http://www.graphviz.org/

• C製
• Doxygen, Moinmoinなどと連携可能
• ブロック図、クラス図、ネットワーク図など
• PNG, SVGなど出力可能形式一覧
• JavaScript（Emscripten）版もある。リアルタイムプレビュー出来て便利https://github.com/mdaines/viz.js

• Java製
• シーケンス図, ユースケース図, クラス図, アクティビティ図, コンポーネント図, ステート図, デプロイ図, オブジェクト図などめっちゃたくさん作れる
• PNG, SVG, LaTeX, ASCII出力
• なんとワイヤーフレームも作れる。アイコンとかも入れられる。
• オンライン版https://www.planttext.com/

http://blockdiag.com/ja/blockdiag/

• Python製
• ブロック図, シーケンス図, アクティビティ図, 物理ネットワーク図など
• blockdiag, seqdiag, actdiag, nwdiagから構成されている
• スクリプトはGraphViz風
• Sphinx, Trac, Redmine, 各種 Wiki エンジン等に対応
• WebUIがあったhttps://github.com/dataich/LiveDiag

https://github.com/knsv/mermaid

• JavaScript製
• d3を使っている模様
• 出力はSVGだが、CLIからも使えて、PNG出力とかもできる（要PhantomJS）
• Markdown風文法（らしい）
• フローチャート, シーケンス図, 面白いとこだとガントチャートも作れる

http://bramp.github.io/js-sequence-diagrams/

• JavaScript製
• SVG出力
• シーケンス図のみ
• テーマ機能あり（デフォルトの出力はゆるい）

http://walf443.github.io/seqdiag.js/

• JavaScript製
• SVG出力
• シーケンス図のみ

https://github.com/weidagang/text-diagram

• JavaScript製
• シーケンス図
• RAWテキスト出力
• READMEとかに埋め込むと割とクールかもしれない

http://flowchart.js.org/

• JavaScript製
• フローチャートのみ
• SVG出力
• 描画にRaphaël使ってる

http://www.showa-corp.jp/special/graphtools/graph-easy.html

• Perl製
• ブロック図
• 基本的にアスキーアートを出すものっぽい
• ASCII, HTML, PNG, GIF, SVG, DOTに出力可能
• Ditaaを出力にかますことで綺麗な図を作成出来る。

http://qiita.com/hirokidaichi/items/ff54a968bdd7bcc50d42

• JavaScript製
• UI Flow図

http://qiita.com/wakufactory/items/8a0cf4ffdd52936f7469

• JavaScript製
• ER図 / ブロックダイアグラム
• マウス操作で編集も可能

• HTML5ベースのフローチャート作図ツールらしい。OSS。http://diagramo.com/
• bpmnというモデル図を作るエディタらしいhttps://github.com/bpmn-io/diagram-js
• Railroad diagramsという、文法可視化した図を作れるやつhttps://github.com/tabatkins/railroad-diagrams
• MathBox WebGLを使ったビジュアライズ用ライブラリhttps://gitgud.io/unconed/mathbox
• ベン図描画https://github.com/benfred/venn.js
• Ditaa ASCIIアートから図へ変換http://ditaa.sourceforge.net/
• shaape 同上https://github.com/christiangoltz/shaape
• previm vimでmermaid対応のmarkdownプレビュー出来るプラグインhttps://github.com/kannokanno/previm
• ATOMで各種の図を描くためのプラグインhttps://github.com/francoislaberge/diagrams