Ocariotipo (do gregokaryon = gran, semente, núcleo) é o número e aparencia doscromosomas no núcleo dunhacélula eucariótica. O termo tamén se usa para designar o conxunto de cromosomas dunha especie, ou un determinado individuo.[1][2][3]
Os cariotipos describen o número de cromosomas e a forma, tamaño e características morfolóxicas de cada un vistas aomicroscopio. É especialmente importante o tamaño, a posición docentrómero, padrón de bandas, diferenzas entre oscromosomas sexuais, e outras características físicas como a existencia de constricións secundarias, satélites etc.[4] A preparación e estudo dos cariotipos forma parte dacitoxenética.
O estudo dun conxunto completo de cromosomas ás veces chámasecarioloxía. Os cromosomas móstranse (reordenando as figuras dunha micrografía) nun formato estándar chamadocariograma ouidiograma: en pares, ordenados por tamaño e pola posición do centrómero nos cromosomas do mesmo tamaño.
O número básico de cromosomas nascélulas somáticas dun individuo ou especie denomínasenúmero somático e desígnase como2n. Nos humanos, por exemplo, 2n = 46. Nas células da liña xerminal (células sexuais) o número cromosómico én (nos humanos: n = 23).[2]p28
Nos organismosdiploides normais, hai dúas copias dos cromosomas autosómicos ouautosomas (os cromosomas de cada par denomínansecromosomas homólogos). Pode haber ou noncromosomas sexuais. As célulaspoliploides teñen múltiples copias de cada cromosoma. As célulashaploides teñen unha soa copia de cada cromosoma.
O estudo dos cariotipos é moi importante enBioloxía celular eXenética, e tamén en estudosevolutivos eMedicina. Os cariotipos poden utilizarse para moitos propósitos; como o estudo deaberracións cromosómicas, funcións celulares, relaciónstaxonómicas, e obtención de información sobre eventos evolutivos do pasado.
O estudo dos cariotipos faise posible por tinguidura. Xeralmente, unha tinguidura adecuada é oGiemsa,[5] despois de que a célula parou a súadivisión ao ser tratada cunha solución decolchicina. Para o caso humano, as células que se usan máis frecuentemente son osleucocitos porque poden ser facilmente inducidos a se dividir e crecer en cultivos de tecidos.[6] Algunhas observacións poden facerse en células que non están en división (interfase), como por exemplo para determinar o sexo dun feto a partir de células extraídas poramniocentese, nas que se comproba a existencia decorpo de Barr.
Xeralmente, obsérvanse e compáranse seis diferentes características dos cariotipos:[7]
Diferenzas nos tamaños absolutos dos cromosomas. Os cromosomas poden variar en tamaño absoluto ata en 20 veces entre xéneros da mesma familiataxonómica:Lotus tenuis eVicia faba (legumes), teñen ambas as dúas seis pares de cromosomas (n=6) pero os cromosomas deV. faba son moitas veces máis longos. Esta característica probablemente reflicte unha diferente proporción de duplicacións do ADN.
Diferenzas no tamaño relativo dos cromosomas. Poden orixinarse só polo intercambio segmental de lonxitudes desiguais.
Diferenzas no número básico de cromosomas. Poden ocorrer debido a sucesivas translocacións desiguais que finalmente eliminan todo o material xenético esencial dun cromosoma, que pasa a outros cromosomas, permitindo que este se perda sen un prexuízo para o organismo (isto denomínase hipótese da dislocación). Na evolución poden orixinarse estas diferenzas por fusións de cromosomas (vercromosoma 2 humano)[8].
Diferenzas en número e posición dos satélites. Os satélites son pequenos corpos esféricos unidos a un cromosoma por un filamento máis fino, que aparecen nalgúns cromosomas.
Diferenzas no grao e distribución das rexións deheterocromatina. A heterocromatina tínguese máis escura caeucromatina, o que indica que está máis empaquetada, e consiste principalmente en secuencias de ADN repetitivo xeneticamente inactivas.
Xeralmente atópanse variacións entre:
Sexos
Entre a liña xerminal (gametos) e as células somáticas
O cariotipo humano normal contén 22 pares de cromosomas autosómicos (autosomas) e un par decromosomas sexuais. Os cariotipos normais das mulleres conteñen douscromosomas X e escríbense 46,XX; os homes teñen un X unY e escríbense 46,XY. Calquera variación do cariotipo estándar pode orixinar anormalidades no desenvolvemento do individuo.
