Il a travaillé dans divers postes à l'institut de physique jusqu'en 1900, où il est devenu professeur non salarié à l'université de Göttingen. Il a travaillé dans les départements de physique de plusieurs universités, dont l'université de Greifswald, jusqu'en 1922. En 1919, il a reçu leprix Nobel de physique pour sa« découverte de l'effet Doppler et du dédoublement desraies spectrales par les champs électriques » (ce dernier effet est connu sous le nom d'effet Stark).
Dès l'arrivée des nazis au pouvoir en Allemagne en 1933, Stark est nommé président de l'Institut physico-technologique (Physikalische-technische Reichsanstalt), puis en 1934 président de laDeutsche Forschungsgemeinschaft[2]. Il conserve ces postes jusqu'à sa retraite en 1939. Stark a publié plus de 300 articles, principalement sur l'électricité.
Pendant le régimenazi, il a essayé (avecPhilipp Lenard) de promouvoir une physique allemande (Deutsche Physik ou « physique aryenne », mouvement contre la « physique juive » d'Albert Einstein).
Il s'est marié avec Luise Uepler, et ils ont eu cinq enfants.
Klaus Hentschel(de) (Hrsg.)Physics and National Socialism. An Anthology of Primary Sources. Birkhäuser-Verlag, Basel, 1996; 2. Aufl. 2011,(ISBN3-0348-0202-1)
Klaus Hentschel:Zur Mentalität deutscher Physiker der frühen Nachkriegszeit: 1945–1949, Heidelberg: Synchron, 2005, insb. S. 90–95.
Dieter Hoffmann(de):„Johannes Stark – eine Persönlichkeit im Spannungsfeld von wissenschaftlicher Forschung und faschistischer Ideologie“. Philosophie und Naturwissenschaften in Vergangenheit und Gegenwart, H. 22, Berlin 1982, S. 90–101.
Andreas Kleinert:Das Spruchkammerverfahren gegen Johannes Stark. In:Sudhoffs Archiv. Band 67, Nr. 1, Wiesbaden 1983, S. 13–24.
Andreas Kleinert:Die Axialität der Lichtemission und Atomstruktur. Johannes Starks Gegenentwurf zur Quantentheorie. In:Chemie – Kultur – Geschichte. Festschrift fürHans-Werner Schütt anlässlich seines 65. Geburtstages. Berlin/Diepholz 2002, S. 213–222.
Andreas Kleinert(de):Lenard, Stark und die Kaiser-Wilhelm-Gesellschaft. Auszüge aus der Korrespondenz der beiden Physiker zwischen 1933 und 1936. In:Physikalische Blätter. Band 36, Nr. 2, 1980, S. 35–42online
Lothar Mertens(de):„Nur politisch Würdige“. Die DFG-Forschungsförderung im Dritten Reich 1933–1937. Akademie-Verlag, Berlin 2004,(ISBN3-05-003877-2), S. 71–117.
Mark Walker(de):Nazi Science. Myth, Truth, and the German Atomic Bomb. Perseus Publ., Cambridge (Mass.) 1995,(ISBN0-7382-0585-0).
Paul Trommsdorff:Der Lehrkörper der Technischen Hochschule Hannover 1831–1931. Technische Hochschule Hannover, Hannover 1931, S. 31.
(en)Biographie sur le site de lafondation Nobel (le bandeau sur la page comprend plusieurs liens relatifs à la remise du prix, dont un document rédigé par la personne lauréate — leNobel Lecture — qui détaille ses apports)