Cet article concerne l'ensemble des coronavirus. Pour la sous-famille infectant des oiseaux et des mammifères dont les humains, voirOrthocoronavirinae.
LesCoronaviridées (Coronaviridae), oucoronavirus[2],[3], sont unefamille devirus à ARN simple brin enveloppés, de sens positif.Le génome viral mesure de 26 à 32kb. Les particules, quasi sphériques, sont généralement décorées de grandes projections de surface (~ 20nm), en forme de massue ou de pétale (lespéplomères ouspikes en anglais), qui créent une image qui rappelle la couronne solaire en micrographie électronique : cette propriété est à l'origine du nom des virus de cette famille[4].
Les extrémités 5' et 3' du génome ont unecoiffe et une« queue » poly(A), respectivement. L'enveloppe virale, obtenue par bourgeonnement à travers les membranes duréticulum endoplasmique (RE) et / ou de l'appareil de Golgi, contient invariablement deux espèces de (glyco)protéines codées par le virus, S et M. Laglycoprotéine S comprend les grandes projections de surface, tandis que la protéine M est une protéine transmembranaire.
Lestorovirus (anciennement classés dans cette famille[5]) et un sous-ensemble de coronavirus (en particulier les membres du sous-groupe A du genreBetacoronavirus) possèdent, en plus des peplomères composés de S, un deuxième type de projections de surface composé de la protéinehémagglutinine-estérase.
Une autre protéine structurelle importante est laphosphoprotéine N, qui est responsable de la symétrie hélicoïdale de lanucléocapside qui renferme l'ARN génomique.
Les coronavirus sont transmis par voie fécale-orale ou par aérosols de sécrétions respiratoires. Ils sont présents dans le monde entier et infectent une large diversité demammifères et d'oiseaux (orthocoronavirus), mais aussi des amphibiens (letovirus) et des poissons (pironavirus)[4].
Bien que la plupart des maladies soient bénignes chez l'homme, elles peuvent parfois provoquer des situations plus graves, notamment des infections des voies respiratoires :syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS),syndrome respiratoire du Moyen-Orient (MERS) etmaladie à coronavirus 2019 (Covid-19). Ils peuvent également provoquer des infections entériques chez les très jeunes enfants et, dans de rares situations, des syndromes neurologiques.