Aínda que areplicación e atranscrición doADN está moi estandarizada noseucariotas, non ocorre o mesmo cos cariotipos, que son moi variables. Hai variación interespecífica no número de cromosomas, e nos detalles da súa organización, malia estaren construídos coas mesmas macromoléculas. Estas variacións son examinadas nos estudos de citoloxía evolutiva.
Nalgúns casos mesmo hai variacións significativas dentro dunha especie. Nunha revisión, Godfrey e Masters conclúen:
"Ao noso ver, é improbable que un proceso ou outro poida por si só explicar o amplo rango de estruturas de cariotipos atopadas... Pero, utilizadas en conxunto con outros datos filoxenéticos, a fisión de cariotipos pode axudar a explicar as grandes diferenzas nos números diploides entre especies moi relacionadas, que eran previamente inexplicables."[10]
Aínda que se sabe moito dos cariotipos a nivel descritivo, e está claro que os cambios na organización do cariotipo tiveron efectos no curso da evolución de moitas especies, non está tan clara a súa significación xeral.
"O noso coñecemento das causas da evolución do cariotipo é moi pequeno, a pesar de moitas investigacións cuidadosas... o significado xeral da evolución dos cariotipo é escura." Maynard Smith.[11]
En vez da habitualrepresión xenética, algúns organismos experimentaron unha eliminación a grande escala daheterocromatina, ou outros tipos de axuste visible dos cariotipos.
Eliminación de cromosomas. Nalgunhas especies, como en moitas moscasSciaridae, son eliminados cromosomas completos durante o desenvolvemento.[12]
Diminución da cromatina (pai fundador:Theodor Boveri). Neste proceso, que se dá nalgúnscopépodos enematodos comoAscaris suum, pérdense porcións dos cromosomas en determinadas células. Este proceso é un rearranxo doxenoma cuidadosamente organizado no que se forman novostelómeros e pérdense certas rexións de heterocromatina.[13][14] EnA. suum, todos os precursores das células somáticas sofren a diminución da cromatina.[15]
Un exemplo espectacular de variabilidade entre especies moi emparentadas é o cérvidoMuntiacus. O número diploide da especie chinesaMuntiacus reevesi é 46, e todos os cromosomas sontelocéntricos. Pero a especie india emparentadaMuntiacus muntjak ten un cariotipo nas femias de só 6 cromosomas e nos machos de 7.[17]
O número de cromosomas do cariotipo de especies relativamente non emparentadas é moi variable. O récord de menos cromosomas teno onematodoParascaris univalens, no que o númerohaploide é n = 1; e o récord máis alto teno ofentoOphioglossum, que ten unha media de 1262 cromosomas.[18] Nos animais atopamos os valores máis altos noesturiónAcipenser brevirostrum con 372 cromosomas.[19] A existencia de cromosomas supernumerarios oucromosomas B significa que o número de cromosomas pode variar mesmo entre unha poboación que se pode aparear; e osaneuploides son outro exemplo, aínda que neste caso non poden considerarse membros normais da poboación.
O número fundamental dun cariotipo é o número de brazos cromosómicos maiores visibles por conxunto de cromosomas.[20][21] Deste modo, cando o número fundamental ≤ 2n, a diferenza depende do número de cromosomas presentes considerados dun só brazo (acrocéntricos outelocéntricos). Os humanos temos un número fundamental = 82,[22] debido á presenza de cinco pares de cromosomas acrocéntricos (13,14,15,21 e22).
Aploidía é o número de conxuntos completos de cromosomas (dotacións) que ten unha célula. As células cun conxunto completo sonhaploides, e as que teñen dous sondiploides. Nas haploides todos os cromosomas son distintos (hai un de cada), e nas diploides cada cromosoma está repetido (hai pares de cromosomas) e os cromosomas de cada par denomínanse cromosomas homólogos.
