Andijan était une étape importante sur laroute de la soie, se trouvant approximativement à mi-chemin entreKachgar etKhodjent.
La ville est connue également comme le lieu de naissance de ZahiruddinBâbur (1483-1530), le fondateur de ladynastie moghole enInde. Un musée, inauguré en 1989, lui est consacré à Andijan.
Elle entre dans l'Empire russe en 1876 après la défaite dukhanat de Kokand et fait partie de laprovince de Ferghana, dont elle est une ville de district. Un soulèvement contre les autorités impériales a lieu en 1898. La ville est gravement endommagée par untremblement de terre en 1902 et près de quatre mille habitants trouvent la mort.
L'ancien Andijan est situé au sud-est de la vallée de Fergana, entouré de collines pittoresques. Cette ville est fière de sa vénération de 2000 ans, et d'être la ville natale du célèbre poète et commandant, Mohammed ZahiruddinBabur, qui représente la grande dynastie deTamerlan, le père de l'empire moghol en Inde. Aujourd'hui, la maison de Babur à Andijan peut être visitée[2].
À l'époque soviétique, la vallée de la Ferghana est partagée entre trois républiques socialistes soviétiques d'Asie centrale.Andijan fait partie de laRSS d'Ouzbékistan. La vallée et les républiques sont surtout prises par la culture intensive ducoton. Pendant la Seconde Guerre mondiale (appelée iciGrande Guerre patriotique), un grand nombre de citoyens soviétiques est déplacé et évacué enAsie centrale et Andijan accueille sa part de réfugiés. La chute de l'URSS en 1991 provoque l'écroulement de l'économie avec la fermeture des entreprises dont le modèle économique est devenu obsolète. Les habitants russophones et qualifiés quittent la ville. Les années 1990 sont celles de la prise de pouvoir de clans liés à des intérêts économiques et la population s'appauvrit dramatiquement. En réaction, des groupuscules islamiques radicaux se forment. Les frontières ferment par période pour empêcher l'infiltration de bandes, mais cela ne fait qu'augmenter la crise. En, un fondamentaliste islamiste, Azizbek Karimov, est arrêté sous l'accusation de préparer un attentat terroriste fomenté par lemouvement islamique d'Ouzbékistan. Il est inculpé et exécuté en.
Dans la nuit du 12 au, un commando prend d'assaut une prison à Andijan pour libérer plusieurs centaines de personnes dont 23 hommes d'affaires, accusés deterrorismeislamiste. Ils occupent plusieurs bâtiments publics et établissent une tribune où plusieurs habitants prennent la parole et dénoncent la pauvreté et la dictature. Pour réprimer l'insurrection, les autorités envoient l'armée, qui ouvre le feu sur la manifestation. Cette version est récusée par les autorités, qui y voient une tentative de déstabilisation, et déclarent qu'aucun civil non armé n'a été touché[3].
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