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Chez l'homme, le gèneMR1 est situé sur lechromosome 1[7],[5]. Les gènes non classiques du CMH de classe I sont majoritairement regroupés sur un même chromosome (chromosome 6 chez la souris,chromosome 17 chez l'homme) et répartis au sein des mêmes loci que lesgènes du CMH classique.MR1 est situé sur un autre chromosome, l'analyse détaillée dugène a révélé queMR1 est unparalogue provenant de laduplication dulocus du CMH sur le chromosome 6 (souris). Ce gène fonctionnel a été trouvé chez la grande majorité desmammifères, suggérant l'importance deMR1 dans cerègne et sa duplication précoce dans l'évolution desvertébrés[7].
MR1, comme les autres molécules duCMH de classe I, est composé des domaines α1, α2 et α3. α1 et α2 interagissent ensemble et forment la poche de liaison à l'antigène. Celle-ci est petite et contient desacides aminés aromatiques et basiques. Cette petite taille restreint la liaison à de petites molécules de taille modeste comparé au peptides classiquement présenté par leCMH. Le domaine α3 interagit avec laβ2 microglobuline, cette interaction associé à la liaison de l'antigène stabilisent la protéine.
Plusieursisoformes différentes de MR1 ont été identifiées. De nombreuses protéines identifiées ont un codon de STOP prématuré qui génère desprotéines non fonctionnelles. L'isoforme MR1B n'a pas le domaine α3 et est exprimé à lasurface des cellules indépendamment de lamicroglobuline β2. Certaines bactéries sont capables de cibler desmicroglobulines β2 spécifiques qui permettent la présentation duCMH I. Cela pourrait être un mécanisme utilisé pour éviter l'évasion immunitaire bactérienne lors d'infections bactériennes.
Le corps humain ne peut pas synthétiser la plupart desvitamines, ainsi la présence d'intermédiaires de synthèse de lariboflavine est un marqueur du non-soi. A l'inverse la plupart desbactéries sont capables de cette synthese[9],[10].
MR1 est presque indétectable dans des conditions physiologiques, l'expression de surface augmente dans les cellules infectées grâce à la stabilisation du complex MR1-antigen. Le premier ligand MR1 découvert était la 6-formyl ptérine (6-FP)[11].