| mzXML | |
|---|---|
| Dateiendung: | .mzXML |
| Entwickelt von: | Seattle Proteom Center |
| Aktuelle Version | 3.2[1] (2010-12-08) |
| Erweitert zu: | mzML |
mzXML ist einXML-basiertes Dateiformat in derMassenspektrometrie. Es handelt sich um einoffenes Format, das herstellerunabhängig ist. Metadaten zu den verwendeten Instrumenten werden eingebettet. Unterstützt wird Massenspektrometrie (MS),Tandem-Massenspektrometrie (MS/MS) oder (MSn), aber auch Chromatografie mit Massenspektrometrie-Kopplung oderMALDI-TOF MS. Die unterstützenden Werkzeuge wurden unter einerOpen-Source-Lizenz veröffentlicht. Um beiGleitkommazahlen die Präzision zu erhalten, wird dasMasse-zu-Ladung-Verhältnis und die Intensität inbase64 kodiert und in das XML integriert. Die Position jedes Scans wird indiziert, was einen bei größeren Datensätzen deutlich leistungsfähigerenwahlweisen Dateizugriff ermöglicht.[2]
Von anderen Forschungsgruppen wurde kritisiert, dass mzXML nicht dasRohdatenformat darstellt und auch keine Messdaten aufnehmen kann. mzXML sei ungeeignet für Zulassungseinreichungen, ist nicht für die Datenauswertung optimiert und bilde den Aufbau desExperiments nicht ab.[3] 2008 wurde das NachfolgeformatmzML vorgestellt, welches die Datenformate mzXML undmzData zusammenführte.[4]