بیشتر موانع ایجاد شده در راه شارش ژن موانع طبیعی هستند. از آن جمله میتوان به کوهستانهای غیرقابل عبور، اقیانوسها و صحراهای گسترده اشاره کرد. گاه این موانع ساخته دست آدمی هستند.دیوار بزرگ چین نمونهای از این دسته موانع است. این سازه شارش ژن بین گیاهان دو سوی دیوار را دچار اشکال کردهاست. از این روی به دلیل کاهش شارش ژن، گیاهان دو سوی دیوار تفاوتهای ژنتیکی از خود نشان میدهند. نیازی به این که موانع شارش ژن فیزیکی باشند نیست. گونههای زیستی میتوانند در یک زیست گاه زندگی کنند ولی شارش ژن محدودی داشته باشند. نمونه آن هنگامی است که فرزندان دورگهای که از نزدیکی افراد دو گروه به وجود میآیند نا سازوار باشند و توسطانتخاب طبیعی حذف شوند.