As estruturas das proteínas tómanse deProtein Data Bank. OPM tamén proporciona unha clasificación estrutural de proteínas asociadas a membranas en familias e superfamilias, e atopoloxía na membrana, aestruturas cuaternarias de proteínas no seu estado unido á membrana, e o tipo de membrana de destino para cada proteína. Poden descargarse os ficheiros coordinados cos límites de membrana calculados. O sitio permite a visualización de estruturas proteicas con límites de membrana planos por medio deJmol,MDL Chime, WebMol eDiscovery Studio.
Esta base de datos foi amplamente utilizada en estudos experimentais e teóricos de proteínas asociadas á membrana.[13][14][15][16][17] Porén, as estruturas de moitas proteínas asociadas a membrana non están incluídas na base e datos se non se poden predicir computacionalmente. Este é o caso cando todas as partes ancoradas na membrana das proteínas (hélices alfaanfifílicas, residuos non polares expostos, ouresiduos de aminoácidos lipidados) se perden nas estruturas experimentais.[4]
↑Tatulian, Suren A.; Qin, Shan; Pande, Abhay H.; He, Xiaomei (2005). "Positioning membrane proteins by novel protein engineering and biophysical approaches".J Mol Biol351 (5): 939–947.PMID16055150.doi:10.1016/j.jmb.2005.06.080.
↑Hristova, Kalina; Wimley, William C.; Mishra, Vinod K.; Anantharamiah, G.M.; Segrest, Jere P.; White, Stephen H. (2 July 1999). "An amphipathic α-helix at a membrane interface: a structural study using a novel X-ray diffraction method".J Mol Biol290 (1): 99–117.PMID10388560.doi:10.1006/jmbi.1999.2840.
