Nukleoside

Nukleoside (auchNucleoside) sindorganische Moleküle, die aus einerNukleobase und einerPentose bestehen.In einerZelle kommen verschiedene Nukleoside vor, die sich im Basen- oder Zuckeranteil unterscheiden. Sie enthalten im Unterschied zu denNukleotiden vonNukleinsäuren (DNA oder RNA) keine Phosphatreste.
Grundtypen
[Bearbeiten |Quelltext bearbeiten]Die fünf Grundtypen der Nukleoside bestehen entweder aus einerPurin- oder einerPyrimidinbase. Wenn sie Bausteine einerRNA sind, ist die Pentose (einEinfachzucker mit fünfC-Atomen) dieRibose, in derDNA liegt als Pentose dieDesoxyribose vor. Deshalb nennt man die Bausteine der DNA genauer Desoxynukleoside, während Nukleoside im engeren Sinne die Bausteine der verschiedenen RNA-Formen sind. Die Verknüpfung von Base und Pentose erfolgt bei den Purin-Basen stets über das Stickstoffatom in Position 9, bei den Pyrimidin-Basen über das Stickstoffatom in Position 1 und das C1′-Atom des Zuckers.
Purin-Basen
[Bearbeiten |Quelltext bearbeiten]Nukleobase | Nukleosid | Desoxynukleosid |
---|---|---|
![]() | ![]() | ![]() |
Adenin | Adenosin, A | Desoxyadenosin, dA |
![]() | ![]() | ![]() |
Guanin | Guanosin, G | Desoxyguanosin, dG |
Anmerkung: Es ist jeweils nur eine der möglichentautomeren Strukturen dargestellt.
Pyrimidin-Basen
[Bearbeiten |Quelltext bearbeiten]Nukleobase | Nukleosid | Desoxynukleosid |
---|---|---|
![]() | ![]() | ![]() |
Cytosin | Cytidin, C | Desoxycytidin, dC |
![]() | ![]() | ![]() |
Thymin | Ribothymidin T[1] (= 5-Methyluridin) | Desoxythymidin, dT |
![]() | ![]() | ![]() |
Uracil | Uridin, U | Desoxyuridin, dU |
Abwandlungen der Grundformen
[Bearbeiten |Quelltext bearbeiten]Neben diesen Grundformen gibt es noch zahlreiche Modifikationen, die vor allem in dentRNAs undrRNAs zu finden sind.[2] Einige finden sich auch in derDNA.[3] Diese veränderten Nukleoside entstehen in der Regel erst nach der Transkription und dienen einer Feineinstellung von Struktur, Aktivität und Spezifität der Moleküle. Die meisten Modifikationen entstehen durchMethylierung.
Einen Überblick über die möglichen Abwandlungen soll die folgende Auswahl geben. Zum Vergleich sind die Grundformen ebenfalls angeführt:
Pyrimidin-Nukleoside
[Bearbeiten |Quelltext bearbeiten]Name | Symbol | Pyrimidin-Grundstruktur | R1 | R2 | R3 | R4 | R5 | R6 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Cytidin | C | ![]() | Ribose | =O | –NH2 | |||
3-Methylcytidin | m3C | Ribose | =O | –CH3 | –NH2 | |||
5-Methylcytidin | m5C | Ribose / Desoxyribose | =O | –NH2 | –CH3 | |||
N4-Methylcytidin | m4C | Ribose / Desoxyribose | =O | –NH–CH3 | ||||
N4,N4-Dimethylcytidin | m42C | Ribose | =O | –N(CH3)2 | ||||
2′-O-Methylcytidin | Cm | 2′-O-Methyl-ribose | =O | –NH2 | ||||
Isocytidin (synth.) | iC | Ribose | –NH2 | =O | ||||
Pseudocytidin (synth.) | ΨC | –H | =O | –NH2 | Ribose | |||
Pseudoisocytidin (synth.) | psiC | –H | –NH2 | =O | Ribose | |||
2-Thiocytidin | s2C | Ribose | =S | –NH2 | ||||
N4-Acetylcytidin | ac4C | Ribose | =O | –NH–CO–CH3 | ||||
Uridin | U | Ribose | =O | =O | ||||
3-Methyluridin | m3U | Ribose | =O | –CH3 | =O | |||
2′-O-Methyluridin | Um | 2′-O-Methyl-ribose | =O | =O | ||||
Pseudouridin | P, Ψ, Ψrd | –H | =O | =O | Ribose | |||
Dihydrouridin | D, UH2, Uh | Ribose | =O | =O | –H,–H | –H,–H | ||
5-Methoxyuridin | mo5U | Ribose | =O | =O | –O–CH3 | |||
5-(Carboxyhydroxymethyl)-Uridin | chm5U | Ribose | =O | =O | –CH(OH)–CO2CH3 | |||
5-Carboxymethylaminomethyl-Uridin | cmnm5U | Ribose | =O | =O | –CH2–NH–CH2–CO2CH3 | |||
5-Methylaminomethyl-Uridin | mnm5U | Ribose | =O | =O | –CH2–NH–CH3 | |||
5-Methoxy-carbonylmethyl-Uridin | mcm5U | Ribose | =O | =O | –CH2–CO2CH3 | |||
2-Thiouridin | s2U | Ribose | =S | =O | ||||
4-Thiouridin | s4U | Ribose | =O | =S | ||||
Ribothymidin (= 5-Methyluridin) | T, m5U | Ribose | =O | =O | –CH3 | |||
Dihydrothymidin | Desoxyribose | =O | =O | –H,–CH3 | –H,–H |
Purin-Nukleoside
[Bearbeiten |Quelltext bearbeiten]Name | Symbol | Purin-Grundstruktur | R1 | R2 | R3 | R4 | R5 | R6 | R7 | R8 | R9 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Adenosin | A | ![]() | –NH2 | Ribose | |||||||
