Enne19. sajandit olijaapani kultuur tugevalt mõjustatudhiina kultuurist. Hiinas ei kaubeldudhõbedastmüntidega, vaid hõbe võis olla mis tahes kujul ja tema väärtus vastas temakaalule. Kui sellesse piirkonda hakkasid jõudmaHispaania taalrid, siis nimetasid hiinlased neid hõbedast ringideks. Hiinakeelne sõna "jüaan" levis teistessegi keeltesse, kus see samuti raha tähendama hakkas:korea keeles "vonn" ja jaapani keeles "jeen".
Enne1871. aasta rahareformi käibisid Jaapanis mitmesugused rahad, nii hõbedast, kullast kui ka paberist, nii tänapäeva mõistes auguga mündid kui ka keerukama kujuga objektid. Need moodustasidTokugawa rahasüsteemi, mille ühikuks oliJaapani moon.
Meiji valitsus võttis jeeni ametlikult kasutusele10. mail 1871. Raha hakkas käibima alates sama aasta juulist. Jeenid olid ümmargused ja kujult sellised nagu Läänes, ilma auguta keskel. Jeen oli seotud niikulla kui hõbedaga: tema väärtuseks sätestati 24,26 g hõbedat või 1,5 g kulda (selline kogus hõbedat maksaks tänapäeval 1181 jeeni ja selline kogus kulda maksaks 4715 jeeni). Jeen oli tollal umbes sama väärtusega kuiUSA dollar.
1873. aastaldevalveeriti hõbedat kulla suhtes ja jeen ei saanud enam olla seotud niihästi kulla kui ka hõbedaga endise kursi alusel. Näiteks USA dollar jäikullastandardile, aga jeen jäihõbedastandardile, mistõttu tema väärtus dollari suhtes langes.1897. aastal läks jeen uuesti kullastandardile, aga tema väärtus oli tollal üksnes 50 senti. Selle vahetuskursi Jaapani valitsus ka külmutas.
Teise maailmasõja järel ja ajal kaotas jeen oma väärtuse.1949. aastal fikseeriti jeeni ja dollari kurss uuesti, et hindu stabiliseerida. See oli osa USA välja töötatudBretton Woodsi süsteemist. Kurss 380 jeeni dollari eest kehtis1971. aastani, mil USA loobus kullastandardist.
Jaapanis töötas see süsteem esialgu hästi. Jaapani riigieelarve jõudis1960. aastate alguse puudujäägist 1971. aastaks 5,8 miljardi dollari suuruse ülejäägini. Kuid samal ajal ilmnes, et jeen on dollari suhtes alahinnatud. Jaapanieksport ei maksnudUSA-s peaaegu midagi, seevastu USAimportkaubad olid Jaapanis väga kallid. Jeen polnud ainus, vaid paljud teisedki maailma olulised valuutad olid dollari suhtes alahinnatud.
Jeeni kursseuro suhtes alates 1999Jeeni kurssUSA dollari suhtes alates 1950Jeeni kursseuro suhtes 1999–2007
Pärast USA loobumist kullastandardistrevalveeris Jaapan kohe jeeni. Uueks kursiks sai 308 jeeni dollari eest. Ent kohe ilmnes, et nüüd, kui USA dollar polnud enam kullaga tagatud, oli seda kurssi väga raske säilitada.1973. aasta algul lasti jeeni kurss dollari suhtes vabaks ja vaba on see tänapäevani.
Pärast kursi vabakslaskmist on jeen dollari suhtes oluliselt tugevnenud. Juba järgmisel kuul nõrgenes dollar alla 300 jeeni piiri, 1977. aasta novembris alla 250 jeeni, 1978. aasta juulis alla 200 jeeni, 1987. aasta aprillis alla 150 jeeni ja 1994. aasta juulis alla 100 jeeni piiri. 2010. aasta oktoobris jõudis jeen rekordiliselt kõrgele, kursini 81,80 jeeni = 1 dollar.
Euro (ja järelikult kaEesti krooni) suhtes on jeen alates 2000. aastast, mil tema kurss oli 92 jeeni = 1 euro, valdavalt nõrgenenud. 2007. aastal oli kurss juba üle 155 jeeni euro eest.
Jaapanis ringlevad järgmised rahatähed:
1000 jeeni – mõõtmed 76 × 150 mm, esiküljelHideyo Noguchi
2000 jeeni – mõõtmed 76 × 154 mm, esiküljelShureimon, kindluseväravNahas
5000 jeeni – mõõtmed 76 × 156 mm, esiküljelIchiyo Higuchi