Schwarzer también fue un veterano miembro de laselección de fútbol de Australia, habiendo jugado más partidos con lossocceroos que ningún otro jugador con un total de 118 (110 selección absoluta y 8 sub-20).[4]
Schwarzer ha usado el mismo par de espinilleras desde que comenzó su carrera profesional a los 19 años con el equipo australianoMarconi Stallions, en laNational Soccer League.[5] Dejó el club deSídney para jugar enAlemania con elDinamo Dresde, elKaiserslautern y elBradford City, Schwarzer fichó más tarde por elMiddlesbrough en febrero de 1997. Fue considerado un gran contribuyente al éxito reciente de Middlesbrough y una parte importante del equipo.
Scharwzer se unió alMiddlesbrough Football Club de Inglaterra en febrero de 1997.[6] Hizo su debut en un partido contra elStockport County en las semifinales de laCopa de la Liga de final. Jugó en la final contra elLeicester City, un empate de 1-1, pero una lesión le mantuvo fuera de la repetición, que el Middlesbrough perdió. Sin embargo, fue parte de la selección que venció aBolton Wanderers para ganar la final de la Copa 2004, produciendo a una gran muestra de haber recuperado después de su error al permitir que en un tiro suave. En el año de 2005 llegó a jugar la final de laUEFA frente al Sevilla FC siendo su club arrollado por el conjunto andaluz por 0-4.
A principios de la temporada 2008-2009 Schwarzer se unió alFulham FC deLondres, terminando su presencia de 11 años con el Middlesbrough.[7] Hizo su debut con el club el 16 de agosto de 2008, en la derrota 2-1 ante el recientemente ascendido Hull City FC.[8] Schwarzer fue un elemento fundamental durante su primera temporada con el Fulham, ayudando a su equipo a lograr un histórico séptimo puesto en la Premier League de ese año y siendo nombrado como el Jugador del Año.[9]
Durante la temporada 2009-2010, fue una pieza fundamental en la exitosa campaña en la cual su equipo alcanzó la final de laUEFA Europa League, la cual terminarían perdiendo en tiempo extra contra elAtlético Madrid.[9]
El 6 de junio de 2013, Schwarzer anunció que estaría dejando el club luego de la llegada de Maarten Stekelenburg al Fulham.[10]
El 9 de julio del año 2013 Mark fichó por una temporada para ser parte de la plantilla delChelsea FC.[11] El 22 de abril de 2014 tuvo que entrar al campo para sustituir al titular del Chelsea FC en el partido de semifinal de ida de laLiga de Campeones de la UEFA ante elAtlético Madrid, realizando una buena labor y ayudando a su club a mantener el empate 0-0.[12]
En verano de 2015 vence contrato con el Chelsea y ficha por elLeicester City. En terminar la temporada el guardameta no gozó de minutos y se desvincula del club, eso si con una Premier League.
Con laselección de Australia ha jugado un récord de 110 partidos internacionales y ha participado de los Campeonatos Mundiales de2006 y2010. Fue titular en la final de laCopa Asiática 2011, la cual perdieron 0-1 frente a laselección japonesa.[13] Fue durante esta edición de la Copa Asiática que Schwarzer superó el récord de partidos jugados con lossocceroos que antes teníaAlex Tobin.
Schwarzer anunció en junio de 2013 que siempre y cuando Australia clasifique para el torneo, se retiraría en forma definitiva de la selección luego de la Copa Mundial de Fútbol de 2014. El equipo alcanzó la clasificación el 18 de junio de 2013 tras vencer 1-0 a Irak como local. No obstante, Schwarzer anunció su retiro de la selección el 5 de noviembre de 2013.[14]
Su hijo, Julian Schwarzer García, es también un futbolista profesional que juega en la posición de arquero y ha representado aFilipinas a nivel internacional.[15]