הסטודיו לאנימציהProduction I.G הפיק מספר עיבודים אנימטיביים למאנגה, כשהראשון בהם הוא סרטאנימה משנת1995 המגולל את חקירת "מדור 9" אחר שליט הבובות. סדרת האנימה משנת2002 מציגה עלילה שונה מזו של המאנגה ושל הסרט הראשון ומביאה את חקירתו של "מדור 9" אחר תקריות "האיש הצוחק" וקבוצת הטרור "אחד עשר הבודדים". בשנת2004 יצא סרט האנימה השני, ובו מדור 9 חוקר סדרת רציחות בידי רובוטים גינואידים. בשנת2013 שודרה סדרת סרטי מקבץ המביאה את עלילותיה של מוטוקו קוסאנאגי בשנים שלפני הקמת מדור 9, בעולם שבו אנשים ממדינות מפותחות הפכו לקיבורגים עם גופות מלאכותיים. ביוני2015 יצא סרט האנימה השלישי, שעסק בחקירת הירצחו שלראש ממשלת יפן.
רקע המאנגה (והמדיה שנוצרו בעקבותיה) הואסייברפאנק/פוסט-סייברפאנק בדומה לטרילוגיית המשרעה שלויליאם גיבסון (ראהנוירומנסר), אולם בניגוד לסופרי הז'אנר, שירו מתמקד בהשלכות האתניות והפילוסופיות שבמיזוג ביןאדם למכונה, בהתפתחות שלאינטליגנציה מלאכותית וקיומה של מערכת ממוחשבת שמאבחנת ואומדת את הזהות האנושית וייחודה על פני זהויות אחרות.
"הרוח במעטפת" הואמותחןמשטרתי עתידני העוקב אחר עלילותיה של מוטוקו קוסאנאגי, חברת השירות החשאי הבדיוני "מדור 9" שלהוועדה הלאומית לביטחון הציבור ביפן, שמתמחה בלחימה בפשעיטכנולוגיה,טרור ולוחמה קיברנטית. למרות שהיא שוות ערך לשאר חברי הקבוצה, קוסאנאגי מתפקדת כראש הצוות, והכינוי המיוחס לה הוא "מייג'ור", עקב דרגתה הקודמת בכוחות המיוחדים. היא מסוגלת לביצועים על-אנושיים כיוון שרק מוחה וחלקים מעמוד השדרה שלה הם אורגניים, שאר גופה מכני. היא ובאטו, חברה לצוות, הם הקיבורגים היחידים שהצליחו לשמור על זהותם האנושית (להלן: רוח, Ghost) ואשר פגיעים כמו כל אדם להתקפת "האקינג-רוח", היינו, פריצה למוחם של אנשים ושליטה בהם.
שמה של מוטוקו קוסאנאגי מתייחס לאחד משלושת אוצרות יפן (ראהמיתולוגיה יפנית), ושירו מתייחס אליהם בחוברת המאנגה השנייה. נוסף לכך, הוא מציין ששאב השראה לסיפור מ"הרוח במכונה" שלארתור קסטלר.
המדיות השונות של GitS מציגות עלילה נפרדת ולעיתים חלופית לסיפור המרכזי שהוצג במאנגה. כך למשל, סרט האנימה הראשון מתרחש בתקופת זמן שונה לזו שבסדרת האנימה.
הרוח במעטפת (Ghost in the Shell) - מאנגה משנת1989 שמביאה את סיפור מרדפה של מוטוקו קוסאנאגי אחר "שליט הבובות" (The Puppet Master), פושעקיברנטי שזהותו האמיתית אינה ידועה, ושמבצע פשעים באמצעות "האקינג-רוח". בהמשך חקירתם של "מדור 9" מתגלה, כי פושע זה אינו פושע רגיל כי אם פרויקטאינטליגנציה מלאכותית שנוצר בידי סוכנות ממשלתית שלמשרד החוץ הידועה בכינויה "מדור 6". "שליט הבובות" בורח משליטת "מדור 6" בשאיפה להתמזגות עם מוחה של קוסאנאגי.
הרוח במעטפת 2: ממשק אדם/מכונה (Ghost in the Shell 2: Man\Machine Interface) - מאנגת ההמשך שפורסמה בשנת1997 ונוגעת בעיקר בסוגיות הפילוסופיות שבזהות בני האדם ובגבולות התודעה האנושית.
הרוח במעטפת 1.5: מעבד שגיאת-אנוש (Ghost in the Shell 1.5: Human-Error Processor) - ארבעה פרקים שנועדו במקור להיות חלק ממאנגת ההמשך, ואשר ממשיכים לגולל את חקירותיהם השונות של "מדור 9".
