Marcos er leder af Den Zapatistiske Nationale Befrielseshær (EZLN) og var den revolutionære leder af indianernes oprør i delstatenChiapas i Mexico i 1994. Samtidig var han en karismatisk skikkelse på den mexicanske og latinamerikanske venstrefløj efter kommunismens kollaps.

I det første år afzapatisternes oprør i Chiapas var Marcos' identitet ukendt. Han kommer fra middelklassen, læste filosofi og litteratur i Mexico City i 1977-1980 og underviste på universitetet frem til 1984, da han tilsluttede sig en gruppe oprørere i Chiapas og gik under jorden. Som leder af EZLN formidler Marcos på en litterær og poetisk måde indianernes kamp for bedre livsvilkår og respekt for deres etnisk-kulturelle rettigheder.

Frem til 2000 var hans hovedfjende det mangeårigePRI-regime, men selv om han i 2001 kunne lede en fredskaravane til Mexico City, opnåede han ikke afgørende fremskridt for de mange indianske folk i Mexico.