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Jmol

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Jmol
Description de l'image J(S)mol_logo_2013.svg.
Description de cette image, également commentée ci-après
Molécule deStreptavidine.
Informations
Développé parL'équipe de développement de Jmol
Dernière version16.3.7 ()[1]Voir et modifier les données sur Wikidata
Dépôtsourceforge.net/p/jmol/code/HEAD/treeVoir et modifier les données sur Wikidata
Écrit enJavaVoir et modifier les données sur Wikidata
EnvironnementMultiplate-forme
Formats lusProtein Data Bank(en),Crystallographic Information File, MDL Molfile(en),Chemical Markup Language,Simplified Molecular Input Line Entry Specification etFormat .xyzVoir et modifier les données sur Wikidata
LanguesMultilingue[2]
TypeChemo-informatique
LicenceGNU Lesser General Public License
Documentationjmol.sourceforge.net/docsVoir et modifier les données sur Wikidata
Site webjmol.sourceforge.net

modifier -modifier le code -voir Wikidata(aide)

Jmol est unlogiciel libre devisualisation de structures chimiques en 3D. Il est principalement utilisé par les étudiants, les professeurs et les chercheurs enchimie et enbiologie structurale. Il est développé enJava et est multi-plateformes. Ainsi, il fonctionne sous Windows, Mac OS X, Linux et les systèmes Unix.

Caractéristiques

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Le logiciel est disponible sous trois formes :

  • Une application indépendante ;
  • Un kit logiciel pour intégrer Jmol dans d'autres applications Java ;
  • Uneapplet Java qui peut être intégrée au sein depage Web et qui offre de nombreuses possibilités de visualiser des molécules.

Le logiciel Jmol supporte de nombreux modes de visualisation :

  • Boule et bâton (ball and stick) ;
  • Remplissage CPK (space filling) ;
  • Ruban (ribbon) ;
  • etc.

De plus, Jmol peut lire de nombreux formats de fichiers, y compris les fichiersProtein Data Bank (pdb),Crystallographic Information File (cif), MDL Molfile (mol) etChemical Markup Language (CML).

L'applet Jmol offre une alternative libre et multiplate-forme au plugin Chime[3], qui n'est plus maintenu. Bien que possédant de nombreuses fonctions qui ne sont pas disponibles dans Chime, le logiciel Jmol n'a pas pour objectif de fournir toutes les fonctionnalités de Chime (en particulier, le modeSculpt). Chime nécessite l'installation d'un plugin etInternet Explorer 6.0 ou Firefox 2.0 avec le système Microsoft Windows, ou OS 9/Netscape Communicator 4.8 avec le système Macintosh. Jmol nécessite l'installation de Java et fonctionne sur une grande variété de plates-formes. Par exemple, Jmol est entièrement fonctionnel avecMozilla Firefox, Internet Explorer, Opera etGoogle Chrome sur le système Microsoft Windows, Mozilla Firefox sur le système Linux et Safari sur le système Mac OS X.

Références

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  1. ↑« Jmol / Version 16.3 / Jmol 16.3.7 »(consulté le)
  2. ↑Traductions de Jmol
  3. ↑(en) A.Herraez,Biomolecules in the Computer: Jmol to the Rescue,vol. 34,t. 4,, 7 p.(présentation en ligne,lire en ligne)

Voir aussi

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Sur les autres projets Wikimedia :

  • Jmol, surWikimedia Commons

Articles connexes

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Liens externes

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Formats de fichiers
Logiciels
Revues
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