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Major histocompatibility complex, class I-related

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MR1
Visualisation de la protéine Cristallisée MR1
Structures disponibles
PDBRecherche d'orthologue :PDBeRCSB
Identifiants PDB

4GUP,4L4T,4L4V,4LCW,4NQC,4NQD,4NQE,4PJ5,4PJ7,4PJ8,4PJ9,4PJA,4PJB,4PJC,4PJD,4PJE,4PJF,4PJG,4PJH,4PJI,4PJX,5D7J,5D7I,5D5M,5D7L

Identifiants
AliasMR1, Major histocompatibility complex, class I-related
IDs externesOMIM:600764MGI:1195463HomoloGene:123981GeneCards:MR1
Position du gène (humain)
Chromosome 1 humain
Chr.Chromosome 1 humain[1]
Chromosome 1 humain
Localisation génomique pour MR1
Localisation génomique pour MR1
Locus1q25.3Début181,033,374bp[1]
Fin181,061,938bp[1]
Position du gène (souris)
Chromosome 1 (souris)
Chr.Chromosome 1 (souris)[2]
Chromosome 1 (souris)
Localisation génomique pour MR1
Localisation génomique pour MR1
Locus1|1 G3Début155,003,023bp[2]
Fin155,022,560bp[2]
Expression génique
Bgee
HumainSouris (orthologue)
Fortement exprimé dans
  • cellule bêta

  • palpebral conjunctiva

  • monocyte

  • veine cave

  • stromal cell of endometrium

  • sang

  • pleura viscéral

  • tendon calcanéen

  • muscle lisse

  • granulocyte
Fortement exprimé dans
  • thymus

  • aorte ascendante

  • muscle de la cuisse

  • valve aortique

  • transitional epithelium of urinary bladder

  • muscle temporal

  • muscle triceps brachial

  • parotide

  • corneal stroma

  • œsophage
Plus de données d'expression de référence
BioGPS




Plus de données d'expression de référence
Gene Ontology
Fonction moléculaire
Composant cellulaire
Processus biologique
Sources:Amigo /QuickGO
Orthologues
EspècesHommeSouris
Entrez

3140

15064

Ensembl

ENSG00000153029

ENSMUSG00000026471

UniProt

Q95460

Q8HWB0

RefSeq (mRNA)
NM_001194999
NM_001195000
NM_001195035
NM_001310213
NM_001531

NM_001385161
NM_001385162
NM_001385163
NM_001385164

NM_008209
NM_001355062
NM_001355063

RefSeq (protéine)

NP_001181928
NP_001181929
NP_001181964
NP_001297142
NP_001522

NP_032235
NP_001341991
NP_001341992

Localisation (UCSC)Chr 1: 181.03 – 181.06 MbChr 1: 155 – 155.02 Mb
PublicationPubMed[3][4]
Wikidata
Voir/Editer HumainVoir/Editer Souris

Major histocompatibility complex, class I-related (« relié aucomplexe majeur d'histocompatibilité de classe I », CMH-I) est le nom donné à uneprotéine (MR1) et augène qui la code (MR1). MR1 est une protéine non classique du CMH-I, qui se lie auxmétabolites vitaminiques (intermédiaires de la synthèse de lariboflavine) produits par certains types debactéries. Elle interagit avec leslymphocytes T invariants associés auxmuqueuses (MAIT)[5],[6].

Emplacement du gène

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Chez l'homme, le gèneMR1 est situé sur lechromosome 1[7],[5]. Les gènes non classiques du CMH de classe I sont majoritairement regroupés sur un même chromosome (chromosome 6 chez la souris,chromosome 17 chez l'homme) et répartis au sein des mêmes loci que lesgènes du CMH classique.MR1 est situé sur un autre chromosome, l'analyse détaillée dugène a révélé queMR1 est unparalogue provenant de laduplication dulocus du CMH sur le chromosome 6 (souris). Ce gène fonctionnel a été trouvé chez la grande majorité desmammifères, suggérant l'importance deMR1 dans cerègne et sa duplication précoce dans l'évolution desvertébrés[7].

