Nukleoside

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Aufbau von Nukleotiden und Nukleosiden. Bei einem Nukleosid ist die 5′-OH-Gruppe der Pentose nicht mit einer Phosphatgruppe verestert. Über das C1′-Atom ist eine Base mit dieser Pentose verknüpft. Falls der Rest R eine Hydroxygruppe ist, liegt eine Ribose vor, bei einem Wasserstoffrest spricht man von einer Desoxyribose.

Nukleoside (auchNucleoside) sindorganische Moleküle, die aus einerNukleobase und einerPentose bestehen.In einerZelle kommen verschiedene Nukleoside vor, die sich im Basen- oder Zuckeranteil unterscheiden. Sie enthalten im Unterschied zu denNukleotiden vonNukleinsäuren (DNA oder RNA) keine Phosphatreste.

Inhaltsverzeichnis

Grundtypen

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Die fünf Grundtypen der Nukleoside bestehen entweder aus einerPurin- oder einerPyrimidinbase. Wenn sie Bausteine einerRNA sind, ist die Pentose (einEinfachzucker mit fünfC-Atomen) dieRibose, in derDNA liegt als Pentose dieDesoxyribose vor. Deshalb nennt man die Bausteine der DNA genauer Desoxynukleoside, während Nukleoside im engeren Sinne die Bausteine der verschiedenen RNA-Formen sind. Die Verknüpfung von Base und Pentose erfolgt bei den Purin-Basen stets über das Stickstoffatom in Position 9, bei den Pyrimidin-Basen über das Stickstoffatom in Position 1 und das C1′-Atom des Zuckers.

Purin-Basen

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NukleobaseNukleosidDesoxynukleosid
AdeninAdenosinDesoxyadenosin
AdeninAdenosin, ADesoxyadenosin, dA
GuaninGuanosinDesoxyguanosin
GuaninGuanosin, GDesoxyguanosin, dG

Anmerkung: Es ist jeweils nur eine der möglichentautomeren Strukturen dargestellt.

Pyrimidin-Basen

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NukleobaseNukleosidDesoxynukleosid
CytosinCytidinDesoxycytidin
CytosinCytidin, CDesoxycytidin, dC
Thymin5-MethyluridinDesoxythymidin
ThyminRibothymidin T[1] (= 5-Methyluridin)Desoxythymidin, dT
UracilUridinDesoxyuridin
UracilUridin, UDesoxyuridin, dU

Abwandlungen der Grundformen

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Neben diesen Grundformen gibt es noch zahlreiche Modifikationen, die vor allem in dentRNAs undrRNAs zu finden sind.[2] Einige finden sich auch in derDNA.[3] Diese veränderten Nukleoside entstehen in der Regel erst nach der Transkription und dienen einer Feineinstellung von Struktur, Aktivität und Spezifität der Moleküle. Die meisten Modifikationen entstehen durchMethylierung.

Einen Überblick über die möglichen Abwandlungen soll die folgende Auswahl geben. Zum Vergleich sind die Grundformen ebenfalls angeführt:

Pyrimidin-Nukleoside

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Pyrimidin-Nukleoside (Auswahl)
NameSymbolPyrimidin-GrundstrukturR1R2R3R4R5R6
CytidinCPyrimidin-GrundgerüstRibose=O–NH2
3-Methylcytidinm3CRibose=O–CH3–NH2
5-Methylcytidinm5CRibose / Desoxyribose=O–NH2–CH3
N4-Methylcytidinm4CRibose / Desoxyribose=O–NH–CH3
N4,N4-Dimethylcytidinm42CRibose=O–N(CH3)2
2′-O-MethylcytidinCm2′-O-Methyl-ribose=O–NH2
Isocytidin (synth.)iCRibose–NH2=O
Pseudocytidin (synth.)ΨC–H=O–NH2Ribose
Pseudoisocytidin (synth.)psiC–H–NH2=ORibose
2-Thiocytidins2CRibose=S–NH2
N4-Acetylcytidinac4CRibose=O–NH–CO–CH3
UridinURibose=O=O
3-Methyluridinm3URibose=O–CH3=O
2′-O-MethyluridinUm2′-O-Methyl-ribose=O=O
PseudouridinP, Ψ, Ψrd–H=O=ORibose
DihydrouridinD, UH2, UhRibose=O=O–H,–H–H,–H
5-Methoxyuridinmo5URibose=O=O–O–CH3
5-(Carboxyhydroxymethyl)-Uridinchm5URibose=O=O–CH(OH)–CO2CH3
5-Carboxymethylaminomethyl-Uridincmnm5URibose=O=O–CH2–NH–CH2–CO2CH3
5-Methylaminomethyl-Uridinmnm5URibose=O=O–CH2–NH–CH3
5-Methoxy-carbonylmethyl-Uridinmcm5URibose=O=O–CH2–CO2CH3
2-Thiouridins2URibose=S=O
4-Thiouridins4URibose=O=S
Ribothymidin (= 5-Methyluridin)T, m5URibose=O=O–CH3
DihydrothymidinDesoxyribose=O=O–H,–CH3–H,–H

