Iako ne raspolažemo povijesnim dokazima, vjerojatno ga je dao smaknutiOktavijan 30. pr. Kr., nakon pobjede nadMarkom Antonijem i Kleopatrom u građanskom ratu, kako bi ostao jedini Cezarov nasljednik. PremaPlutarhu, Cezarion je s velikim dijelom državne riznice uspio pobjeći u Indiju.
Iako je njegova majka Kleopatra imala svu vlast, Cezarion je bio posljednji faraon helenističkog Egipta. Njegovom smrću je završila dinastijaPtolemejevića, koja je vladala Egiptom od305. p. Kr. Nakon smrti Kleopatre i Cezariona Egipat je postao jednom od rimskih provincija.