Issu d'un clan du nord, il rejoint les rebelles duFrolinat contre le gouvernement tchadien dominé par le sud dans lapremière guerre civile tchadienne.Le, dans la région duTibesti, Hissène Habré et ses rebelles enlèvent un médecin allemand et l'archéologue françaiseFrançoise Claustre qui ne sera libérée que le en même temps que son mari Pierre Claustre, lui-même enlevé le. Hissène Habré est tenu pour responsable de la torture et de l'exécution sommaire le de l'émissaire envoyé par legouvernement français pour négocier leur libération, lecommandant Galopin. En raison d'une rupture avecGoukouni Oueddei, un autre commandant rebelle, Habré et son armée rebelle, lesForces armées du Nord (FAN), s'allient brièvement avec le gouvernement deFelix Malloum avant de se retourner contre ce dernier. Sous les termes desaccords de Lagos en 1979, Malloum démissionne et Habré est nommé ministre de la Défense dans leGouvernement d'union nationale de transition (GUNT) avec Oueddei comme président. Leur alliance s'est effondrée rapidement, menant à unedeuxième guerre civile qui s'achève en 1982, quand les forces de Habré renversent Oueddei.
Devenu le nouveau président du Tchad, Habré impose une dictature àparti unique gouvernée par sonUnion nationale pour l'indépendance et la révolution (UNIR), sous laquelle le pays éprouve une violation généralisée des droits de l'homme. Il reçoit le soutien de la France et des États-Unis tout au long de son régime en raison de son opposition au dirigeant libyenMouammar Kadhafi. Il dirige le pays pendant leconflit tchado-libyen, aboutissant à la victoire en 1987 dans laguerre des Toyota avec lesoutien français. Il est renversé en 1990 par uncoup d'État fomenté par son ancien généralIdriss Déby et s'enfuit en exil auSénégal. Un décret tchadien de 1990 met en place une commission nationale d’enquête visant les crimes commis par l’ex-président, et ses complices. En, cette commission publie un rapport d’après lequel le régime Habré aurait fait au moins 40 000 morts[2].
Après la fin de ses longues études en 1972, Hissène Habré repart au Tchad et rejoint leFrolinat, puis fonde lesForces armées nationales du Tchad (FANT), aujourd'hui disparues sous ce nom.
Le, dans la région duTibesti, des rebellestoubous commandés par Hissène Habré enlèvent un médecin allemand libéré en 1975 contre le versement d'une rançon, un coopérant français Marc Combe qui réussit à s'échapper et l'archéologueFrançoise Claustre qui sera libérée le en même temps que son mari Pierre Claustre, lui-même enlevé le. Hissène Habré est tenu pour responsable de la torture et de l'exécution sommaire le de l'émissaire envoyé par legouvernement français pour négocier leur libération, lecommandant Galopin.
Hissène Habré est le fondateur du Conseil de commandement des forces armées du Nord (CCFAN), devenuForces armées du Nord (FAN).
Face au présidentGoukouni Oueddei, allié de laLibye, il a le soutien de la France et des États-Unis. L'élection deFrançois Mitterrand en 1981 change la donne : celui-ci cherche une solution négociée avec le gouvernement tchadien et diminue le soutien aux rebelles. Ces derniers bénéficient cependant toujours de l'aide discrète duSDECE — les services de renseignement français — et de mercenaires dirigés parBob Denard[10]. Finalement, le refus de la Libye de retirer son armée du nord du pays (le Tchad et la Libye avaient proclamé leur fusion en), conduit Washington, qui voyaient enMouammar Kadhafi leur principal ennemi dans la région, à intensifier leur aide aux rebelles et la capitale est prise en[10].
Hissène Habré renverse Goukouni Oueddei le pour occuper le poste de président de la République. Le poste de Premier ministre est supprimé le et plusieurs opposants politiques sont exécutés. Habré transforme les FAN en armée régulière (FANT), puis crée unepolice politique, laDirection de la documentation et de la sécurité (DDS), responsable de milliers d'enlèvements et d'assassinats politiques.
LeGouvernement d'Union nationale de transition (GUNT), animé parGoukouni Oueddei, chassé du pouvoir par les forces d'Hissène Habré, se retire dans le nord du Tchad. Il est aidé par laLibye qui annexe depuis 1973 labande d'Aozou. La guerre s'aggrave en 1983 avec l'avancée du GUNT en direction de la capitale. L’armée française intervient dès août 1983 pour soutenir Habré dans cette offensive (opération Manta, puisopération Épervier), qui aboutit en mars 1987 à la reconquête du nord. Durant le conflit, les États-Unis ont utilisé une base clandestine au Tchad pour entraîner des centaines soldats libyens capturés et les organiser en force anti-Kadhafi. Ils auraient également fourni un soutien militaire et organisationnel à la DDS.
L'aide de la France et des États-Unis a été décisive[11]. L'occupation libyenne a pris fin en. Uncessez-le-feu a été signé en, consacrant la victoire d'Habré. Les relations diplomatiques entre la Libye et le Tchad ont été rétablies en octobre 1988.
Entre 1982 et 1985, les mouvements d'autodéfenses créés dans le sud sont brutalement réprimés. Lors du « septembre noir » de 1984 des villages entiers sont pillés et incendiés. En 1987, une rébellion Hadjaraï est écrasée dans le sang. La répression est également confiée à la Direction de la documentation et de la sécurité, dont des membres sont formés par la DGSE française, qui arrête toute personne suspectée de soutenir l'opposition[10]. Hissène Habré conserve le soutien de la France jusqu'en 1990 : outre l'aide militaire directe, il reçoit un soutien financier, d'une assistance technique et des formations pour son armée. L'influence des États-Unis est cependant de plus en plus forte, ce qui embarrasse Paris, qui entend rester maitre dans sonpré carré[10].
