Elle a été l'épouse de l'acteurGabriel Byrne de1988 à1999. Ensemble ils ont deux enfants : Jack Daniel (né en 1989) et Romy Marion (née en 1992). Ellen Barkin a également été la compagne de l'acteurJohnny Depp en 1994[3].
Elle fut également mariée au magnat américain milliardaireRonald Perelman de 2000 à 2006. Leur divorce fut l'occasion d'une véritable bataille au sujet de la pension alimentaire devant être versée à l'actrice, estimée à 60 millions de dollars.
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