הרוח במעטפת (Ghost in the Shell) - יצא בנובמבר1995 בבימויו של מאמורו אושי. הסרט עוקב אחר מאורעות האנימה ומתרחש בשנת 2029, אולם מתרכז בעלילת "שליט הבובות" בלבד משום אורכו (82 דקות).כתוביות הפתיחה של אנשי הצוות רצות לאורך המרקע בצורת רשימת קודים, ואפקט זה השפיע מאוחר יותר על הסרטמטריקס. לסרט יצא בשנת2008 עיבוד מחודש (Ghost in the Shell 2.0) הכולל עריכה דיגיטלית, סצנות בתלת-ממד ועריכתפסקול מחודשת.
הרוח במעטפת 2: תמימות (Ghost in the Shell 2: Innocence) - יצא במרץ2004 בבימויו של מאמורו אושי. הסרט ממשיך את עלילת המאנגה באופן רופף וחוקר מעשי רצח שמבוצעים על ידי גינואידים בעליבינה מלאכותית (אנדרואידים שנוצרו בדמות נשים צעירות, שמשמשות כבובות מין). מתרחש כשלוש שנים לאחר מאורעות הסרט הקודם, כאשר באטו הוא הדמות הראשית. לסרט נכתבהנובלהמקדימה בשם "After The Long Goodbye". הסרט הציגאנימציה מרשימה ביופייה והוקרן בפסטיבל קאן בשנת 2004.
הרוח במעטפת: תסביך עצמאות - המצב המוצק (Ghost in the Shell: Stand Alone Complex - Solid State Society) - סרט אנימה שיצא בספטמבר2006 בבימויו של קנג'י קמיאמה. העלילה עצמה אמנם מבוססת על המאנגה, אך עוקבת אחר "מדור 9" בעולם החלופי שנוצר בסדרת האנימה "Stand Alone Complex" ומתרחש לאחר תום עונתה השנייה של הסדרה.
הרוח במעטפת: הסרט החדש (Ghost in the Shell: The New Movie) - יצא ביוני2015 בבימויו של קאזויה נאמורה. בעלילה שמתרחשת לאחר סרטי המקבץArise, מדור 9 חוקר את נסיבות הירצחו של ראש ממשלת יפן.
למאנגה נוצרו שתי סדרות אנימה עוקבות, בבימויו של קֵנְגִ'י קַמִיָאמַה, שהתייחסו לעולם שנוצר בידי מאסמונה שירו אך התרחשו בעולם חלופי שבו "שליט הבובות" אינו קיים.
הרוח במעטפת: תסביך עצמאות (Ghost in the Shell: Stand Alone Complex, אוקטובר2002 - מרץ2003, 26 פרקים). הסדרה עקבה אחרי סדרת פשעים טכנולוגיים ארעיים ושמקורם אינו אדם אחד, ומביאה את עלילות "מדור 9" - ארגון יוצאי יחידות צבאיות, משטרתיות ואפילומאפיה, שחוקר מקרי פשע וטרור טכנולוגיים בשנת 2032. הסדרה קיבלה את שמה מתוך תסביך מנטלי תאורטי המייחס את התאקלמות הקיברנטיקה בציבור הרחב. השם גם מתייחס למבנה הפרקים הארעי, שאינם מקושרים אחד לשני. בשל אורכה, הסדרה גם מציגה דמויות, עלילות משנה ושאר נושאים שלא זכו להתייחסות בסרט האנימה הראשון, אך מצויים במאנגה, ואף מביאה התייחסויות ספרותיות מספרים כדוגמת "קן הקוקייה" שלקן קיזי, אוסף "תשעה סיפורים" שלג'רום דייוויד סלינג'ר (ובמיוחד "האיש הצוחק"), וכן "התפסן בשדה השיפון", גם הוא של סלינג'ר.
הרוח במעטפת: תסביך עצמאות, ג'וב שני (Ghost in the Shell: S.A.C 2nd GIG, ינואר2004 - ינואר2005, 26 פרקים). נחשבת לעונתה השנייה של הסדרה. בנוסף להמשך העלילות שהוצגו בעונה הראשונה, עונה זו חוקרת את סיפור הרקע שמאחורי עולם GitS, הפוליטיקה ומלחמות העולם העתידיות שהתרחשו, היינומלחמת העולם השלישית שהתרחשה בין השנים 2000 - 2015, ומלחמת העולם הרביעית, שכללה שימוש בנשק שאינו גרעיני, ושהתרחשה בין השנים 2015 - 2024. העונה הזו מספקת רקע נכבד במרווח הזמן שבין המלחמות והסיבה לשימוש בפשעים טכנולוגיים.