Birsk a été fondée en1663 à l'emplacement d'un ancien village détruit, Aleksandrovskoïe. En1774, elle fut prise par les insurgés conduits parSalavat Ioulaïev et fut entièrement incendiée. Elle fut ensuite reconstruite. Birsk se développa ensuite comme centre de commerce, riche de sa diversité culturelle, au nord de la Bachkirie. Elle a le statut de ville depuis1781.