Il ne subsiste que peu de chose du Northampton d'avant 1675, la ville ayant été détruite cette année-là par un incendie. La ville s'est surtout développée avec l'arrivée du chemin de fer.
À l'époque de laguerre civile anglaise, les liens de la cité avec la cour ont perdu de leurs forces et Northampton est résolument pro-Parlement[6]. Bien queSpencer Compton, comte de Northampton, soit un royaliste qui soutient le roiCharles Ier, la population de Northampton soutient le Parlement et l'armée républicaine des Têtes rondes d'Oliver Cromwell[6]. Lorsque la guerre éclate en 1642, la ville devient volontairement la principale garnison parlementaire pour la région du sud-est des Midlands, avec l'ancien château royal comme quartier général. En 1643,le prince Rupert attaque Northampton avec environ 2 000 hommes, mais il est repoussé à la porte nord de la ville. Oliver Cromwell s'y rend en 1645 etle général Fairfax marche depuis la ville jusqu'àNaseby, où l'armée royaliste de Charles Ier est vaincue de manière décisive[7]. Plus de 4 000 paires de chaussures en cuir et 600 paires de bottes de cavalerie sont fabriquées à Northampton à la demande d'Oliver Cromwell pour les armées parlementaires pendant la guerre civile[6], et 2 000 autres pour laNew Model Army de Cromwell en 1648. C'est ce qui expliquerait pour certains l'émergence pendant quelques siècles de fabricants de chaussures dans cette ville[6].
Le centre-ville a été détruit par un grand incendie en 1675, causé par des étincelles provenant d'un feu ouvert dans une chaumière près du château. Le feu s'est propagé vers l'est par de forts vents d'ouest, et a consumé les trois quarts du centre-ville en 24 heures[7], d'autant plus que la plupart des bâtiments étaient principalement construits en bois et couverts de chaume.
Northampton a été un centre important de fabrication de chaussures et d'autres industries du cuir, bien que seules des entreprises spécialisées dans la fabrication de chaussures telles que Barker Shoes,Church's, Crockett & Jones,Edward Green, Tricker's (anciennement situées à Earls Barton, non loin de là), et Wildsmith aient survécu. Un grand nombre d'anciennes usines de chaussures subsistent, la plupart transformées en bureaux ou en logements, dont certains sont entourés de maisons mitoyennes construites pour les ouvriers de l'usine.
L'ingénierie est devenue un employeur majeur à Northampton dans les années d'après-guerre, à la suite de l'établissement de l'usine britannique de roulements à rouleaux coniquesTimken à Duston (ville de la banlieue de Northampton) en 1941, en tant qu'usine secondaire du site principal deBirmingham pendant laSeconde Guerre mondiale. L'usine, qui a fermé ses portes en 2002, employait plus de 4 000 personnes à son apogée.
Les principaux employeurs du secteur privé de Northampton se trouvent aujourd'hui dans les secteurs de la distribution et de la finance plutôt que dans l'industrie manufacturière. L'université de Northampton est également un employeur important, tout comme St Andrew's Healthcare, une organisation caritative nationale de santé mentale. St Andrew's Hospital, son hôpital phare et le plus grand hôpital psychiatrique du Royaume-Uni, sont basés à Northampton.
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