Baikonur (ven.Байконур,kaz.Байқоңыр,Baiqoñyr), vuoteen 1995Leninsk, on kaupunkiKazakstaninQızılordan alueella. Sen on vuokrannutVenäjä, joka ylläpitää alueella Neuvostoliiton aikaan perustettuaBaikonurin kosmodromia. Kaupungissa on noin 70 000 asukasta (2006).
Paikkakunta perustettiin 1955 ja sai kaupunkioikeudet 1966. Se oli Neuvostoliiton aikanasuljettu kaupunki. Kazakstan muutti kaupungin nimen Baikonuriksi virallisesti 20. joulukuuta 1995. Alkuperäinen Baikonur-niminen paikkakunta on kaivoskylä 320 km kosmodromista koilliseen. Aikoinaan Neuvostoliiton tärkeimmälle avaruuskeskukselle, jossa oli sen alkuvuosina myös sotilaallisia toimintoja, annettiin tarkoituksella harhaanjohtava nimi ja sijainti osana Yhdysvaltain ja Neuvostoliiton välisenkylmän sodan toimintoja.