Poliploidía. Dáse cando hai máis de dous conxuntos completos de cromosomas homólogos nas células, e prodúcese principalmente en plantas. É moi importante naevolución das plantas tal como sinalouStebbins.[23][24][25][26] A proporción de plantas con flor que son poliploides foi estimada por Stebbins no 30-35%, pero nas plantas herbáceas a media é moito maior, de arredor do 70%.[27] A poliploidía nas plantas inferiores (fentos,equisetos epsilotales) é tamén común, e algunhas especies de fentos atinguiron niveis de poliploidía moi superiores aos atopados en plantas con flor. A poliploidía nos animais é moito menos común, pero é significativa nalgúns grupos.[28] As series poliploides en especies emparentadas, que consisten en números múltiplos dun número básico único denomínanseeuploidías.
Haplodiploidía. Dáse cando un sexo é haploide e o outro diploide. É común nosHymenoptera (por exemplo,abellas femia diploides e machos haploides), e noutros grupos.
Endopoliploidía. Aparece cando nos tecidos adultos diferenciados as células deixaron de facer adivisión celular polamitose típica, pero onúcleo celular contén máis cromosomas ca o número orixinal das células somáticas.[29] Noendociclo (endomitose ouendorreplicación) os cromosomas nun núcleo "en repouso" sofren reduplicación, e os cromosomas fillos sepáranse uns doutros dentro dun núcleo conenvoltura nuclear intacta, aumentando o número de cromosomas.[30] En moitos casos, os núcleos endopoliploides conteñen decenas ou mesmo miles de cromosomas (que non poden ser contados con exactitude). As células non sempre conteñen múltiplos exactos do número básico (potencias de dous), polo que unha definición como "aumento do número de dotacións cromosómicas causado pola replicación sen división celular" non é de todo exacta. Este proceso (especialmente estudado nos insectos e nalgunhas plantas superiores como omillo) pode ser unha estratexia de desenvolvemento para incrementar a produtividade de tecidos que son biosinteticamente moi activos.[31] O fenómeno ocorre esporadicamente entre oseucariotas desde osprotozoos ao home; é diverso e complexo, e serve para adiferenciación celular e amorfoxénese de moitas maneiras.[32]
Apaleopoliploidía investiga as duplicacións de cariotipos que se produciron no pasado nas especies.
Aaneuploidía é unha condición cromosómica na cal o número de cromosomas das células non é o número típico da especie, xa que hai copias de máis ou de menos de cromosomas concretos (non de toda a dotación, xa que o número do resto de cromosomas é o normal). Isto orixinaanormalidades cromosómicas como un cromosoma extra ou un ou máis cromosomas ausentes, o cal xeralmente causa anormalidades no desenvolvemento. Son exemplos asíndrome de Down (uncromosoma 21 de máis) e asíndrome de Turner (uncromosoma X de menos).
A aneuploidía pode tamén ocorrer dentro dun grupo de especies emparentadas. Os exemplos clásicos son as plantas do xéneroCrepis, nos que o número gamético (haploide) de cromosomas aparece nas distintas especies na serie x = 3, 4, 5, 6, e 7; e no xéneroCrocus todos os números entre x = 3 a x = 15 están representados en polo menos algunha das especies do grupo. Diversas evidencias mostran que as tendencias evolutivas seguiron diferentes direccións en diferentes grupos.[33]
Algunhas especies animais son polimórficas debido a fusións ou disociacións de cromosomas.[34] Cando isto ocorre, o número de cromosomas é variable dun individuo a outro. Exemplos que foron moi investigados son o doescaravelloChilocorus stigma, algúnsmántidos do xéneroAmeles, e amusaraña común europeaSorex araneus. Hai algunhas evidencias claras no caso domoluscoThais lapillus (do grupo dos corniños) das costas británicas, de que os morfos de dous cromosomas están adaptados a diferenteshábitats.[35]
Nos seus aproximadamente 17.000 km2, asillas Hawai teñen a colección máis diversa de moscas drosofílidas do mundo, que viven desde nos bosque tropicais hawaianos ata nos prados de tipo subalpino da parte alta das illas. Existen alí unhas 800 especies destas moscas, que xeralmente se clasifican en dous xéneros,Drosophila eScaptomyza, da familiaDrosophilidae.