Structure

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MR1, comme les autres molécules duCMH de classe I, est composé des domaines α1, α2 et α3. α1 et α2 interagissent ensemble et forment la poche de liaison à l'antigène. Celle-ci est petite et contient desacides aminés aromatiques et basiques. Cette petite taille restreint la liaison à de petites molécules de taille modeste comparé au peptides classiquement présenté par leCMH. Le domaine α3 interagit avec laβ2 microglobuline, cette interaction associé à la liaison de l'antigène stabilisent la protéine.

Plusieursisoformes différentes de MR1 ont été identifiées. De nombreuses protéines identifiées ont un codon de STOP prématuré qui génère desprotéines non fonctionnelles. L'isoforme MR1B n'a pas le domaine α3 et est exprimé à lasurface des cellules indépendamment de lamicroglobuline β2. Certaines bactéries sont capables de cibler desmicroglobulines β2 spécifiques qui permettent la présentation duCMH I. Cela pourrait être un mécanisme utilisé pour éviter l'évasion immunitaire bactérienne lors d'infections bactériennes.

Présentation de l'antigène

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Laprotéine MR1 est capable de se lier à desmolécules issues de labiosynthèsebactérienne de lariboflavine, puis de les présenter auMAIT déclenchant leur activation[8].

Le corps humain ne peut pas synthétiser la plupart desvitamines, ainsi la présence d'intermédiaires de synthèse de lariboflavine est un marqueur du non-soi. A l'inverse la plupart desbactéries sont capables de cette synthese[9],[10].

MR1 est presque indétectable dans des conditions physiologiques, l'expression de surface augmente dans les cellules infectées grâce à la stabilisation du complex MR1-antigen. Le premier ligand MR1 découvert était la 6-formyl ptérine (6-FP)[11].

Notes et références

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  1. ab etcGRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000153029 -Ensembl, May 2017
  2. ab etcGRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000026471 -Ensembl, May 2017
  3. « Publications PubMed pour l'Homme », surNational Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  4. « Publications PubMed pour la Souris », surNational Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  5. a etbS. HarshaKrovi et LaurentGapin, « Structure and function of the non-classical major histocompatibility complex molecule MR1 »,Immunogenetics,vol. 68,no 8,‎,p. 549–559(ISSN 1432-1211,PMID 27448212,PMCID 5091073,DOI 10.1007/s00251-016-0939-5,lire en ligne, consulté le)
  6. (en) H. E. McWilliam et J. A. Villadangos, « How MR1 Presents a Pathogen Metabolic Signature to Mucosal-Associated Invariant T (MAIT) Cells »,Trends in Immunology,vol. 38,no 9,‎,p. 679-689(DOI 10.1016/j.it.2017.06.005).
  7. a etbEmmanuelTreiner, LivineDuban, SeiamakBahram et MirjanaRadosavljevic, « Selection of evolutionarily conserved mucosal-associated invariant T cells by MR1 »,Nature,vol. 422,no 6928,‎,p. 164–169(ISSN 0028-0836,PMID 12634786,DOI 10.1038/nature01433,lire en ligne, consulté le)
  8. « MR1 presents microbial vitamin B metabolites to MAIT cells »,Nature,vol. 491,no 7426,‎,p. 717–723(PMID 23051753,DOI 10.1038/nature11605,Bibcode 2012Natur.491..717K)
  9. « The Immunology of CD1- and MR1-Restricted T Cells »,Annual Review of Immunology,vol. 34,no 1,‎,p. 479–510(PMID 26927205,DOI 10.1146/annurev-immunol-032414-112008)
  10. StefaníaMagnúsdóttir, DmitryRavcheev, Valériede Crécy-Lagard et InesThiele, « Systematic genome assessment of B-vitamin biosynthesis suggests co-operation among gut microbes »,Frontiers in Genetics,vol. 6,‎,p. 148(ISSN 1664-8021,PMID 25941533,PMCID 4403557,DOI 10.3389/fgene.2015.00148,lire en ligne, consulté le)
  11. « Structure and function of the non-classical major histocompatibility complex molecule MR1 »,Immunogenetics,vol. 68,no 8,‎,p. 549–559(PMID 27448212,PMCID 5091073,DOI 10.1007/s00251-016-0939-5)
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