Hissène Habré, considérant que son régime est soutenu par les États-Unis, se détourne de la France, pensant ne plus avoir besoin de son appui. Le généralIdriss Déby le renverse alors le, le directeur de la DGSEClaude Silberzahn ayant convaincu le présidentMitterrand de placer au pouvoir Idriss Déby en abandonnant Hissène Habré qui trouve refuge auSénégal[12],[13].
Hissène Habré est soupçonné d'être responsable de la mort de presque 40 000 personnes. En, après le renversement du régime Habré, plusieursfosses communes ont été découvertes à 25 km de lacapitale. Certaines fosses contenaient jusqu'à 150 squelettes des détenus exécutés par la tristement célèbre police politique (DDS). Le rapport de la commission d'enquête comptabilise quelque 80 000 orphelins produits par la terreur du régime Habré.
Des poursuites contre lui sont engagées en Belgique en application de la loi decompétence universelle qui, bien qu'abrogée en 2003, s'applique dans ce cas précis (certains plaignants ayant acquis la nationalité belge). Unmandat d'arrêt international, assorti d'une demande d'arrestation immédiate, est délivré par la justice belge le et transmis aux autorités sénégalaises[14]. Après son arrestation le 15 novembre et une garde à vue de quelques jours, Hissène Habré est relâché, la justice sénégalaise s'étant finalement déclarée incompétente et l'affaire portée au niveau de l'Union africaine.
En, leSénégal est mandaté par l'Union africaine pour juger Hissène Habré pourcrimes contre l'humanité,crimes de guerre etactes de torture. Le Sénégal a alors engagé une série de réformes législatives et adopté un amendement constitutionnel afin de juger l'ancien dictateur tchadien. Les autorités sénégalaises ont cependant suspendu leur action judiciaire à la prise en charge, par la communauté internationale en général et à l'Union africaine en particulier[15], de la totalité des fonds nécessaires pour le procès, estimée à 27,4 millions d'euros[16].
Le,Reed Brody, s'appuyant sur les témoignages recueillis par l'Association des victimes des crimes et répressions politiques que présideSouleymane Guengueng, annonce l'imminence de son procès[17]. Le, il est placé en garde à vue dans le cadre d'une enquête ouverte par un tribunal spécial devant le juger[18]. C'est un soulagement pour beaucoup de victimes, qui attendaient la tenue de ce procès. Le cinéaste tchadienMahamat Saleh Haroun réalise un documentaire intituléHissein Habré une tragédie nationale[19], consacrant une grande partie du film aux rescapés de cette barbarie[20].
Hissène Habré est jugé à partir du, àDakar par lesChambres africaines extraordinaires, juridiction spéciale créée par leSénégal et l’Union africaine[21] considérée par certains experts comme étant la juridiction la plus nationale des tribunaux internationaux[15]. Ce procès n'aurait pas pu avoir lieu sans l'intervention de l'avocatReed Brody, un des conseillers et porte-parole deHuman Rights Watch[22], et sans l'action de laBelgique, qui avait saisi laCour internationale de justice (CIJ) en 2009 d'une action contre le Sénégal pour son abstention à juger ou extrader Hissène Habré conformément à ce que prévoit laConvention des Nations unies contre la torture qui liait les deux États : le, la CIJ, à l'unanimité des 17 juges, donne raison à la Belgique et déclare que le Sénégal est obligé de poursuivre Hissène Habré ou, à défaut, de l'extrader vers tout État qui veut le poursuivre pénalement[23].
Pour défendre les 4 000 victimes, le collectif des avocats est coordonné par l'avocate tchadienneJacqueline Moudeina[24].
Hissène Habré a faitappel de sa condamnation : ce nouveau procès débute le[27]. Le, les Chambres extraordinaires africaines annoncent le maintien de la condamnation à la prison à perpétuité, peine qu'il purgera au Sénégal ou dans un autre pays de l'Union africaine. En outre, la Chambre d'appel fixe le montant des dommages que Hissène Habré devra verser à 82 milliards 290 millions defrancs CFA[28] (environ 125 millions d'euros).
À la suite d'une demande de son avocat arguant des risques pour sa santé en raison de lapandémie de Covid-19 et de son âge avancé, Hissène Habré est placé le enrésidence surveillée pour60 jours[29],[30].
Le, il retourne en prison[31]. En, la justice sénégalaise refuse une demande de libération[32].
Le, alors qu'il est hospitalisé àDakar pour des complications dues auCovid-19, l'ancien président Hissène Habré s'éteint, à l'âge de79 ans[33],[34]. Il est enterré au cimetière musulman deYoff deux jours plus tard[1].
Mady Marie Bouaré,L'affaire H. Habré et l'affaire duJoola : une justice pénale controversée ?, L'Harmattan, Paris, 2011, 121 p.(ISBN978-2-296-54873-2).
Reed Brody,La traque d'Hissène Habré - Juger un dictateur dans un monde d'impunité, Karthala, Paris, 2024, 300 p.(ISBN978-2-38409-1133)..
(*) Président par intérim (**) Président du Gouvernement d'union nationale de transition (***) Président de la République, président du Conseil militaire de transition