Ce qui est en revanche certain, c'est qu'il a une épouse nomméeNedjemet mentionnée avec le titre de « Grande Épouse Royale » (Hm.t-nsw.t-wr.t) en tant qu'épouse d'Hérihor sur une stèle d'Abydos montrant Hérihor en tant que grand prêtre d'Amon et des reliefs dans letemple de Khonsou àKarnak[3], où Hérihor est à la fois représenté en tant que grand prêtre d'Amon (salle hypostyle) et roi (cour)[3].
Il est représenté avec son épouse Nedjemet ainsi que dix-neuf fils (dont Ânkhefenmout) et cinq filles, rien n'indique qu'elle est la mère de tous ces enfants[4],[5].
Si laNedjemet dont on a retrouvé la momie dans la cachette DB320 et qui est mère d'un roi est bien l'épouse d'Hérihor, et non sa mère comme le suggère Ad Thijs[2], alors Hérihor est peut-être le père d'un roi. Une autre interprétation fait de cetteNedjemet l'épouse de Piânkh puis, une fois veuve, l'épouse d'Hérihor, et son titre de « mère du roi » viendrait du fils qu'elle a eu lors de son premier mariage, à savoirPinedjem Ier[6], Hérihor serait doncseulement le beau-père d'un roi.
Hérihor, qu'on a parfois fait le prédécesseur dePiânkh (Gaston Maspero par exemple), fautivement semble-t-il, devient l'homme fort de Thèbes à la mort dePiânkh et reprend l'ensemble des fonctions de ce dernier, incluant le titre degrand prêtre d'Amon etfils royal de Koush. Hérihor fait d'ailleurs décorer la salle hypostyle dutemple de Khonsou àKarnak en représentantRamsès XI, même si Hérihor se présente comme l'égal du roi. Il est à noter qu'aucun des documents d'Hérihor ne mentionne de date ou l'èreOuhem-mésout, ce qui a fait croire à certains qu'il était grand prêtre d'Amon puis roi sous le règne deRamsès XI[7].
À la mort en toute discrétion deRamsès XI vers 1069 avant l'ère commune, Hérihor continue derégner à Thèbes en tant quegrand prêtre d'Amon etfils royal de Koush tandis queSmendès se proclame roi à Tanis. Ainsi, avec la constitution d'un pouvoir militaro-religieux dans le sud du pays et le maintien d'une monarchie affaiblie au nord : ce sera la création d'une véritable dyarchie asymétrique (les grands prêtres d'Amon au sud ne se proclameront rois qu'au début de la période)[8].
L'activité d'Hérihor se concentre en grande partie à restaurer des monuments, comme ledromos en face duXepylône dutemple d'Amon deKarnak, ou encore la salle hypostyle de ce même temple. Hérihor est également le commanditaire d'une nouvelle barque pour les processions solennelles d'Amon, évènement qu'il fera représenter sur les parois de la cour dutemple de Khonsou, sur lesquelles il se présente en tant que roi. Le voyage entrepris par Ounamon, tel qu'il l'a décrit dans sonrapport, est d'ailleurs de récupérer du bois decèdre du Liban àByblos, mais non seulement un, le roi lui demande de payer ce bois, mais aussi deux, les piratesSikala de la côtepalestinienne l'attaquent en chemin, montrant ainsi clairement la perte totale de domination de la région par les Égyptiens[10].