O bandeado politénico do grupopicture wing, que é o máis estudado, permitiulle a Carson construír aárbore evolutiva destas especies moito antes de que fose posible aplicar as técnicas de análise doxenoma. En certa medida, os arranxos xénicos son visibles no padrón de bandas de cada cromosoma. Osrearranxos cromosómicos, especialmente asinversións cromosómicas, poden indicar que especies están máis emparentadas.
As inversións trazadas en forma de árbore (e independentemente doutras informacións), mostran un claro "fluxo" de especies desde as illas máis vellas ás máis modernas. Hai tamén casos de colonización á inversa cara ás illas antigas, e saltos de illas, pero estes son moito menos frecuentes. Utilizandodatación radiométrica K-Ar, comprobouse que as illas actuais teñen unha antigüidade de 0,4 millóns de anos (ma) (Mauna Kea) ata 10ma (illa Necker no noroeste do arquipélago). A illa máis antiga do arquipélago que aínda sobresae do mar é o atol Kure, que ten 30 ma. O arquipélago, que se orixinou polo movemento daplaca do Pacífico sobre unpunto quente do manto, leva existindo desde moito antes doCretáceo, pero foron destruíndose illas e formándose novas. As illas primixenias están agora baixo o mar e son montes submarinos (guyots), que forman a cadea mergullada dosmontes Emperador.[36]
Todas as especies deDrosophila eScaptomyza nativas de Hawai aparentemente descenden dunha única especie ancestral que colonizou as illas, probablemente hai 20 millóns de anos. A subseguinteradiación adaptativa foi estimulada pola ausencia de competencia e pola ampla variedade denichos ecolóxicos dispoñibles. Aínda que é posible que unha soa femia fecundada colonice unha illa, é máis probable que fose un grupo de individuos da mesma especie.[37][38][39][40]
Hai outros animais e plantas do arquipélago de Hawai que sufriron radiacións adaptativas similares, aínda que non tan espectaculares.[41][42]
Acitoxenética emprega varias técnicas para visualizar os diferentes aspectos dos cromosomas:[6]
Obandeado G obtense utilizando a tinguiduraGiemsa despois da dixestión dos cromosomas contripsina. Orixina unha serie da bandas claras e escuras nos cromosomas. As rexións escuras tenden a ser heterocromáticas e ricas nos pares AT. As rexións lixeiras tenden a ser eucromáticas e ricas en GC. Este método producirá normalmente de 300 a 400 bandas noxenoma humano.
Obandeado R é o inverso do bandeado G (e R significa "reverso" ou inverso). As rexións escuras son eucromáticas e as brillantes heterocromáticas.
Tinguidura de prata: Onitrato de prata tingue as proteínas asociadas árexión organizadora nucleolar (NOR). Isto orixina unha rexión escura onde a prata se deposita, indicando onde se encontran os xenes dosARNr dentro dos NOR.
Na representación "clásica" dos cariotipos, úsase unha tinguidura xeralmente o bandeado G conGiemsa, ou menos frecuentemente conquinacrina para tinguir as bandas dos cromosomas. O Giemsa é específico para os gruposfosfato dosnucleótidos doADN. A quinacrina únese ás rexións ricas enadenina-timina. Cada cromosoma ten un padrón de bandeado característico que axuda a identificalos; ambos os cromosomas dun mesmo par de homólogos teñen o mesmo padrón de bandeado.
Os cariotipos dispóñense colocando os cromosomas de modo que o brazo curto quede na parte de arriba, e o brazo longo abaixo. Algúns cariotipos designan os brazos curtos comop e os longos comoq. Ademais, as rexións e subrexións con diferente tinguidura reciben designacións numéricas deste a posiciónproximal ádistal no brazo do cromosoma. Por exemplo, asíndrome cri du chat implica unhadeleción na rexión 15.2 do brazo curto docromosoma 5, e escríbese 46,XX,del(5)(p15.2).[43]
O cariotipado espectral é unha técnica citoxenética molecular utilizada para visualizar simultaneamente todos os pares cromosómicos dun organismo en diferentes cores. Fanse sondas para cada cromosoma marcadasfluorescentemente que marcan secuencias específicas de ADN de cada cromosoma con diferentesfluoróforos. Como hai un número limitado de fluoróforos espectralmente diferentes, utilízase un método combinatorio de marcado para xerar moitas cores diferentes. As diferenzas espectrais así xeradas son captadas e analizadas usando uninterferómetro unido a unmicroscopio de fluorescencia. Un programa informático de procesamento de imaxes asigna despois unha falsa cor a cada diferente combinación espectral, permitindo a visualización dos cromosomas en diferentes cores.[44]Esta técnica utilízase para identificar aberracións cromosómicas estruturais nas células cancerosas e outras doenzas cando o bandeado Giemsa ou outras técnicas non teñen precisión dabondo.
