na negativnim elektrodama, afluor na pozitivnim elektrodama. To je način kako se fluor i dan danas proizvodi.Nikal se može koristiti za držanje elementarnog fluora. Razvija se zaštitni sloj nikafluorida, slično kao oksidni slojevi naaluminiju.
Nastavio je proučavati kemiju fluora. Doprinio je razvoju električnih lučnih peći i pokušao je stvoritidijamante koristeći ugljik iz drugih spojeva.
Tijekom1893. proučavao je fragmente meteorita nađenog ukanjonu Diablo uArizoni. U tim fragmentima je otkrio novimineral, pa je nakon intenzivnog istraživanja zaključio da je novi mineral napravljen odsilicijevogkarbida. Mineral je1905. nazvanmoasanit u njegovu čast. Umro je naglo u Parizu20. veljače1907., ubrzo nakon dobivanja Nobelove nagrade. Ne zna se jesu li njegovi eksperimenti s opasnim fluorom doprinijeli njegovoj preranoj smrti.