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Coronaviridae

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Coronaviridées, Coronavirus

Page d’aide sur l’homonymie

Cet article concerne l'ensemble des coronavirus. Pour la sous-famille infectant des oiseaux et des mammifères dont les humains, voirOrthocoronavirinae.

Coronaviridae
Description de cette image, également commentée ci-après
Coronavirus humain.
Classification ICTV
RealmRiboviria
RègneOrthornavirae
EmbranchementPisuviricota
ClassePisoniviricetes
OrdreNidovirales
Sous-ordreCornidovirineae

Famille

Coronaviridae
ICTV1975[1]

Genres de rang inférieur

LesCoronaviridées (Coronaviridae), oucoronavirus[2],[3], sont unefamille devirus à ARN simple brin enveloppés, de sens positif.Le génome viral mesure de 26 à 32kb. Les particules, quasi sphériques, sont généralement décorées de grandes projections de surface (~ 20nm), en forme de massue ou de pétale (lespéplomères ouspikes en anglais), qui créent une image qui rappelle la couronne solaire en micrographie électronique : cette propriété est à l'origine du nom des virus de cette famille[4].

Structure

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Schéma de la structure d'un virion de coronavirus

Les extrémités 5' et 3' du génome ont unecoiffe et une« queue » poly(A), respectivement. L'enveloppe virale, obtenue par bourgeonnement à travers les membranes duréticulum endoplasmique (RE) et / ou de l'appareil de Golgi, contient invariablement deux espèces de (glyco)protéines codées par le virus, S et M. Laglycoprotéine S comprend les grandes projections de surface, tandis que la protéine M est une protéine transmembranaire.

Lestorovirus (anciennement classés dans cette famille[5]) et un sous-ensemble de coronavirus (en particulier les membres du sous-groupe A du genreBetacoronavirus) possèdent, en plus des peplomères composés de S, un deuxième type de projections de surface composé de la protéinehémagglutinine-estérase.

Une autre protéine structurelle importante est laphosphoprotéine N, qui est responsable de la symétrie hélicoïdale de lanucléocapside qui renferme l'ARN génomique.

Taxinomie

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La familleCoronaviridae est organisée en 3 sous-familles, 6 genres, 27 sous-genres et une quarantaine d'espèces[6]:

Épidémiologie et pathologie

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Les coronavirus sont transmis par voie fécale-orale ou par aérosols de sécrétions respiratoires. Ils sont présents dans le monde entier et infectent une large diversité demammifères et d'oiseaux (orthocoronavirus), mais aussi des amphibiens (letovirus) et des poissons (pironavirus)[4].

Bien que la plupart des maladies soient bénignes chez l'homme, elles peuvent parfois provoquer des situations plus graves, notamment des infections des voies respiratoires :syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS),syndrome respiratoire du Moyen-Orient (MERS) etmaladie à coronavirus 2019 (Covid-19). Ils peuvent également provoquer des infections entériques chez les très jeunes enfants et, dans de rares situations, des syndromes neurologiques.

Notes et références

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  1. ICTV. International Committee on Taxonomy of Viruses. Taxonomy history. Published on the Internet https://talk.ictvonline.org/., consulté le 1er février 2021.
  2. « Coronavirus », surAcadémie nationale de médecine(consulté le)
  3. (en) « Coronavirus », surMerriam-Webster Dictionnary,(consulté le)
  4. a etb(en) « Family: Coronaviridae », surInternational Committee on Taxonomy of Viruses,(consulté le)
  5. (en) « Taxon Details, Genus: Torovirus », surInternational Committee on Taxonomy of Viruses: ICTV(consulté le)
  6. (en) « Virus Taxonomy: 2022 Release », surICTV online,(consulté le)
  7. DOI 10.1073/pnas.0506735102
  8. DOI 10.1093/database/baaa062

