MyExample.js から、他のモジュールの API を呼び出すには、package.json の dependencies にそのモジュールを追加し、依存関係があることを明記する必要があります。

どのようなモジュールが利用できるかは、WebModuleList を参照してください。

//// 例として foo.bar.js を追加しています"dependencies": {"uupaa.hash.js":"","foo.bar.js":""}

dependencies に追加した外部モジュールは、npm run build コマンドにおけるコンパイル対象となります。
不要なモジュールを dependencies に記述したままにすると、ビルド後の JavaScript のサイズが肥大化します。
不要なモジュールを組み込んでいないか時々確認を行ってください。

MyExample.js の開発中に(一時的に)必要となるモジュールはpackage.json の devDependencies に記述します。

//// 例として uupaa.es.js を追加"devDependencies": {"uupaa.es.js":""}

ユニットテストで必要となるモジュールは dependencies ではなく devDependencies に記述してください。

package.json 変更後はnpm run sync で変更内容を反映してください。