Purin-Nukleoside

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Purin-Nukleoside (Auswahl)
NameSymbolPurin-GrundstrukturR1R2R3R4R5R6R7R8R9
AdenosinAPurin-Grundgerüst–NH2Ribose
1-Methyladenosinm1A–CH3–NH2Ribose
2-Methyladenosinm2A–CH3–NH2Ribose
N6-Methyladenosinm6A–NH–CH3Ribose / Desoxyribose
N6,N6-Dimethyladenosinm62A–N(CH3)2Ribose
2′-O-MethyladenosinAm–NH22′-O-Methyl-ribose
InosinI=ORibose
1-Methylinosinm1I–CH3=ORibose
2′-O-MethylinosinIm=O2′-O-Methyl-ribose
GuanosinG–NH2=ORibose
1-Methylguanosinm1G–CH3–NH2=ORibose
7+-Methylguanosinm7G–NH2=O–CH3Ribose
N2-Methylguanosinm2G–NH–CH3=ORibose
N2,N2-Dimethylguanosinm22G–N(CH3)2=ORibose
2′-O-MethylguanosinGm–NH2=O2′-O-Methyl-ribose
Isoguanosin (synth.)iG=O–NH2Ribose

Hypermodifizierte Nukleoside und mit verändertem Basengrundgerüst

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QueuosinArchaeosin
Queuosin (Q, obiges Bild)
β-D-Galactosyl-queuosin (galQ)
β-D-Mannosyl-queuosin (manQ)
Archaeosin (G*, kommt nur inArchaeen vor)
2′-O-RibosyladenosinphosphatWybutosin
2′-O-Ribosyladenosinphosphat (Ar(p), rAMP)
nur in Eukaryoten gefunden
Wybutosin (Y, yW; obiges Bild)
Wyosin (Wyo, imG)
N6-ThreonylcarbamoyladenosinLysidin
N6-Threonylcarbamoyladenosin (t6A)Lysidin (k2C)

Variationen der Pentosen

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Nukleobase(Ribosyl)NukleosidDesoxynukleosidArabinosylnukleosid(Methylribosyl)Nukleosid
CytosinCytidinDesoxycytidinCytarabin2'-O-Methylcytidin
CytosinCytidin, CDesoxycytidin, dCCytarabin, araC2′-O-Methylcytidin, Cm

Physiologie

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Wird dieHydroxygruppe des C-5-Atoms der Pentose eines Nukleosids mit Phosphat verestert, entsteht das entsprechendeNukleotid. Je nach Anzahl der Phosphat-Reste spricht man von Mono-, Di- und Triphosphaten. Aus der zentralen Bedeutung der Nukleotide ergibt sich die gleiche Bedeutung für die entsprechenden Nukleoside, da sie als Baustein der Nukleotide in diese umgewandelt werden können.

Die Nukleoside stehen durch Abspaltung der letzten Phosphatgruppe in den Nukleotiden mittelsHydrolyse, mithilfe vonNukleotidase-Enzymen in allen Lebewesen zur Verfügung. Weiterhin kann Inosin aus Adenosin mittels derAMP-Desaminase oder derGuanin-Desaminase synthetisiert werden. Xanthosin ist entsprechend nicht nur durch Hydrolyse von XMP erhältlich, sondern auch aus Guanosin mittels derGuanosin-Desaminase.

Der Abbau erfolgt überNukleosidasen zurNukleobase und bei Purinen überXanthin zurHarnsäure bzw. bei Pyrimidinen zumAlanin oder zur2-Aminobuttersäure.

Nukleosid-Analoga

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Hauptartikel:Nukleosid-Analogon

Nukleosid-Analoga spielen vor allem in derantiretroviralen Therapie eine große Rolle. Eine Reihe modernerVirostatika enthalten diese Substanzen. Wohl am besten bekannt ist der WirkstoffAciclovir, der häufig gegenHerpes-simplex-Viren (HSV-1 und -2) eingesetzt wird. Weiterhin verbreitet istGanciclovir, das genau wie Aciclovir einGuanosin-Analogon ist, und spezifisch die Replikation vonCMV unterdrückt. Ein weiteres wichtiges Einsatzgebiet ist die Krebstherapie. So werden 5-Fluorouracil undCytarabin alsZytostatika eingesetzt.

Einzelnachweise

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  1. Löffler, Petrides, Heinrich:Biochemie und Pathobiochemie. 8. Auflage. Springer, Heidelberg 2007,ISBN 978-3-540-32680-9.
  2. Patrick A. Limbach, Pamela F. Crain, James A. McCloskey: „Summary: the modified nucleosides of RNA“,Nucleic Acids Research,1994,22 (12), S. 2183–2196 (doi:10.1093/nar/22.12.2183,PMC 523672 (freier Volltext),PMID 7518580).
  3. Melanie Ehrlich, Miguel A. Gama-Sosa, Laura H. Carreira, Lars G. Ljungdahl, Kenneth C. Kuo, Charles W. Gehrke: „DNA methylation in thermophilic bacteria: N4-methylcytosine, 5-methylcytosine, and N6-methyladenine“,Nucleic Acids Research,1985,13 (4), S. 1399–1412 (doi:10.1093/nar/13.4.1399,PMC 341080 (freier Volltext),PMID 4000939).

Weblinks

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Commons: Nukleoside – Sammlung von Bildern, Videos und Audiodateien
Normdaten (Sachbegriff):GND:4133402-4(lobid,OGND,AKS)
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