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Rhizaria

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Rhizaria
Description de cette image, également commentée ci-après
Foraminifères benthiques.
Classification WoRMS
CladeDiaphoretickes
Sous-règneHarosa

Infra-règne

Rhizaria
Cavalier-Smith,2002

Embranchements de rang inférieur

Position phylogénétique

Groupe frère : Straménopiles

LesRhizaires aussi appelés Rhizariens[1] (ouRhizaria) sont un groupe d'organismeseucaryotes, le plus souventunicellulaires. Ils peuvent vivre dans des eauxoligotrophes en s'associantsymbiotiquement à des algues[2].

Biomasse

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Leur biomasse a longtemps été très sous-estimée, car ils sont si fragiles que le filet à plancton les détruit. Une méthodes d'échantillonnage non destructive (par caméra immergée) a permis en 2016 de réévaluer l'importance du super-groupe des Rhizaria. Sur la base de leur abondance et de leur volume, la biomasse des Rhizaria océaniques serait au même niveau que d'autres grands groupes de zooplancton « conventionnels », tels que le krill, contribuant à 5 % de labiomasse marine globale[3],[4].

Description

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Les Rhizaires ont une morphologie amiboïde.

Classification

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Parce qu'ils ont une forme amiboïde, ils ont été historiquement classés parmi lesAmoebozoa.

Leur positionnement a été hésitant puisqu'on les a également présentés commegroupe frère desExcavata[5] puis desStraménopiles[6] au sein du (ou plus précisément lesHalvaria).

Selon ce dernier point de vue il s'agit d'une division, non plus desChromistes, mais du sous-règne desHarosa.

SelonWorld Register of Marine Species(21 juillet 2017)[7] :

Phylogénie

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Rhizaria est ungroupe monophylétique composé de deux embranchements frères :Cercozoa etRetaria. Par la suite, Cercozoa et Retaria sont égalementmonophylétiques[8],[9]. Le cladogramme suivant décrit les relations évolutives entre toutes lesclasses rhizaires et est réalisé d'après les travaux de Cavalier-Smithet al. (2018)[10], Irwinet al. (2019)[11] et Sierraet al. (2022)[12] :

Rhizaria
Cercozoa
Filosa
Monadofilosa




Imbricatea



Thecofilosea




Sarcomonadea




Helkesea




Metromonadea



Reticulofilosa

Granofilosea



Chlorarachnea





Endomyxa

Phytomyxea



Gromiidea




Lapot gusevi




Retaria


Foraminifera



Globothalamea



"Monothalamea"




Tubothalamea




"Monothalamea"





Polycystinea





Acantharea



Sticholonchea





Halvaria

Heterokonta



Alveolata



Galerie

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Références

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  1. ↑« Rhizariens », p. 122 dansGuillaumeLecointre etHervéLe Guyader,Classification phylogénétique du vivant, Paris,Belin,,3e éd. (1re éd. 2001), 559 p., 1 vol. + 1 livret des arbres de la classification phylogénétique(ISBN 2-7011-4273-3)
  2. ↑Science et vie - Juillet 2016. voir pp 26/27
  3. ↑(en) David A. Caron, « Ocean science: The rise of Rhizaria »,Nature,‎(DOI 10.1038/nature17892)
  4. ↑(en) TristanBiard, LarsStemmann, MarcPicheral et NicolasMayot, « In situ imaging reveals the biomass of giant protists in the global ocean »,Nature,vol. 532,no 7600,‎,p. 504–507(ISSN 1476-4687,DOI 10.1038/nature17652,lire en ligne, consulté le)
  5. ↑Cavalier-Smith, T. 2002.The phagotrophic origin of eukaryotes and phylogenetic classification of Protozoa.International Journal of Systematic Evolutionary Microbiology. 52:297–354.
  6. ↑Burki, F., K. Shalchian-Tabrizi, M. Minge, A. Skaeveland, S. I. Nikolaev, K. S. Jakobsen, and J. Pawlowski. 2007.Phylogenomics reshuffles the eukaryotic supergroups. PLoS ONE. 8:790-795.texte en ligne
  7. ↑World Register of Marine Species, consulté le 21 juillet 2017.
  8. ↑Bass D, Chao EE, Nikolaev Set al., « Phylogeny of Novel Naked Filose and Reticulose Cercozoa: Granofilosea cl. n. and Proteomyxidea Revised »,Protist,vol. 160,no 1,‎,p. 75–109(PMID 18952499,DOI 10.1016/j.protis.2008.07.002)
  9. ↑Howeet al.,Novel Cultured Protists Identify Deep-branching Environmental DNA Clades of Cercozoa: New Genera Tremula, Micrometopion, Minimassisteria, Nudifila, Peregrinia,vol. 162,, 332–372 p.(PMID 21295519,DOI 10.1016/j.protis.2010.10.002),chap. 2
  10. ↑ThomasCavalier-Smith, Ema E.Chao et RhodriLewis, « Multigene phylogeny and cell evolution of chromist infrakingdom Rhizaria: contrasting cell organisation of sister phyla Cercozoa and Retaria »,Protoplasma,vol. 255,‎,p. 1517-1574(PMID 29666938,PMCID 6133090,DOI 10.1007/s00709-018-1241-1)
  11. ↑(en) Nicholas A.T.Irwin, Denis V.Tikhonenkov, ElisabethHehenberger, Alexander P.Mylnikov, FabienBurki et Patrick J.Keeling, « Phylogenomics supports the monophyly of the Cercozoa »,Molecular Phylogenetics and Evolution,vol. 130,‎1er janvier 2019,p. 416–423(ISSN 1055-7903,PMID 30318266,DOI 10.1016/j.ympev.2018.09.004,S2CID 52982396)
  12. ↑Sierra R, Mauffrey F, Cruz J, Holzmann M, Gooday AJ, Maurer-Alcalá X, Thakur R, Greco M, ((Weiner AKM)), Katz LA, Pawlowski J, « Taxon-rich transcriptomics supports higher-level phylogeny and major evolutionary trends in Foraminifera »,Molecular Phylogenetics and Evolution,vol. 174,‎,p. 107546(ISSN 1055-7903,DOI 10.1016/j.ympev.2022.107546)

À lire aussi

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Article connexe :Rhizaria (classification phylogénétique).

Liens externes

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