Simonyi syntyi Budapestissä 10. syyskuuta 1948, jolloin hän sai etunimen Károly. Käydessään lukiota Simonyi työskenteli yliopiston tietokonelaboratorion yövahtina. Eräs laboratorion insinööreistä opetti hänet ohjelmoimaan. Hän myi ohjelmistotuotteitaan Unkarin valtiolle jo lukionkäyntinsä aikana. Simonyi hankki työpaikan tanskalaisesta A/S Regnecentralen -yrityksestä vuonna 1966. Hän suorittiKalifornian yliopiston Berkeleyn kampuksella kandidaatin tutkinnon 1968–1972 pääaineenaan matematiikka. Hän jatkoi opintojaanStanfordin yliopistossa, josta hänet palkattiinXerox-yhtiönPalo Alton tutkimuskeskukseen. Simonyi jaButler Lampson suunnittelivatXerox Alto -tietokoneelleBravo-ohjelmiston tekstinkäsittelyyn, joka oli ensimmäinenWYSIWYG-tekstinkäsittelyohjelma.[1][2]
Simonyi lähti Microsoftilta vuonna 2002 perustaenGregor Kiczalesin kanssa Intentional Software -yhtiön.
Simonyin lahjoituksella luotiin Tieteen kansantajuistamisen Simonyi-professuuriOxfordin yliopistolle. Professuuri myönnettiin vuonna 1995Richard Dawkinsille ja hänen jäätyään eläkkeelle häntä seurasi vuodesta 2008Marcus du Sautoy. Stanfordin yliopistoon luotiin hänen lahjoituksillaan Opetusinnovaation Charles Simonyi -professuuri. Lisäksi Simonyi on perustanut 50 miljoonan dollarin säätiön, jolla tuetaanSeattlen alueen tiedettä, taidetta ja koulutusta.
Simonyi seurusteli 15 vuottaMartha Stewartin kanssa. Vuonna 2008 he kuitenkin erosivat ja Simonyi nai marraskuussa itseään 32 vuotta nuoremman ruotsalaisen miljonäärintyttären Lisa Persdotterin Göteborgissa.
Simonyi osti 2006 itselleen matkanKansainväliselle avaruusasemalle. Simonyi lähti 7. huhtikuuta 2007Sojuz TMA-10 -avaruuslennolle kahdenkosmonautin kanssa ja näin hänestä tuli järjestyksessään viides avaruusturisti[3] ja toinen unkarilainen avaruudessa. Virallisesti hän oli lennolla mukanaavaruuslennolle osallistujana. Matkan on arveltu maksaneen noin 25 miljoonaa dollaria. Simonyi palasi kahden viikon avaruusmatkalta Maahan 21. huhtikuuta 2007.[4]
Simonyi halusi matkata avaruuteen toisen kerran, jolloin hän olisi ensimmäinen toisen kerran avaruuslennon tehnyt avaruusturisti.[5] Tämä toteutui 26. maaliskuuta 2009 laukaistulla lennollaSojuz TMA-14. Simonyi maksoi 13 päivää kestävästä Kansainväliselle avaruusasemalle suuntautuneesta avaruusmatkasta noin 26 miljoonaa euroa. Paluu Maahan tapahtui 8. huhtikuuta 2009 lennollaSojuz TMA-13.[6][7]