1-Methyladenosin | m1A | –CH3 | –NH2 | Ribose | |||||||
2-Methyladenosin | m2A | –CH3 | –NH2 | Ribose | |||||||
N6-Methyladenosin | m6A | –NH–CH3 | Ribose / Desoxyribose | ||||||||
N6,N6-Dimethyladenosin | m62A | –N(CH3)2 | Ribose | ||||||||
2′-O-Methyladenosin | Am | –NH2 | 2′-O-Methyl-ribose | ||||||||
Inosin | I | =O | Ribose | ||||||||
1-Methylinosin | m1I | –CH3 | =O | Ribose | |||||||
2′-O-Methylinosin | Im | =O | 2′-O-Methyl-ribose | ||||||||
Guanosin | G | –NH2 | =O | Ribose | |||||||
1-Methylguanosin | m1G | –CH3 | –NH2 | =O | Ribose | ||||||
7+-Methylguanosin | m7G | –NH2 | =O | –CH3 | Ribose | ||||||
N2-Methylguanosin | m2G | –NH–CH3 | =O | Ribose | |||||||
N2,N2-Dimethylguanosin | m22G | –N(CH3)2 | =O | Ribose | |||||||
2′-O-Methylguanosin | Gm | –NH2 | =O | 2′-O-Methyl-ribose | |||||||
Isoguanosin (synth.) | iG | =O | –NH2 | Ribose |
Hypermodifizierte Nukleoside und mit verändertem Basengrundgerüst
[Bearbeiten |Quelltext bearbeiten]![]() | ![]() |
Queuosin (Q, obiges Bild) β-D-Galactosyl-queuosin (galQ) β-D-Mannosyl-queuosin (manQ) | Archaeosin (G*, kommt nur inArchaeen vor) |
![]() | ![]() |
2′-O-Ribosyladenosinphosphat (Ar(p), rAMP) nur in Eukaryoten gefunden | Wybutosin (Y, yW; obiges Bild) Wyosin (Wyo, imG) |
![]() | ![]() |
N6-Threonylcarbamoyladenosin (t6A) | Lysidin (k2C) |
Variationen der Pentosen
[Bearbeiten |Quelltext bearbeiten]Nukleobase | (Ribosyl)Nukleosid | Desoxynukleosid | Arabinosylnukleosid | (Methylribosyl)Nukleosid |
---|---|---|---|---|
![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() |
Cytosin | Cytidin, C | Desoxycytidin, dC | Cytarabin, araC | 2′-O-Methylcytidin, Cm |
Physiologie
[Bearbeiten |Quelltext bearbeiten]Wird dieHydroxygruppe des C-5-Atoms der Pentose eines Nukleosids mit Phosphat verestert, entsteht das entsprechendeNukleotid. Je nach Anzahl der Phosphat-Reste spricht man von Mono-, Di- und Triphosphaten. Aus der zentralen Bedeutung der Nukleotide ergibt sich die gleiche Bedeutung für die entsprechenden Nukleoside, da sie als Baustein der Nukleotide in diese umgewandelt werden können.
Die Nukleoside stehen durch Abspaltung der letzten Phosphatgruppe in den Nukleotiden mittelsHydrolyse, mithilfe vonNukleotidase-Enzymen in allen Lebewesen zur Verfügung. Weiterhin kann Inosin aus Adenosin mittels derAMP-Desaminase oder derGuanin-Desaminase synthetisiert werden. Xanthosin ist entsprechend nicht nur durch Hydrolyse von XMP erhältlich, sondern auch aus Guanosin mittels derGuanosin-Desaminase.
Der Abbau erfolgt überNukleosidasen zurNukleobase und bei Purinen überXanthin zurHarnsäure bzw. bei Pyrimidinen zumAlanin oder zur2-Aminobuttersäure.
Nukleosid-Analoga
[Bearbeiten |Quelltext bearbeiten]Nukleosid-Analoga spielen vor allem in derantiretroviralen Therapie eine große Rolle. Eine Reihe modernerVirostatika enthalten diese Substanzen. Wohl am besten bekannt ist der WirkstoffAciclovir, der häufig gegenHerpes-simplex-Viren (HSV-1 und -2) eingesetzt wird. Weiterhin verbreitet istGanciclovir, das genau wie Aciclovir einGuanosin-Analogon ist, und spezifisch die Replikation vonCMV unterdrückt. Ein weiteres wichtiges Einsatzgebiet ist die Krebstherapie. So werden 5-Fluorouracil undCytarabin alsZytostatika eingesetzt.
Einzelnachweise
[Bearbeiten |Quelltext bearbeiten]- ↑Löffler, Petrides, Heinrich:Biochemie und Pathobiochemie. 8. Auflage. Springer, Heidelberg 2007,ISBN 978-3-540-32680-9.
- ↑Patrick A. Limbach, Pamela F. Crain, James A. McCloskey: „Summary: the modified nucleosides of RNA“,Nucleic Acids Research,1994,22 (12), S. 2183–2196 (doi:10.1093/nar/22.12.2183,PMC 523672 (freier Volltext),PMID 7518580).
- ↑Melanie Ehrlich, Miguel A. Gama-Sosa, Laura H. Carreira, Lars G. Ljungdahl, Kenneth C. Kuo, Charles W. Gehrke: „DNA methylation in thermophilic bacteria: N4-methylcytosine, 5-methylcytosine, and N6-methyladenine“,Nucleic Acids Research,1985,13 (4), S. 1399–1412 (doi:10.1093/nar/13.4.1399,PMC 341080 (freier Volltext),PMID 4000939).