Pour l’article homonyme, voirIndigène.
Enbiogéographie, uneespèce, untaxon ou unepopulation est définie commeindigène (ouautochtone) à une région donnée ou à unécosystème si sa présence dans cette région est le résultat de processus naturels, sans intervention humaine. Chaqueorganisme sauvage (par opposition à un organismedomestiqué) a sa propre distribution dans laquelle il est considéré comme indigène. À l'extérieur de cette zone de distribution naturelle, une espèce peut être introduite par l'activité humaine ; c'est alors uneespèce introduite.
Enbotanique, l'indigénat caractérise un taxon, une population ou un groupement végétal dont la présence dans le lieu où il se trouve aujourd'hui est tellement ancienne (notion d'archéophyte) qu'on ne peut présupposer de son caractère natif ou introduit[1].
L'indigénat et l'endémisme sont des notions très distinctes qui ne doivent pas être confondues. Enbiologie et enécologie, une espèce (ou un autretaxon) est dite indigène d'une région quand elle est présente naturellement dans cette région. Une espèce (ou un autre taxon) est diteendémique d'une région délimitée quand elle n'est présente naturellement que dans cette région, n'étant présente nulle part ailleurs de manière naturelle. Une espèce endémique est donc strictement restreinte à la région précisée, alors qu'une espèce indigène d'une région peut aussi l'être dans d'autres régions.
Exemples :
Les termes indigène et endémique qualifiant une espèce n'impliquent pas qu'une population ou un individu de cette espèce le soit également, car il peut s'agir d'une population ou d'un individu introduit ou réintroduit.
Exemple :
De plus, une espèce considérée comme indigène ou endémique d'une région délimitée ne l'est pas forcément dans toute cette région.
Exemple :
Le terme autochtone est, quant à lui, un synonyme d'indigène en biologie et en écologie.
