La ville a été créée sur l'emplacement d'un fort en1798. Après la création en1803 de Kislovodsk plus au sud, le lieu devint une colonie cosaque. En1810 le docteurFriedrich Joseph Haass vanta les vertus des eaux de source de l'endroit après en avoir fait l'analyse, ce qui lança la réputation de l'endroit en tant questation thermale. En1839 un premier établissement de bains était créé. Le vice-régent du Caucase ordonna la construction de la ville et à la fin desannées 1840 l'eau du lieu était mise en bouteille et distribuée dans toute la Russie. Le nombre de curistes augmenta régulièrement : 5 000 en1883, 13 000 en1900 et 36 800 en1913. Après une pause liée à laguerre civile, l'extension de la ville de cure continua : en1925 sixsanatoriums accueillaient 13 000 patients. Pendant laSeconde Guerre mondiale, la ville fut brièvement occupée par l'Allemagne nazie à la fin de1942.
Uneattaque terroriste est survenue le 5 décembre 2003 à Iessentouki : une explosion dans un train de banlieue a tué au moins 46 personnes et en a blessé plus de 170 autres[2].