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Enbiochimie, uncofacteur est uncomposé chimique non protéique mais qui est nécessaire à l'activité biologique d'uneprotéine, le plus souvent uneenzyme. Les cofacteurs interviennent fréquemment dans la réactioncatalytique et peuvent être considérés comme des « molécules d'assistance » aidant aux transformations biochimiques.
Les cofacteurs peuvent être classés en deux catégories :
Certaines sources limitent l'usage du terme « cofacteur » aux substances inorganiques[3],[4]. Le rôle des ions métalliques est d'interprétation délicate : certains semblent peu importants (Mg2+ dans l'ATP), d'autres sont essentiels et centraux à laréaction enzymatique (Fe2+ ou Fe3+ dans les oxydoréductases) rendant la notion de cofacteur discutable.
Une enzyme inactive, sans cofacteur, est appeléeapoenzyme ; alors que l'enzyme « complète », avec cofacteur, est appeléeholoenzyme[réf. nécessaire].
Certaines enzymes ou certains complexes enzymatiques nécessitent plusieurs cofacteurs, comme le complexe multi-enzymatiquepyruvate déshydrogénase[5]. Ce complexe enzymatique au carrefour de laglycolyse et ducycle de Krebs requiert cinq cofacteurs organiques, des groupements prosthétiques lathiamine pyrophosphate (TPP), lelipoamide et laflavine adénine dinucléotide (FAD), des coenzymes libres ou liées faiblementnicotinamide adénine dinucléotide (NAD+) et un coenzyme lié à un substrat lecoenzyme A (CoA), et un cofacteur ion métallique (Mg2+).
Les cofacteurs organiques sont souvent desvitamines ou des dérivés de vitamines. Beaucoup contiennent lenucléotideadénosine monophosphate (AMP) dans leur structure, comme l'ATP, lecoenzyme A, laFAD etNAD+. Cette structure commune peut refléter une origine évolutive commune en tant qu'élément deribozymes dans une anciennebiologie basée sur l'ARN[réf. nécessaire]. L'hypothèse a été faite que la partie AMP de lamolécule pourrait être considérée comme une sorte de « poignée » par laquelle l'enzyme peut « saisir » le coenzyme et le faire basculer entre les différents centres catalytiques[6].
| Types | EC 1Oxydoréductases : |
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