La saison 1939 duChampionnat du Pérou de football est la onzième édition du championnat de première division auPérou. Les huit clubs participants sont regroupés au sein d'une poule unique où ils s'affrontent deux fois au cours de la saison, à domicile et à l'extérieur. À la fin de la compétition, le dernier du classement est relégué et remplacé par le meilleur club deSeguinda Division, la deuxième division péruvienne.
C'est le club d'Universitario de Deportes qui remporte la compétition après avoir terminé en tête du classement final du championnat, avec trois points d'avance surSucre FC et quatre sur le tenant du titre,Club Centro Deportivo Municipal. C'est le troisième titre de champion du Pérou de l'histoire du club.
Le barème utilisé pour établir le classement est le suivant :
- Victoire : 3 points
- Match nul : 2 points
- Défaite : 1 point
- Forfait ou abandon : 0 point
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{{{titre}}} | Champion du Pérou 1939 | | Relégation enSegunda Division | | (T) : Tenant du titre (P) : Promu deSegunda Division | |
Football au Pérou  |
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| Organismes et structures | Fédération |
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Championnats nationaux de première division 1938-1939 à travers le monde |
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Championnats nationaux de première division 1939-1940 à travers le monde |
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