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Riboviria

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Riboviria
Description de l'image IPNV structure.jpg.
Classification ICTV

Domaine

Riboviria
ICTV,2018[1],[2]

Règnes de rang inférieur

et également les familles :

Cetarticle court présente un sujet plus développé dans :classification des virus.

Riboviria est undomaine de laclassification des virus (qui sont distincts desdomaines du vivant) introduit en 2018 par l'ICTV[3]. C'est untaxon qui comprend tous les virus qui utilisent unepolymérase dépendant de l'ARN homologue pour laréplication (HIV, Coronavirus, Influenza,Rougeole). Il comprend desvirus à ARN qui codent uneARN polymérase dépendant de l'ARN et desvirus à transcription inverse (avec des génomes d'ARN ou d'ADN) qui codent uneADN polymérase dépendant de l'ARN. L'ARN polymérase dépendant de l'ARN (RdRp), ou ARN réplicase, produit de l'ARN (acide ribonucléique) à partir de l'ARN. L'ADN polymérase dépendant de l'ARN (RdDp), outranscriptase inverse (RT), produit de l'ADN (acide désoxyribonucléique) à partir de l'ARN. Tous les virus à ARN ont des ARN réplicases homologues qui sont aussi homologues aux reverse transcriptases.Ces réplicases sont essentielles pour répliquer le génome viral et transcrire les gènes viraux enARN messager (ARNm) pour la traduction desprotéines virales[4],[5]. Par contre ces virus à ARN n'ont pas tous la même protéine de capside. Beaucoup de virus à ARN ont comme protéine de capside la Single Jelly Roll fold (SJR)(voir Jelly roll fold sur Wikipedia en anglais).

Il contenait (jusqu'en 2018) un seul embranchementphylogénétique : lesNegarnaviricota, regroupant tous les virus àARNmonocaténaire depolarité négative[6].

Liste des embranchements

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SelonNCBI(24 janvier 2021)[7] :

Notes et références

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  1. ICTV. International Committee on Taxonomy of Viruses. Taxonomy history. Published on the Internet https://talk.ictvonline.org/., consulté le 23 janvier 2021.
  2. (en) « Virus Taxonomy: 2018b Release »,ICTV,(consulté le).
  3. (en)Peter J. Walker, Stuart G. Siddell, Elliot J. Lefkowitz, Arcady R. Mushegian, Donald M. Dempsey, Bas E. Dutilh, Balázs Harrach, Robert L. Harrison, R. Curtis Hendrickson, Sandra Junglen, Nick J. Knowles, Andrew M. Kropinski, Mart Krupovic, Jens H. Kuhn, Max Nibert, Luisa Rubino, Sead Sabanadzovic, Peter Simmonds, Arvind Varsani, Francisco Murilo Zerbini et Andrew J. Davison, « Changes to virus taxonomy and the International Code of Virus Classification and Nomenclature ratified by the International Committee on Taxonomy of Viruses (2019) »,Archives of Virology,‎,p. 1-13(PMID 31187277,DOI 10.1007/s00705-019-04306-w,lire en ligne)
  4. (en) « Create a megataxonomic framework, filling all principal taxonomic ranks, for realm Riboviria » [docx], surInternational Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV),.
  5. (en) « ICTV Taxonomy history: Riboviria », surtalk.ictvonline.org, International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV)(consulté le).
  6. (en)Jens H. Kuhn, Yuri I. Wolf, Mart Krupovic, Yong-Zhen Zhang, Piet Maes, Valerian V. Dolja et Eugene V. Koonin, « Classify viruses — the gain is worth the pain »,Nature,vol. 566,no 7744,‎,p. 318-320(PMID 30787460,DOI 10.1038/d41586-019-00599-8,Bibcode 2019Natur.566..318K,lire en ligne)
  7. NCBI, consulté le 24 janvier 2021.

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