Mere pindala on 450 000 km², suurim sügavus 3040 meetrit. Punase mere pikkus ulatub 2250 kilomeetrini, keskmine laius on 300 km.
Merevesi onsoolasem kuiookeanis, umbes 41‰, ja põhjani soe, mitte alla 22 °C. Selle erandliku nähtuse põhjuseks on asjaolu, et Bab el Mandebi väina madaluse tõttu ei pääse ookeani külm põhjavesi merre, aga merel endal pole kunagi ega kuskil piisavalt külma ilma.Hüdrotermaalsed lõhed avanevad kohati merepõhja ja seal on veel kuumema ja soolasema, metalle sisaldava vee kogumeid.
Mere keskosas onlooded nõrgad, põhja- ja lõunaosas aga tugevamad, kuni 1,8 meetrit.
Punane meri on sooja vee ja suure soolsuse tõttu hea kasvukohtkorallidele.
Punase mere nimi tuleneb arvatavasti punakat tooni mägedepeegeldumisest mereveel või punastvärvitsüanobakterite (Trichodesmium erythraeum) nn õitsemisest.
