Anschließend wechselte er an dieUniversity of Pittsburgh, wo er Professor für Politikwissenschaften und Direktor der Abteilung für Internationale Studien war. Seit September 2009 ist er an derUniversität Salzburg Professor für Österreichische Politik in vergleichender europäischer Perspektive und Leiter des Fachbereichs Politikwissenschaft und folgte dortHerbert Dachs.[5]
In seiner wissenschaftlichen Arbeit beschäftigt sich Heinisch unter anderem mit Fragen der österreichischen Politik im europäischen Kontext, besonders der vergleichenden Demokratie- und Populismusforschung, den politischen Parteien und Wahlverhalten. In früheren Jahren lag sein Forschungs- und Publikationsschwerpunkt auf der vergleichenden Arbeitsmarktpolitik.[6] Er ist Autor von 12 Buchpublikationen und über 80 Fachpublikationen, davon 40 in führenden internationalen Zeitschriften wieEuropean Journal of Political Research,West European Politics, undJournal of Common Market Studies.[7] Seine Arbeit wurde u. a. durch Projektförderungen der Europäischen Union (Horizon 2020 Project Grant, Marie Curíe Fellowship) und des FWF unterstützt.[8] Ein aktuelles Forschungsprojekt finanziert durch den Schweizer SNSF und den FWF beschäftigt sich mit der Erforschung von Populismus und Verschwörungstheorien.
Von 2010 bis 2019 war Heinisch Leiter der Arbeitsgruppe zur Zukunft der Demokratie der Österreichischen Forschungsgemeinschaft.[11] Er war auch Mitbegründer und akademischer Leiter derSummer University Carinthia und war 2016/17 Vorsitzender derÖsterreichischen Gesellschaft für Politikwissenschaft.[12][4][6][2]
2002:Populism, Proporz, and Pariah. Austria Turns Right: Austrian Political Change, Its Causes and Repercussions, Huntington NY: Nova Science Publishing, 2002,ISBN 978-1-59033-173-6
2016:Jung, muslimisch, österreichisch. Einblicke in 20 Jahre Muslimische Jugend Österreich, gemeinsam mitFarid Hafez,Raoul Kneucker und Regina Polak, New Academic Press, Wien 2016,ISBN 978-3-9503510-6-4
2016:Understanding Populist Party Organisation: The Radical Right in Western Europe, gemeinsam mit Oscar Mazzoleni, Palgrave Macmillan UK, London 2016,ISBN 978-1-137-58197-6
2019:The People and the Nation: Populism and Ethno-Territorial Politics in Europe gemeinsam mit Emanuele Massetti and Oscar Mazzoleni (Milton Park, UK: Routledge).ISBN 978-1-138-57802-9
2020:National Populismus Bildet/Populism and the Educational Dimension, Sammelband gemeinsam mit Patrick Duval and Manfred Oberlechner (Vienna: Wochenschau).ISBN 978-3-7344-0921-9
2021:Political Populism: Handbook on Concepts, Questions and Strategies for Research, Sammelband gemeinsam mit Oscar Mazzoleni, Christina Holtz-Bacha (Nomos).ISBN 978-3-8487-6617-8
2022: Demokratie nach 1945, Sammelband gemeinsam mit C. Kühberger, R., Klaushofer, M., Reiter (Böhlau),ISBN 978-3-205-21596-7.
2024, mitFarid Hafez:Politicizing Islam in Austria. The Far-Right Impact in the Twenty-First Century. Rutgers University Press, New Jersey 2024,ISBN 978-1-978-83044-8.
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