L'expressiondrapeau de la Moldavie peut désigner :
À la fin duXVe siècle, une bannière princière est attestée sous le règne du princeÉtienne III de Moldavie. À dominanteor,sinople etazur, elle représente une tête debovidé (aurochs oubison d'Europe, probablement pour rappeler les légendes entourant la fondation de la Moldavie par le princeDragoș), flanquée defigures stylisées dusoleil et d'uncroissant de Lune (ou d'autres symboles, tels que larosette et uneétoile), sur un fond de couleurgueules (parfoispourpre). Son envers dévoile le visage desaint Georges terrassant le Dragon. La représentation de labataille de Baia en1476 dans les chroniques deJohannes de Thurocz montre les troupes moldaves portant un fanion avec la tête d'un aurochs sur un fond de couleur non spécifié. En1574, les délégués moldaves présents au couronnement d'HenriIII arborent une bannière bleue à tête d'aurochs.
EnMoldavie comme enValachie, laRévolution de 1848 se traduit par l'adoption d'un drapeau tricolore où le bleu signifie le ciel et la liberté, le jaune d'or la prospérité (champs de blé), l'égalité ou la justice, et le rouge (sang) la fraternité. La révolution échoue et les deux principautés gardent leurs drapeaux antérieurs ; celui de la Moldavie représente une tête d'aurochs sur fond coupé de gueules et d'azur[2].
Peu après larévolution roumaine de 1848, le drapeau tricolore bleu-jaune-rouge horizontal est adopté par tous lesroumanophones, y compris enAutriche-Hongrie (bucovinins,banatéens,crichaniens,marmatiens,transylvains), dans l'Empire ottoman (dobrogéens) et dans l'Empire russe (bessarabiens). Lorsque la Moldavie occidentale et la Valachie s'unissent en1859 pour former laRoumanie, ce tricolore en devient le drapeau officiel, qui devient vertical peu après. Les roumanophones de Moldavie orientale (Bessarabie) adoptent à leur tour ce tricolore lors de l'indépendance de 1917, dans sa variante horizontale pour le distinguer de celui de la Roumanie.
Lors de l'indépendance de1991, les autorités moldaves reprennent les couleurs bleu-jaune-rouge verticales en y ajoutant cette fois les armoiries pour le distinguer de celui de la Roumanie. En1995, lorsque l'ONU demande aux États de choisir parmi plusieurs nuances de bleu, la Roumanie opte pour un bleu cobalt proche de celui de la France mais différent du tricolore roumain originel au bleu plus clair, que la Moldavie conserve. De plus les dimensions du drapeau roumain sont de 2/3 alors que celles du moldave sont de 1/2. Il y a donc actuellement trois différences entre le pavillon de la Roumanie et celui de la Moldavie : le bleu, la présence des armoiries et les proportions.
De son côté laRépublique séparatiste à majorité russophone du Dniestr, que les roumains appellent « Transnistrie », mais qui s'auto-désigne comme « République moldave du Dniestr » ou « Pridniestrovie », a conservé ledrapeau de la République socialiste soviétique moldave. Quant à la Gagaouzie, région autonome non séparatiste, elle a adopté sonpropre drapeau.
Les « moldavistes » (la quasi-totalité des russophones et la partie des roumanophones qui appellent leur langue « moldave » et ne la reconnaissent plus comme roumaine[3]) trouvent le drapeau de leur pays trop proche de celui de la Roumanie et souhaitent que la Moldavie, comme laBiélorussie adopte le drapeau qu'elle a eu à l'époque soviétique (ce qui est déjà le cas enTransnistrie, république autoproclamée à majorité russophone sur la rive gauche duDniestr, 18 % du territoire de la Moldavie).
En 2010, leparti communiste propose un nouveau drapeau bicolore horizontal rouge-bleu, inspiré de celui des années 1831-1859, avec de nouvelles armoiries reprenant la tête d'aurochs médiévale, censé concilier russophones et roumanophones[4].

Drapeau proposé par les
communistes en 2010 pour la Moldavie.
Plusieurs organisations gouvernementales ont adopté un drapeau à travers des votes duparlement ou desdécrets gouvernementaux :
Drapeau de la Défense civile et des situations d'urgence de Moldavie
Drapeau des douanes moldaves
Drapeau des gardes-frontières
En2010, trois nouveaux drapeaux gouvernementaux dérivés du drapeau national ont été adoptés. Les anciens drapeaux sont toujours conservés dans leurs bureaux respectifs.
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