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ARN ribosómico

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Estructura 3D de la subunidad 50S deHaloarcula marismortui. Las proteínas se muestran en verde, el ARNr 23S en naranja y el ARNr 5S en amarillo.[1]

Elácido ribonucleico ribosómico oribosomal (ARNr) es unARN que forma parte de losribosomas y es esencial para lasíntesis proteica en todos los seres vivos. Los ARNr forman la construcción de los ribosomas y se asocian a proteínas específicas para formar las pre subunidades ribosómicas. Es el material más predominante en el ribosoma, que en peso consiste de aproximadamente un 60 % de ARNr y un 40 % deproteína. Los ribosomas contienen dos principales tipos de ARNr que forman dos subunidades: la subunidad mayor (LSU,Large Sub Unit por sus siglas en inglés, que es unaribozima que cataliza la formación deenlaces peptídicos), y la subunidad menor (SSU,Small Sub Unit). El ARNr es el tipo de ARN más abundante en las células y está formado por una sola cadena de nucleótidos, aunque presenta regiones de doble hélice intracatenaria. Las secuencias de ARNr son ampliamente utilizadas para deducir relaciones evolutivas entre organismos puesto que se encuentran en todas las formas de vida.

Procariontes frente a eucariontes

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Tanto los ribosomas procariontes como los eucariontes consisten de dos subunidades, pero cada una de estas está formada por distintos tipos de ARNr. Tradicionalmente, los ARN ribosómicos se denominan según su coeficiente de sedimentación, medido enunidades Svedberg (S). La siguiente tabla muestra los tipos de ARNr en dos especies modelo:Escherichia coli (procarionte) yHomo sapiens (eucarionte):

ProcariontesEucariontes
Tamaño del ribosoma70S80S
SubunidadMayorMenorMayorMenor
Tamaño de la subunidad50S30S60S40S
ARNr5S23S16S5S5.8S28S18S
Longitud del ARNr120 nt2906 nt1542 nt121 nt[2]156 nt[3]5070 nt[4]1869 nt[5]

Procariontes

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En procariontes, la subunidad mayor (50S) está compuesta de ARNr 5S y ARNr 23S, mientras que la subunidad menor (30S) está compuesta únicamente por ARNr 16S. El extremo 3' del ARNr 16S es el que se une a la secuencia Shine-Dalgarno en el extremo 5' del ARNm. En bacterias, estos genes (ARNr 5S, ARNr 23S y ARNr 16S) típicamente se encuentran organizados en un operon que se co-transcribe y del que puede haber una o más copias. Lasarqueas contienen un operón de rDNA o bien múltiples copias.

Eucariontes

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En eucariontes, la subunidad mayor (60S) está compuesta de ARNr 5S, ARNr 5.8S y ARNr 28S, mientras que la subunidad menor consiste de ARNr 18S. Lasplantas tienen ARNr 25S, a diferencia del ARNr 28S en losmamíferos.

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Los eucariontes generalmente tienen muchas copias de los genes de ARNr organizadas en repeticionesen tandem. En los humanos, hay entre 300–400 repeticiones en 5 grupos (en los cromosomas 13, 14, 15, 21 y 22.) Debido a su estructura especial y a su patrón de transcripción, los grupos de genes de ARNr se suelen denominar «ADN ribosomal (ADNr)» (nótese que el término no se refiere a que los ribosomas contengan ADN).

La estructura terciaria de la subunidad menor (SSU rRNA) ha sido elucidada por cristalografía de rayos-X.[6]​ La estructura secundaria de la subunidad menor contiene cuatro dominios distintos: el 5', el central, 3' mayor y 3' menor.

Importancia del ARN ribosómico

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Las características del ARN ribosómico son importantes en evolución, taxonomía y medicina.

  • El ARNr es uno de los únicos materiales genéticos presentes en todas las células.[7]​ Por esta razón, los genes que codifican para ARNr (ADNr) son secuenciados para identificar el grupotaxonómico al que pertenece un organismo, inferir relaciones entre organismos y estimar tasas de divergencia. Por esta razón, existen bases de datos especializadas que almacenan esta información, tales como RDP-II[8]​ y SILVA.[9]
  • Muchos antibióticos actúan afectando al ARNr:cloranfenicol,eritromicina,paromomicina,ricina,espectinomicina yestreptomicina.
  • Se ha demostrado que algunos ARN ribosómicos son el origen de algunos microRNAs, como miR-663 en humanos y miR-712 en ratón. Estos miRNAs surgen de espaciadores internos de ARNr que son transcritos.

Véase también

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Referencias

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  1. Ban, N.; Nissen, P.; Hansen, J.; Moore, P. B.; Steitz, T. A. (11 de agosto de 2000).«The complete atomic structure of the large ribosomal subunit at 2.4 A resolution».Science (New York, N.Y.)289 (5481): 905-920.ISSN 0036-8075.PMID 10937989. Consultado el 18 de noviembre de 2016. 
  2. «Homo sapiens 5S ribosomal RNA». 
  3. «Homo sapiens 5.8S ribosomal RNA». 
  4. «Homo sapiens 28S ribosomal RNA». 
  5. «Homo sapiens 18S ribosomal RNA». 
  6. Yusupov, Marat M.; Yusupova, Gulnara Zh; Baucom, Albion; Lieberman, Kate; Earnest, Thomas N.; Cate, J. H. D.; Noller, Harry F. (4 de mayo de 2001).«Crystal Structure of the Ribosome at 5.5 Å Resolution».Science(en inglés)292 (5518): 883-896.ISSN 0036-8075.PMID 11283358.doi:10.1126/science.1060089. Consultado el 18 de noviembre de 2016. 
  7. Smit, S.; Widmann, J.; Knight, R. (1 de enero de 2007).«Evolutionary rates vary among rRNA structural elements».Nucleic Acids Research35 (10): 3339-3354.ISSN 1362-4962.PMC 1904297.PMID 17468501.doi:10.1093/nar/gkm101. Consultado el 18 de noviembre de 2016. 
  8. Cole, J. R.; Chai, B.; Marsh, T. L.; Farris, R. J.; Wang, Q.; Kulam, S. A.; Chandra, S.; McGarrell, D. M.et al. (1 de enero de 2003).«The Ribosomal Database Project (RDP-II): previewing a new autoaligner that allows regular updates and the new prokaryotic taxonomy».Nucleic Acids Research31 (1): 442-443.ISSN 1362-4962.PMC 165486.PMID 12520046. Consultado el 18 de noviembre de 2016. Se sugiere usar|número-autores= (ayuda)
  9. Pruesse, Elmar; Quast, Christian; Knittel, Katrin; Fuchs, Bernhard M.; Ludwig, Wolfgang; Peplies, Jörg; Glöckner, Frank Oliver (1 de enero de 2007).«SILVA: a comprehensive online resource for quality checked and aligned ribosomal RNA sequence data compatible with ARB».Nucleic Acids Research35 (21): 7188-7196.ISSN 1362-4962.PMC 2175337.PMID 17947321.doi:10.1093/nar/gkm864. Consultado el 18 de noviembre de 2016. 


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