Meritorjuntaohjus on pinta-alusten tuhoamiseen tarkoitettuohjus. Useimmat meritorjuntaohjukset ovat lähellä merenpintaa lentäviä, nopeudeltaan alle äänennopeuden ja ovat inertia- ja tutkaohjautuvia. Meritorjuntaohjus voidaan laukaistalentokoneesta, laivasta, sukellusveneestä tai maalla sijaitsevasta laukaisualustasta.Ohjusvene on meritorjuntaohjuksin käytävään taisteluun kehitetty pieni 200–300 tonnin sota-alus.
Meritorjuntaohjuksia voidaan torjua ohjustentorjuntaohjuksilla, kutenSea Sparrow jaSea Wolf taikonetykkijärjestelmillä, kutenPhalanx CIWS sekä erilaisilla harhautusjärjestelmillä.