Il réussit à faire représenter plusieurs de ses opérettes, mais il ne connaît le succès lors de la création de son opéretteDer Vielgeliebter au Berliner Theater am Nollendorfplatz en1919. Son œuvre la plus célèbre est l'opéretteDer Vetter aus Dingsda (1921) dont beaucoup d'airs sont toujours connus aujourd'hui.
En 1926, quand son opéretteLady Hamilton a été créée àBreslau (aujourd'huiWroclaw), il entreprend une longue amitié avec le chef d'orchestre Franz Marszalek. Marszalek est un fervent défenseur de la musique de Künneke, et pendant son contrat à la Westdeutscher Rundfunk de Cologne (1949-1965), il fait de nombreux enregistrements de ses œuvres avec l'Orchestre de la Radio de Cologne et l'Orchestre symphonique de la WDR de Cologne.
Bien que reconnu pour ses opéras et opérettes, le catalogue complet de Künneke présente d'autres genres musicaux, notamment plusieursquatuors à cordes et deux concertos pour piano.
Kay Weniger:Das große Personenlexikon des Films. Die Schauspieler, Regisseure, Kameraleute, Produzenten, Komponisten, Drehbuchautoren, Filmarchitekten, Ausstatter, Kostümbildner, Cutter, Tontechniker, Maskenbildner und Special Effects Designer des 20. Jahrhunderts. Band 4:H – L. Botho Höfer – Richard Lester. Schwarzkopf & Schwarzkopf, Berlin 2001,(ISBN3-89602-340-3), S. 512.
Fred K. Prieberg:Handbuch Deutsche Musiker 1933–1945. CD-ROM-Lexikon, Kiel 2009, 2e édition, p. 4315–4319.online
Oswald Panagl(de):Zwischen den musikdramatischen Genres: Eduard Künnekes Die große Sünderin. Dans:Im Zeichen der Moderne. Musiktheater zwischen Fin de Siècle und Avantgarde. Hollitzer Verlag, Wien 2020,(ISBN978-3-99012-902-9), p. 396–402.