هم‌ساخت‌شناسی توالی (بهانگلیسی:Sequence homology)،هم‌ساخت‌شناسی بیولوژیک بیندی‌ان‌ای،آران‌ای، یاتوالی‌های پروتئینی است که بر حسب اصل و نسب مشترک درتاریخ تکاملی زندگی تعریف شده‌است. دو بخش از دی‌ان‌ای می‌توانند به دلیل سه پدیده دارای اصل و نسب مشترک باشند: یا یک رویدادگونه‌زایی (ارتولوگ‌ها)، یا یکرویداد تکراری (پارالوگ‌ها)، یا دیگری یک رویدادانتقال ژن افقی (یا جانبی) (زنولوگ‌ها).[۱]