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VirusSin Nombre

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Orthohantavirus sinnombreense

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Orthohantavirus sinnombreense
Description de cette image, également commentée ci-après
Microscopie électronique en transmission devirions du virusSin Nombre.
Classification
DomaineRiboviria
Embr.Negarnaviricota
Sous-embr.Polyploviricotina
ClasseEllioviricetes
OrdreBunyavirales
FamilleHantaviridae
Sous-familleMammantavirinae
GenreOrthohantavirus

Espèce

Orthohantavirus sinnombreense
ICTV,1999[1]

Classification phylogénétique

Position :
  • Espèce : Orthohantavirus sinnombreense
    • Virussin nombre

Orthohantavirus sinnombreense, connu comme levirusSin Nombre (« sans nom » enfrançais,Sin Nombre orthohantavirus (SNV)), est unvirus à ARNmonocaténaire depolarité négative (groupeV de laclassification Baltimore), de l'ordre desBunyavirales (famille desHantaviridae,sous-famille desMammantavirinae).

C'est l'un des principauxagents, avec d'autresespèces dugenreOrthohantavirus, dusyndrome pulmonaire à hantavirus (SPH), unemaladie pulmonaire souvent fatale[2]. La transmission se fait par l'inhalation de particules provenant des excréments desouris contaminées.

Découverte et dénomination

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Le virus a été isolé en 1993 chez des rongeurs collectés près du domicile de l'un des premiers patients atteints du SPH, dans larégion de Four Corners, dans l'ouest desÉtats-Unis. L'isolement a été réalisé par un prélèvement en aveugle chez la Souris sylvestre (Peromyscus maniculatus) suivi d'une culture sur descellules Vero E6. Des souches virales supplémentaires ont également été isolées à partir d'uneP. maniculatus associée à un cas mortel enCalifornie et d'unesouris à pattes blanches (P. leucopus) capturée à proximité de l'origine probable d'un cas àNew York[3],[4].

Le virus ayant été récolté près du Cañón del Muerto (Muerto Canyon, « Gorge du Mort »), sur leterritoire des Navajos, les auteurs de la découverte l'ont d'abord appeléhantavirus Muerto Canyon en 1993, conformément à la convention de dénomination des nouveauxagents pathogènes[5]. Mais laNation navajo s'est opposée à ce nom en 1994[6]. Le lieu de sa découverte étant également proche duquadripointFour Corners, les virologues ont alors tenté de le nommervirus Four Corners, mais les résidents locaux ont protesté[7]. De guerre lasse, ils l'ont finalement appelévirus Sin Nombre (« virus sans nom » en français)[8].

Épidémiologie

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Le virusSin Nombre (SNV) est présent partout où l'on trouve sonréservoir murin, la Souris sylvestrePeromyscus maniculatus : toute la zone peuplée de l'Amérique du Nord à l'exception de l'extrême sud-est (de l'est duTexas à laFloride), de l'Alaska et de l'extrême nord duCanada. Le virus et la maladie pulmonaire sont particulièrement courants dans lesÉtats américains de l'ouest, avec des incidences maximales dans les régions où il y a le plus de contacts entre humains et souris (Nouveau-Mexique etArizona) ainsi que dans les États ayant une population rurale particulièrement nombreuse comme laCalifornie. Des cas ont également été signalés dans toutes lesprovinces de l'ouest duCanada[9].

Letaux de létalité dusyndrome pulmonaire à hantavirus induit par le SNV auxÉtats-Unis était en 1993 d'environ 66,7 %. Il a depuis diminué régulièrement, à mesure que davantage de cas bénins étaient reconnus ; en 2007, il n'était plus que d'environ 35 %[10].

Génétique

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Particules sphériques du virus Sin Nombre, vues enmicroscopie électronique en transmission. Les particules présentent uneenveloppe virale distincte avec de courtes projections de surface et unenucléocapside interne.

Legénome du virusSin Nombre (SNV) a étéséquencé en utilisant de l'ARN extrait du matériel d'autopsie ainsi que de l'ARN extrait de virus obtenus parculture cellulaire. L'ARN L a une longueur de 6 562 nucléotides (nt), l'ARN M de 3 696 nt et l'ARN S de 2 059 à 2 060 nt. On avait craint que des variants du SNV se soient développés préférentiellement dans la culture cellulaire et que les variants sélectionnés diffèrent significativement du virus parental, mais quand on a pu comparer la séquence du prototype (NMH15) détecté dans les tissus d'un cas deHPS à la celle de l'isolat (NMR11), seuls16 changements de nucléotides ont été trouvés, et aucun de ces changements n'avait entraîné d'altération dans les séquences d'acides aminés desprotéines virales[réf. nécessaire].

Notes et références

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  1. (en) « Virus Taxonomy: 2023 Release »,ICTV,(consulté le).
  2. (en) Chunyan Ye, Joseph Prescott, Robert Nofchissey, Diane Goade et Brian Hjelle, « Neutralizing antibodies and Sin Nombre virus RNA after recovery from hantavirus cardiopulmonary syndrome »,Emerging Infectious Diseases,vol. 10,no 3,‎,p. 478-482(DOI 10.3201/eid1003.020821,lire en ligneAccès libre, consulté le).
  3. (en) « All About Hantaviruses », surCenters for Disease Control and Prevention(consulté le).
  4. (en) Brian Hjelle, « Hantaviruses, with emphasis on Four Corners Hantavirus »,(consulté le).
  5. (en) Charles J.Van Hook, « Hantavirus Pulmonary Syndrome—The 25th Anniversary of the Four Corners Outbreak »,Emerging Infectious Diseases,vol. 24,no 11,‎,p. 2056-2060(DOI 10.3201/eid2411.180381).
  6. (en) « Navajos Decry Muerto Canyon Hantavirus Site », surLos Angeles Times,(consulté le).
  7. (en) Ellen G. Strauss et James H. Strauss,Viruses and human disease,Boston,Academic Press,(ISBN 978-0-12-673050-0,lire en ligne),p. 161.
  8. « 13h15, le dimanche… La loi de la jungle - Épisodes 1 et 2 »,(consulté le).
  9. (en) « Differential regulation of pathogens: the role of habitat disturbance in predicting prevalence of Sin Nombre virus »,Oecologia,vol. 155,no 3,‎,p. 429-439(DOI 10.1007/s00442-007-0922-9).
  10. Bryce M.Warner, Derek R.Stein, Bryan D.Griffin et KevinTierney, « Development and Characterization of a Sin Nombre Virus Transmission Model in Peromyscus maniculatus »,Viruses,vol. 11,no 2,‎,p. 183(ISSN 1999-4915,PMID 30795592,PMCID 6409794,DOI 10.3390/v11020183,lire en ligne, consulté le)

Voir aussi

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v ·m
Maladies causées par unHantavirus
Rongeurs
Orthohantavirus
Maladies infectieuses
v ·m
Principales infectionsvirales
Système nerveux central
Myélites et autres
Appareil respiratoire
Appareil digestif
Hépatites
Gastro-entérites
Lésions etmuqueuses
Sexuellement transmissibles
Arboviroses
Autreszoonoses virales
Virus oncogènes
Autres maladies virales
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