Perrin syntyiLillessä ja opiskeli siellä École Normal Supérieuressa. Hän väitteli vuonna 1897röntgen- jakatodisäteistä, ja pääsi Sorbonneen lehtoriksi. Vuonna 1910 hänestä tuli professori, ja jatkoi tässä virassa kunnes saksalaisetvalloittivat maan 1940.[2]
Perrin tutki nesteeseen liuenneiden hiukkasten Brownin liikettäultramikroskoopilla, ja vahvisti havainnoillaanAlbert Einsteinin teorian atomien olemassaolosta.[3]
Ensimmäisessä maailmansodassa Perrin oli pioneerijoukkojen upseeri. Saksalaisten miehittäessä Ranskan Perrin pakeni Yhdysvaltoihin, missä hän kuoli 1942.[2]