Movatterモバイル変換


[0]ホーム

URL:


Mine sisu juurde
Vikipeedia
Otsing

Aheldustasakaalutus

Allikas: Vikipeedia
Aheldustasakaalutuse hääbumine. Mida rohkem ajas edasi, seda rohkem rekombinatsioonisündmusi toimub ja seda rohkem liiguvad alleelid aheldustasakaalutusest aheldustasakaalu. Teisisõnu: algselt sageli koos esinevad alleelid hakkavad üha harvemini koos esinema.

Aheldustasakaalutus (ingllinkage disequilibrium, lühendLD) on arvsuurusgeneetikas, mis näitab erinevatelookustealleelide omavahelist mittejuhuslikku seost.[1][2] Aheldustasakaalutus tugineb erinevatealleelisagedustekovariatsioonile, kuid vastupidi terminile ei pruugi see kovariatsioon tingimata tuleneda kahe lookusegeneetilisest aheldusest.

Aheldustasakaalutus on oluline mõõdikpopulatsioonigeneetikas,inimgeneetikas jaevolutsioonilises bioloogias. Sellega saab hinnata populatsiooni ajalugu ja evolutsiooni. Selle formuleerisid 1960. aastalRichard Lewontin jaKen-Ichi Kojima.[3]

Definitsioon

[muuda |muuda lähteteksti]

Aheldustasakaalutusel on mitu definitsiooni. Kõik definitsioonid on aga ühel või teisel moel seotud suurusegaD, mis on kahe alleeli esinemissagedusekovariatsioon.[2]

Algne definitsioon

[muuda |muuda lähteteksti]

Olgu meil kaks bialleelset lookust. Ühes lookuses on võimalikud alleelidA jaa ning teises lookuses on võimalikud alleelidB jab. AlleelidA jaB esinevad populatsioonis vastavate sagedustegapA{\displaystyle p_{A}}japB{\displaystyle p_{B}}. Kuihaplotüüp (alleelide kogum) koosneb alleelidestA jaB, st meil onAB haplotüüp, siis selle haplotüübi sagedus onpAB{\displaystyle p_{AB}}. Sel juhulDAB=pABpApB{\displaystyle D_{AB}=p_{AB}-p_{A}p_{B}}, kus:

KuiD=0{\displaystyle D=0}, siis lookused on aheldustasakaalus ehk lookustele ei mõju mingitevolutsioonilist survet (näitekslooduslik valik). KuiD>0{\displaystyle D>0} võiD<0{\displaystyle D<0}, siis lookused on aheldustasakaalutuses.

Normaliseeritud kuju

[muuda |muuda lähteteksti]

KunaD sõltub alleelisagedustest, siis erinevate lookustepaaride aheldustasakaalutuse võrdlemine ei ole võrdeline. Et erinevate lookustepaaride aheldustasakaalutust võrrelda, jagatakseD läbi selle maksimaalse võimaliku väärtusega. Seeläbi saadakseD normaliseeritud kuju,D{\displaystyle D'}.

Levinud kuju

[muuda |muuda lähteteksti]

Kõige levinum kuju aheldustasakaalutuse väljendamiseks onr2{\displaystyle r^{2}}, mis defineeritakse järgnevalt:[2]

r2=D2pA(1pA)pB(1pB){\displaystyle r^{2}={\frac {D^{2}}{p_{A}(1-p_{A})p_{B}(1-p_{B})}}}.

See on sarnane normaliseeritud kujule, sest isegi madalate alleelisageduste korralr2{\displaystyle r^{2}} võib sellegipoolest võrduda ühega.

Vaata ka

[muuda |muuda lähteteksti]

Viited

[muuda |muuda lähteteksti]
  1. Slatkin, Montgomery (2008)."Linkage disequilibrium — understanding the evolutionary past and mapping the medical future".Nature Genetics Reviews. Vaadatud 11.05.2022.
  2. 2,02,12,2Coop, G. (2020)."Population and Quantitative Genetics (3rd release)". Vaadatud 15. november 2023.
  3. Lewontin, R. C. (1960)."The Evolutionary Dynamics of Complex Polymorphisms".Evolution. Vaadatud 15. november 2023.
Pärit leheküljelt "https://et.wikipedia.org/w/index.php?title=Aheldustasakaalutus&oldid=6632577"
Kategooria:

[8]ページ先頭

©2009-2025 Movatter.jp