La chaîne fait environ 120 kilomètres de long pour 65 kilomètres de large. Elle est constituée de six massifs séparés par de profondes vallées : les montsBaker,Emin,Gessi,Luigi di Savoya,Speke etStanley (pic Marguerite). Le mont Stanley est le plus important, avec plusieurs sommets. Il comporte le pic Marguerite, lepoint culminant du massif avec 5 109 mètres d'altitude.
Végétation dans la chaîne du Ruwenzori à 3 700 mètres d'altitude.
La flore du Rwenzori est très diversifiée, allant de laforêt tropicale à l'étage nival avec desglaciers en passant par tous les étages intermédiaires. Grâce à des conditions de température et depluviométrie constante et importante tout au long de l'année, certaines espèces se sont développées de manières particulièrement exubérante. Et ce avec un taux d'endémisme important, surtout dans les zones deforêts de nuages, où l'air saturé de brumes a permis le développement d'espèces complètement insolites, subissant un gigantisme impressionnant :Lobelias,Séneçon géant,bruyères,bambous.
Ces montagnes sont souvent considérées comme étant les « monts de la Lune » mentionnées parPtolémée comme étant lessources du Nil, mais ses descriptions sont trop imprécises pour en avoir la certitude[5]. Près de 2 000 ans plus tard, elles sont aperçues parSamuel White Baker en1864 et attirent de nombreux explorateurs commeHenry Morton Stanley en1889. Les premières tentatives d'ascension, de 1888 à1905, mettent en évidence les difficultés de l'approche et le caractère alpin des difficultés du Rwenzori. La première expédition « alpine » ayant recours aux techniques de l'alpinisme est conduite en1905 parDouglas William Freshfield. Lapremière ascension réussie du pic Margherita a été réalisée en1906[5] par l'équipe duduc des Abruzzes, forte de onze hommes dont le photographeVittorio Sella[6].
Une expédition scientifique menée par leClub alpin belge en 1932 fit une description très complète de ces montagnes[7].