Skrowaczewski ne délaisse pas la composition et crée notamment avec son orchestre unconcerto pour clarinette dédié àJoe Longo en 1981. En 1997 et 1999, deux de ses concertos sont en lice pour leprix Pulitzer[4].
Son intégrale dessymphonies d'Anton Bruckner réalisée en 1996 avec l'Orchestre symphonique de la Radio de Sarrebruck est notamment recommandée par laSociété Internationale Bruckner, qui lui a décerné sa médaille d'or[5]. Cette intégrale respectueuse des partitions originales, aux textures allégées, comporte les symphonies00 et0 (« essais de jeunesse » de Bruckner respectivement composés à trente-huit et quarante-cinq ans)[6]. Il a enregistré avec le même orchestre l'intégrale des symphonies deBrahms et deBeethoven.