Ocariotipado dixital é unha técnica usada para cuantificar o número de copias de ADN a escala xenómica. Íllanse e numéranse curtas secuencias de ADN deloci específicos de todo o xenoma.[45] Este método coñécese tamén como cariotipado virtual.
As anormalidades cromosómicas poden ser numéricas, como a presenza de cromosomas extra ou a ausencia dun cromosoma, ou estruturais como noscromosomas derivados,translocacións,inversións, delecións a grande escala ou duplicacións. As anormalidades numéricas, tamén chamadasaneuploidías, a miúdo ocorren como resultado danon-disxunción na formación dosgametos durante ameiose; outras anormalidades numéricas comúns son astrisomías, nas cales están presentes tres copias dun determinado cromosoma en troques das habituais dúas copias. As anomalías estruturais xeralmente están causadas por erros narecombinación xenética entre homólogos. Ambos os tipos de anormalidades poden aparecer nos gametos e, por tanto, estarán presentes en todas as células da persoa afectada, ou poden ocorrer durante amitose e daren lugar a un individuo que é unmosaico xenético, que ten algunhas células normais e outras anormais.
Entre as anormalidades cromosómicas que poden orixinar enfermidades nos humanos están:
Tamén están documentados casos de trisomía8, trisomía9 etrisomía 16, aínda que os individuos afectados xeralmente non sobreviven ao nacemento.
Algúns trastornos orixínanse pola perda de só unha parte dun cromosoma. Entre elas están:
Cri du chat. Causado por uncromosoma 5 co brazo curto truncado. O nome vén do son dos choros dos bebés afectados, que lembra ao miar dun gato, causado por unha deformación nalarinxe.
Síndrome de Prader-Willi. O 50% dos casos teñen un segmento do brazo longo docromosoma 15 ausente; é unha deleción de xenes paternos (outro caso de impronta xenética).
As anormalidades cromosómicas poden tamén ocorrer nas células cancerosas dun individuo xeneticamente normal. Un exemplo ben documentado é ocromosoma Filadelfia, unha mutación por translocación xeralmente asociada coaleucemia mielóxena crónica e menos frecuentemente coaleucemia linfoblástica aguda.
Os cromosomas foron observados por primeira vez en células de plantas porKarl Wilhelm von Nägeli en 1842. O seu comportamento nas células animais depíntega describiunoWalther Flemming, o descubridor damitose, en 1882. O nome cromosoma propúxoo o anatomista alemán,von Waldeyer en 1888.
Os seguintes avances tiveron lugar despois do desenvolvemento daXenética a comezos doséculo XX, cando se viu que o conxunto de cromosomas (o cariotipo) levaba os xenes do individuo. Levitsky parece ser o primeiro en definir o cariotipo como a aparenciafenotípica dos cromosomas somáticos, diferenciándoo do seu contido xenético.[46][47] A seguinte evolución do concepto de cariotipo pode seguirse nos traballos de Darlington[48] eWhite.[2][9]
Levou moitos anos de investigación establecer a cuestión máis básica: cantos cromosomas contén unha célula humana diploide.[49] En 1912,Hans von Winiwarter informou que eran 47 cromosomas nasespermatogonias e 48 nasovogonias, e concluíu que nos humanos existía un sistema de determinación do sexo X0 (XX femias e X0 machos).[50]Painter en 1922 non estaba seguro se o número diploide dos cromosomas humanos era 46 ou 48, e inicialmente inclinábase por 46.[51] Mudou de opinión despois e pasou a pensar que eran 48, e afirmou que a determinación de sexos nos humanos facíase polo sistema XY (XX femias e XY machos).[52] Considerando as rudimentarias técnicas da época estes resultados son bastante notables. Hoxe sabemos que algúns invertebrados teñen unsistema de determinación do sexo X0.
