EcoRI
Bändermodell mit DNA nachPDB 1QPS
Vorhandene Strukturdaten:1ckq,1cl8,1eri,1qc9,1qps,1qrh,1qri,2oxv
Masse/LängePrimärstruktur	276 Aminosäuren
Sekundär- bisQuartärstruktur	Homodimer
Kofaktor	2 Mg2+
Bezeichner
Externe IDs	UniProtP00642
Enzymklassifikation
EC, Kategorie	3.1.21.4, Restriktionsenzym
Reaktionsart	Hydrolyse
Substrat	GAATTC (dDNA)
Vorkommen
Homologie-Familie	ECOR1
ÜbergeordnetesTaxon	Proteobakterien

EcoRI ist einEnzym aus der Familie derNukleasen. Es war die erste NukleaseI aus dem StammR vonEscherichiacoli. Es findet insbesondere in derMolekularbiologie Anwendung alsRestriktionsenzym. Das Enzym besteht aus einemHomodimer und schneidet doppelsträngigeDNA innerhalb derpalindromischen Erkennungssequenz unter Bildung eines 5'-Überhangs wie folgt:

5'-GAATTC-3'3'-CTTAAG-5'

5'-G       AATTC-3'3'-CTTAA       G-5'

Diese Ausbildung eines 4-Basen-Überhangs („sticky ends“) wird in der Molekularbiologie bei der erleichtertenLigation von DNA-Fragmenten ausgenutzt. Unter bestimmten Bedingungen zeigt EcoRI eine verminderte Selektivität für die Erkennungssequenz (Star-Aktivität).

• REBASE: EcoRI

• Nuklease