Références biologiques

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v ·m
Ordre :Nidovirales
Alphaletovirus (en)
Milecovirus
Alphacoronavirus
Amalacovirus
Colacovirus
Decacovirus
Duvinacovirus
Luchacovirus
Minacovirus
Minunacovirus
Myotacovirus
Nyctacovirus
Pedacovirus
Rhinacovirus
Setracovirus
Soracovirus
Sunacovirus
Tegacovirus
Betacoronavirus
Embecovirus
Hibecovirus
Merbecovirus
Nobecovirus
Sarbecovirus
Deltacoronavirus
Andecovirus
Buldecovirus
Herdecovirus
Gammacoronavirus
Brangacovirus
Cegacovirus
Igacovirus
Alphapironavirus
Samovirus
Cette palette utilise laclassification de l'ICTV :version 2023
v ·m
Familles devirus
realm >règne >phylum >classe >ordre >famille(s)
Adnaviria (en)
Taleaviricota
Tokiviricetes
Ligamenvirales (en)
Maximonvirales
Primavirales
Duplodnaviria
Peploviricota
Herviviricetes
Herpesvirales
Uroviricota
Caudoviricetes
Crassvirales
Juravirales
Kirjokansivirales
Magrovirales
Methanobavirales
Nakonvirales
Thumleimavirales
incertae sedis
Monodnaviria
Hofneiviricota
Faserviricetes
Tubulavirales (en)
Phixviricota
Malgrandaviricetes
Petitvirales
Cossaviricota (en)
Mouviricetes
Polivirales
Papovaviricetes
Sepolyvirales
Zurhausenvirales
Quintoviricetes
Piccovirales
Cressdnaviricota (en)
Arfiviricetes (en)
Baphyvirales
Cirlivirales
Cremevirales
Gredzevirales
Jormunvirales
Mulpavirales
Recrevirales
Ringavirales
Rivendellvirales
Rohanvirales
Saturnivirales
Repensiviricetes
Geplafuvirales (en)
Saleviricota
Huolimaviricetes
Haloruvirales
Riboviria
Ambiviricota
Suforviricetes
Crytulvirales
Duplornaviricota (en)
Chrymotiviricetes
Ghabrivirales (en)
Resentoviricetes
Reovirales
Vidaverviricetes
Mindivirales
Kitrinoviricota
Alsuviricetes
Hepelivirales (en)
Martellivirales
Tymovirales (en)
Flasuviricetes
Amarillovirales
Magsaviricetes
Nodamuvirales (en)
Tolucaviricetes
Tolivirales (en)
Lenarviricota (en)
Amabiliviricetes
Wolframvirales
Howeltoviricetes
Cryppavirales
Leviviricetes (en)
Norzivirales (en)
Timlovirales (en)
Miaviricetes
Ourlivirales
Negarnaviricota
Chunqiuviricetes
Muvirales
Milneviricetes
Naedrevirales
Monjiviricetes
Jingchuvirales (en)
Mononegavirales
Yunchangviricetes
Goujianvirales
Bunyaviricetes
Elliovirales
Hareavirales
Insthoviricetes
Articulavirales
Non assignée
Pisuviricota
Duplopiviricetes
Durnavirales (en)
Pisoniviricetes
Nidovirales
Picornavirales
Sobelivirales (en)
Stelpaviricetes
Patatavirales
Stellavirales
incertae sedis
Artverviricota
Revtraviricetes
Blubervirales
Ortervirales (en)
Non assignées
Ribozyviria
Varidnaviria (en)
Nucleocytoviricota
Megaviricetes
Algavirales
Imitervirales
Pimascovirales
Non assignée
Pokkesviricetes (en)
Asfuvirales
Chitovirales
Preplasmiviricota
Ainoaviricetes
Lautamovirales
Maveriviricetes
Divpevirales
Lavidavirales
Mividavirales
Priklausovirales
Polintoviricetes
Orthopolintovirales
Tectiliviricetes (en)
Atroposvirales
Belfryvirales
Coyopavirales
Kalamavirales
Rowavirales
Vinavirales
Non assignée
Dividoviricota
Laserviricetes
Halopanivirales
Non assignée
incertae sedis
Naldaviricetes (en)
Lefavirales (en)
Non assignées
Autres
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