Houbo que agardar á aparición de novas técnicas para resolver definitivamente o problema. Entre os métodos que se empezaron a usar están:
Pretramento das células cunha solución hipotónica (con menos solutos ca a célula), o que fai que a célula capte auga e inche, estendendo os seus cromosomas.
Esmagar a preparación no portaobxectos para que os cromosomas se coloquen nun só plano.
Recortar unha fotomicrografía e dispoñer os cromosomas formando un cariograma undiscutible.
Ata 1950 non se aceptou de forma xeral que o cariotipo humano constaba só de 46 cromosomas.[53][54] Un descubrimento evolutivo interesante foi que os grandes simios teñen 48 cromosomas, e que ocromosoma 2 humano se formou pola unión de dous cromosomas ancestrais dos nosos antepasados, reducindo o seu número total a 46.
↑Maynard Smith J. 1998.Evolutionary genetics. 2nd ed, Oxford. p218-9
↑Goday C. and Esteban M.R. 2001. Chromosome elimination in sciarid flies.Bioessays23: 242–250.
↑Müller F. Bernard V. & Tobler H. 1996. Chromatin diminution in nematodes.Bioessays18: 133–138.
↑Wyngaard G.A. & Gregory T.R. 2001. Temporal control of DNA replication and the adaptive value of chromatin diminution in copepods.J. Exp. Zool.291: 310–16.
↑de Oliveira, R. R.; Feldberg, E.; Mdos Anjos, . B.; Zuanon, J. (July/Sept. 2007). "Karyotype characterization and ZZ/ZW sex chromosome heteromorphism in two species of the catfish genusAncistrus Kner, 1854 (Siluriformes: Loricariidae) from the Amazon basin".Neotropical Ichthyology (Sociedade Brasileira de Ictiologia)5 (3): 301–306.doi:10.1590/S1679-62252007000300010.
↑Lilly M.A. & Duronio R.J. (2005). "New insights into cell cycle control from theDrosophila endocycle".Oncogene24 (17): 2765–75.PMID15838513.doi:10.1038/sj.onc.1208610.
↑Edgar B.A. & Orr-Weaver T.L. 2001. Endoreduplication cell cycles: more for less.Cell105, 297–306.
↑Nagl W. 1978.Endopolyploidy and polyteny in differentiation and evolution: towards an understanding of quantitative and qualitative variation of nuclear DNA in ontogeny and phylogeny. Elsevier, New York.
↑Stebbins, G. Ledley, Jr. 1972.Chromosomal evolution in higher plants. Nelson, London. p18
↑Polymorphism: when two or more clearly different phenotypes exist in the same interbreeding population of a species. Ford E.B. 1975.Ecological genetics, 4th ed.
↑Clague D.A. & G.B. Dalrymple. 1987. The Hawaiian-Emperor volcanic chain, Part I. Geologic evolution. In R.W. Decker, T.L. Wright & P.H. Stauffer (eds)Volcanism in Hawaii. U.S. Geological Survey Professional Paper 1350, 5-54.
↑Carson H.L. 1970. Chromosomal tracers of evolution.Science168, 1414–1418.
↑Carson H.L. 1983. Chromosomal sequences and interisland colonizations in HawaiianDrosophila.Genetics103, 465-482.
↑Kaneshiro K.Y. Gillespie R.G. and Carson H.L. 1995. Chromosomes and male genitalia of Hawaiian Drosophila: tools for interpreting phylogeny and geography. In Wagner W.L. & Funk E. (eds)Hawaiian biogeography: evolution on a hot spot archipelago, Smithsonian Institution Press, Washington D.C. 57-71
↑Craddock E.M. 2000. Speciation processes in the adaptive radiation of Hawaiian plants and animals.Evolutionary Biology31, 1-43.
↑Ziegler A.C. 2002.Hawaiian natural history, ecology and evolution. Honolulu: University of Hawaii Press.
↑E. Schröck, S. du Manoir, T. Veldman, B. Schoell, J. Wienberg, M. A. Ferguson-Smith, Y. Ning, D. H. Ledbetter, I. Bar-Am, D. Soenksen, Y. Garini, T. Ried. Multicolor spectral karyotyping of human chromosomes.Science, 26 July 1996; 273 (5274):494.abstract